Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYK9

Pnck, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type 1B, mousemouse

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PnckQ9QYK9 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PnckQ9QYK9 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PnckQ9QYK9 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PnckQ9QYK9 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PnckQ9QYK9 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PnckQ9QYK9 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PnckQ9QYK9 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PnckQ9QYK9 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PnckQ9QYK9 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PnckQ9QYK9 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PnckQ9QYK9 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PnckQ9QYK9 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PnckQ9QYK9 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PnckQ9QYK9 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PnckQ9QYK9 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PnckQ9QYK9 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PnckQ9QYK9 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PnckQ9QYK9 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PnckQ9QYK9 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
PnckQ9QYK9 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PnckQ9QYK9 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PnckQ9QYK9 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PnckQ9QYK9 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PnckQ9QYK9 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PnckQ9QYK9 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PnckQ9QYK9 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PnckQ9QYK9 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PnckQ9QYK9 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PnckQ9QYK9 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PnckQ9QYK9 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PnckQ9QYK9 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PnckQ9QYK9 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PnckQ9QYK9 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PnckQ9QYK9 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PnckQ9QYK9 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PnckQ9QYK9 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PnckQ9QYK9 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PnckQ9QYK9 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PnckQ9QYK9 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PnckQ9QYK9 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PnckQ9QYK9 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PnckQ9QYK9 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PnckQ9QYK9 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PnckQ9QYK9 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PnckQ9QYK9 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PnckQ9QYK9 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PnckQ9QYK9 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PnckQ9QYK9 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PnckQ9QYK9 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PnckQ9QYK9 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PnckQ9QYK9 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PnckQ9QYK9 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PnckQ9QYK9 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PnckQ9QYK9 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PnckQ9QYK9 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PnckQ9QYK9 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PnckQ9QYK9 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PnckQ9QYK9 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PnckQ9QYK9 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PnckQ9QYK9 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PnckQ9QYK9 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PnckQ9QYK9 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PnckQ9QYK9 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PnckQ9QYK9 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PnckQ9QYK9 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PnckQ9QYK9 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PnckQ9QYK9 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PnckQ9QYK9 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PnckQ9QYK9 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PnckQ9QYK9 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PnckQ9QYK9 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PnckQ9QYK9 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PnckQ9QYK9 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PnckQ9QYK9 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PnckQ9QYK9 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PnckQ9QYK9 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PnckQ9QYK9 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PnckQ9QYK9 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PnckQ9QYK9 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PnckQ9QYK9 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PnckQ9QYK9 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PnckQ9QYK9 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PnckQ9QYK9 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PnckQ9QYK9 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PnckQ9QYK9 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PnckQ9QYK9 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PnckQ9QYK9 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
PnckQ9QYK9 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
PnckQ9QYK9 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.3
PnckQ9QYK9 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PnckQ9QYK9 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PnckQ9QYK9 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PnckQ9QYK9 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PnckQ9QYK9 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PnckQ9QYK9 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PnckQ9QYK9 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PnckQ9QYK9 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PnckQ9QYK9 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PnckQ9QYK9 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PnckQ9QYK9 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.6 ms