Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RP08

1700028J19Rik, RIKEN cDNA 1700028J19 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
1700028J19RikA0A0U1RP08 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
1700028J19RikA0A0U1RP08 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
1700028J19RikA0A0U1RP08 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
1700028J19RikA0A0U1RP08 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
1700028J19RikA0A0U1RP08 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
1700028J19RikA0A0U1RP08 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
1700028J19RikA0A0U1RP08 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
1700028J19RikA0A0U1RP08 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
1700028J19RikA0A0U1RP08 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
1700028J19RikA0A0U1RP08 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
1700028J19RikA0A0U1RP08 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
1700028J19RikA0A0U1RP08 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
1700028J19RikA0A0U1RP08 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
1700028J19RikA0A0U1RP08 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
1700028J19RikA0A0U1RP08 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
1700028J19RikA0A0U1RP08 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
1700028J19RikA0A0U1RP08 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
1700028J19RikA0A0U1RP08 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
1700028J19RikA0A0U1RP08 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
1700028J19RikA0A0U1RP08 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
1700028J19RikA0A0U1RP08 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
1700028J19RikA0A0U1RP08 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
1700028J19RikA0A0U1RP08 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
1700028J19RikA0A0U1RP08 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
1700028J19RikA0A0U1RP08 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
1700028J19RikA0A0U1RP08 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
1700028J19RikA0A0U1RP08 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
1700028J19RikA0A0U1RP08 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
1700028J19RikA0A0U1RP08 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
1700028J19RikA0A0U1RP08 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
1700028J19RikA0A0U1RP08 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
1700028J19RikA0A0U1RP08 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
1700028J19RikA0A0U1RP08 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
1700028J19RikA0A0U1RP08 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
1700028J19RikA0A0U1RP08 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
1700028J19RikA0A0U1RP08 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
1700028J19RikA0A0U1RP08 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
1700028J19RikA0A0U1RP08 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
1700028J19RikA0A0U1RP08 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
1700028J19RikA0A0U1RP08 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
1700028J19RikA0A0U1RP08 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
1700028J19RikA0A0U1RP08 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
1700028J19RikA0A0U1RP08 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
1700028J19RikA0A0U1RP08 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
1700028J19RikA0A0U1RP08 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
1700028J19RikA0A0U1RP08 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
1700028J19RikA0A0U1RP08 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
1700028J19RikA0A0U1RP08 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
1700028J19RikA0A0U1RP08 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
1700028J19RikA0A0U1RP08 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
1700028J19RikA0A0U1RP08 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
1700028J19RikA0A0U1RP08 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
1700028J19RikA0A0U1RP08 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
1700028J19RikA0A0U1RP08 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
1700028J19RikA0A0U1RP08 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
1700028J19RikA0A0U1RP08 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
1700028J19RikA0A0U1RP08 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
1700028J19RikA0A0U1RP08 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
1700028J19RikA0A0U1RP08 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
1700028J19RikA0A0U1RP08 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
1700028J19RikA0A0U1RP08 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
1700028J19RikA0A0U1RP08 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
1700028J19RikA0A0U1RP08 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
1700028J19RikA0A0U1RP08 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
1700028J19RikA0A0U1RP08 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
1700028J19RikA0A0U1RP08 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
1700028J19RikA0A0U1RP08 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms