Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKE5

TNIK, TRAF2 and NCK-interacting protein kinase, humanhuman

Predictions only

Length 1,360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNIKQ9UKE5 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
TNIKQ9UKE5 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
TNIKQ9UKE5 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
TNIKQ9UKE5 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
TNIKQ9UKE5 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
TNIKQ9UKE5 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
TNIKQ9UKE5 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
TNIKQ9UKE5 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC32.64■■■□□ 2.82
TNIKQ9UKE5 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
TNIKQ9UKE5 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC32.64■■■□□ 2.82
TNIKQ9UKE5 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
TNIKQ9UKE5 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
TNIKQ9UKE5 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
TNIKQ9UKE5 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
TNIKQ9UKE5 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
TNIKQ9UKE5 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.81
TNIKQ9UKE5 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC32.63■■■□□ 2.81
TNIKQ9UKE5 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.63■■■□□ 2.81
TNIKQ9UKE5 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC32.63■■■□□ 2.81
TNIKQ9UKE5 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC32.63■■■□□ 2.81
TNIKQ9UKE5 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC32.63■■■□□ 2.81
TNIKQ9UKE5 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
TNIKQ9UKE5 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.63■■■□□ 2.81
TNIKQ9UKE5 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
TNIKQ9UKE5 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
TNIKQ9UKE5 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
TNIKQ9UKE5 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
TNIKQ9UKE5 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
TNIKQ9UKE5 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC32.62■■■□□ 2.81
TNIKQ9UKE5 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
TNIKQ9UKE5 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
TNIKQ9UKE5 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
TNIKQ9UKE5 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
TNIKQ9UKE5 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
TNIKQ9UKE5 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC32.61■■■□□ 2.81
TNIKQ9UKE5 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC32.61■■■□□ 2.81
TNIKQ9UKE5 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC32.61■■■□□ 2.81
TNIKQ9UKE5 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
TNIKQ9UKE5 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
TNIKQ9UKE5 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
TNIKQ9UKE5 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
TNIKQ9UKE5 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC32.6■■■□□ 2.81
TNIKQ9UKE5 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
TNIKQ9UKE5 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC32.6■■■□□ 2.81
TNIKQ9UKE5 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC32.6■■■□□ 2.81
TNIKQ9UKE5 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
TNIKQ9UKE5 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
TNIKQ9UKE5 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
TNIKQ9UKE5 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
TNIKQ9UKE5 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
TNIKQ9UKE5 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
TNIKQ9UKE5 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC32.59■■■□□ 2.81
TNIKQ9UKE5 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
TNIKQ9UKE5 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
TNIKQ9UKE5 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC32.59■■■□□ 2.81
TNIKQ9UKE5 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
TNIKQ9UKE5 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
TNIKQ9UKE5 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
TNIKQ9UKE5 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
TNIKQ9UKE5 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC32.59■■■□□ 2.81
TNIKQ9UKE5 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
TNIKQ9UKE5 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC32.58■■■□□ 2.81
TNIKQ9UKE5 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
TNIKQ9UKE5 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
TNIKQ9UKE5 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC32.58■■■□□ 2.81
TNIKQ9UKE5 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
TNIKQ9UKE5 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC32.58■■■□□ 2.81
TNIKQ9UKE5 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC32.58■■■□□ 2.81
TNIKQ9UKE5 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
TNIKQ9UKE5 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
TNIKQ9UKE5 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
TNIKQ9UKE5 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
TNIKQ9UKE5 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC32.58■■■□□ 2.81
TNIKQ9UKE5 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
TNIKQ9UKE5 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC32.58■■■□□ 2.81
TNIKQ9UKE5 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.81
TNIKQ9UKE5 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.8
TNIKQ9UKE5 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
TNIKQ9UKE5 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
TNIKQ9UKE5 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
TNIKQ9UKE5 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.8
TNIKQ9UKE5 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.8
TNIKQ9UKE5 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC32.57■■■□□ 2.8
TNIKQ9UKE5 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC32.57■■■□□ 2.8
TNIKQ9UKE5 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.8
TNIKQ9UKE5 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC32.57■■■□□ 2.8
TNIKQ9UKE5 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.8
TNIKQ9UKE5 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC32.57■■■□□ 2.8
TNIKQ9UKE5 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.8
TNIKQ9UKE5 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
TNIKQ9UKE5 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
TNIKQ9UKE5 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
TNIKQ9UKE5 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
TNIKQ9UKE5 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
TNIKQ9UKE5 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
TNIKQ9UKE5 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
TNIKQ9UKE5 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
TNIKQ9UKE5 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
TNIKQ9UKE5 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
TNIKQ9UKE5 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms