Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WRV1

Vmn1r82, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r82A0A087WRV1 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Vmn1r82A0A087WRV1 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Vmn1r82A0A087WRV1 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Vmn1r82A0A087WRV1 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Vmn1r82A0A087WRV1 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Vmn1r82A0A087WRV1 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Vmn1r82A0A087WRV1 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Vmn1r82A0A087WRV1 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
Vmn1r82A0A087WRV1 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Vmn1r82A0A087WRV1 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Vmn1r82A0A087WRV1 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Vmn1r82A0A087WRV1 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Vmn1r82A0A087WRV1 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Vmn1r82A0A087WRV1 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Vmn1r82A0A087WRV1 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Vmn1r82A0A087WRV1 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Vmn1r82A0A087WRV1 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Vmn1r82A0A087WRV1 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Vmn1r82A0A087WRV1 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Vmn1r82A0A087WRV1 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Vmn1r82A0A087WRV1 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Vmn1r82A0A087WRV1 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Vmn1r82A0A087WRV1 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Vmn1r82A0A087WRV1 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Vmn1r82A0A087WRV1 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Vmn1r82A0A087WRV1 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Vmn1r82A0A087WRV1 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Vmn1r82A0A087WRV1 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Vmn1r82A0A087WRV1 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Vmn1r82A0A087WRV1 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Vmn1r82A0A087WRV1 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Vmn1r82A0A087WRV1 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Vmn1r82A0A087WRV1 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Vmn1r82A0A087WRV1 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Vmn1r82A0A087WRV1 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Vmn1r82A0A087WRV1 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Vmn1r82A0A087WRV1 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Vmn1r82A0A087WRV1 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Vmn1r82A0A087WRV1 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Vmn1r82A0A087WRV1 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Vmn1r82A0A087WRV1 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Vmn1r82A0A087WRV1 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Vmn1r82A0A087WRV1 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Vmn1r82A0A087WRV1 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Vmn1r82A0A087WRV1 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Vmn1r82A0A087WRV1 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Vmn1r82A0A087WRV1 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Vmn1r82A0A087WRV1 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Vmn1r82A0A087WRV1 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Vmn1r82A0A087WRV1 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Vmn1r82A0A087WRV1 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Vmn1r82A0A087WRV1 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Vmn1r82A0A087WRV1 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Vmn1r82A0A087WRV1 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Vmn1r82A0A087WRV1 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Vmn1r82A0A087WRV1 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Vmn1r82A0A087WRV1 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Vmn1r82A0A087WRV1 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Vmn1r82A0A087WRV1 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Vmn1r82A0A087WRV1 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Vmn1r82A0A087WRV1 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Vmn1r82A0A087WRV1 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Vmn1r82A0A087WRV1 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Vmn1r82A0A087WRV1 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Vmn1r82A0A087WRV1 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Vmn1r82A0A087WRV1 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Vmn1r82A0A087WRV1 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Vmn1r82A0A087WRV1 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Vmn1r82A0A087WRV1 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Vmn1r82A0A087WRV1 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Vmn1r82A0A087WRV1 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Vmn1r82A0A087WRV1 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Vmn1r82A0A087WRV1 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Vmn1r82A0A087WRV1 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Vmn1r82A0A087WRV1 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Vmn1r82A0A087WRV1 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Vmn1r82A0A087WRV1 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Vmn1r82A0A087WRV1 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Vmn1r82A0A087WRV1 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Vmn1r82A0A087WRV1 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Vmn1r82A0A087WRV1 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Vmn1r82A0A087WRV1 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Vmn1r82A0A087WRV1 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Vmn1r82A0A087WRV1 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Vmn1r82A0A087WRV1 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Vmn1r82A0A087WRV1 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Vmn1r82A0A087WRV1 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Vmn1r82A0A087WRV1 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Vmn1r82A0A087WRV1 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Vmn1r82A0A087WRV1 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Vmn1r82A0A087WRV1 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Vmn1r82A0A087WRV1 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Vmn1r82A0A087WRV1 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Vmn1r82A0A087WRV1 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Vmn1r82A0A087WRV1 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Vmn1r82A0A087WRV1 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Vmn1r82A0A087WRV1 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Vmn1r82A0A087WRV1 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Vmn1r82A0A087WRV1 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Vmn1r82A0A087WRV1 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms