Protein–RNA interactions for Protein: A0N8N6

Trav12-2, T cell receptor alpha variable 12-2 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trav12-2A0N8N6 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trav12-2A0N8N6 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trav12-2A0N8N6 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Trav12-2A0N8N6 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Trav12-2A0N8N6 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trav12-2A0N8N6 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trav12-2A0N8N6 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trav12-2A0N8N6 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trav12-2A0N8N6 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trav12-2A0N8N6 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trav12-2A0N8N6 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trav12-2A0N8N6 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trav12-2A0N8N6 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trav12-2A0N8N6 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trav12-2A0N8N6 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trav12-2A0N8N6 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trav12-2A0N8N6 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trav12-2A0N8N6 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Trav12-2A0N8N6 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trav12-2A0N8N6 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trav12-2A0N8N6 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trav12-2A0N8N6 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trav12-2A0N8N6 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trav12-2A0N8N6 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trav12-2A0N8N6 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Trav12-2A0N8N6 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Trav12-2A0N8N6 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Trav12-2A0N8N6 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Trav12-2A0N8N6 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trav12-2A0N8N6 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trav12-2A0N8N6 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Trav12-2A0N8N6 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trav12-2A0N8N6 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trav12-2A0N8N6 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trav12-2A0N8N6 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trav12-2A0N8N6 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trav12-2A0N8N6 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trav12-2A0N8N6 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trav12-2A0N8N6 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trav12-2A0N8N6 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trav12-2A0N8N6 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trav12-2A0N8N6 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trav12-2A0N8N6 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Trav12-2A0N8N6 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Trav12-2A0N8N6 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Trav12-2A0N8N6 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Trav12-2A0N8N6 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Trav12-2A0N8N6 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Trav12-2A0N8N6 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Trav12-2A0N8N6 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Trav12-2A0N8N6 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Trav12-2A0N8N6 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Trav12-2A0N8N6 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Trav12-2A0N8N6 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Trav12-2A0N8N6 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Trav12-2A0N8N6 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Trav12-2A0N8N6 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Trav12-2A0N8N6 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Trav12-2A0N8N6 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Trav12-2A0N8N6 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Trav12-2A0N8N6 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Trav12-2A0N8N6 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Trav12-2A0N8N6 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Trav12-2A0N8N6 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Trav12-2A0N8N6 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Trav12-2A0N8N6 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Trav12-2A0N8N6 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Trav12-2A0N8N6 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Trav12-2A0N8N6 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Trav12-2A0N8N6 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Trav12-2A0N8N6 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Trav12-2A0N8N6 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Trav12-2A0N8N6 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Trav12-2A0N8N6 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Trav12-2A0N8N6 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Trav12-2A0N8N6 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Trav12-2A0N8N6 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Trav12-2A0N8N6 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Trav12-2A0N8N6 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Trav12-2A0N8N6 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Trav12-2A0N8N6 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Trav12-2A0N8N6 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Trav12-2A0N8N6 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Trav12-2A0N8N6 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Trav12-2A0N8N6 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Trav12-2A0N8N6 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Trav12-2A0N8N6 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Trav12-2A0N8N6 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Trav12-2A0N8N6 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Trav12-2A0N8N6 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Trav12-2A0N8N6 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Trav12-2A0N8N6 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Trav12-2A0N8N6 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Trav12-2A0N8N6 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Trav12-2A0N8N6 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Trav12-2A0N8N6 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Trav12-2A0N8N6 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Trav12-2A0N8N6 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Trav12-2A0N8N6 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Trav12-2A0N8N6 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms