Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDU3

Apol9a, Apol9a protein, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apol9aQ8VDU3 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Apol9aQ8VDU3 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Apol9aQ8VDU3 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Apol9aQ8VDU3 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Apol9aQ8VDU3 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Apol9aQ8VDU3 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Apol9aQ8VDU3 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Apol9aQ8VDU3 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Apol9aQ8VDU3 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Apol9aQ8VDU3 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Apol9aQ8VDU3 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Apol9aQ8VDU3 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Apol9aQ8VDU3 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Apol9aQ8VDU3 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Apol9aQ8VDU3 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Apol9aQ8VDU3 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Apol9aQ8VDU3 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Apol9aQ8VDU3 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Apol9aQ8VDU3 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Apol9aQ8VDU3 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Apol9aQ8VDU3 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Apol9aQ8VDU3 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Apol9aQ8VDU3 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Apol9aQ8VDU3 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Apol9aQ8VDU3 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Apol9aQ8VDU3 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Apol9aQ8VDU3 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Apol9aQ8VDU3 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Apol9aQ8VDU3 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Apol9aQ8VDU3 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Apol9aQ8VDU3 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Apol9aQ8VDU3 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Apol9aQ8VDU3 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Apol9aQ8VDU3 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Apol9aQ8VDU3 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Apol9aQ8VDU3 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Apol9aQ8VDU3 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Apol9aQ8VDU3 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Apol9aQ8VDU3 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Apol9aQ8VDU3 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Apol9aQ8VDU3 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Apol9aQ8VDU3 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Apol9aQ8VDU3 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Apol9aQ8VDU3 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Apol9aQ8VDU3 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Apol9aQ8VDU3 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Apol9aQ8VDU3 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Apol9aQ8VDU3 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Apol9aQ8VDU3 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Apol9aQ8VDU3 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Apol9aQ8VDU3 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Apol9aQ8VDU3 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Apol9aQ8VDU3 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Apol9aQ8VDU3 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Apol9aQ8VDU3 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Apol9aQ8VDU3 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Apol9aQ8VDU3 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Apol9aQ8VDU3 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Apol9aQ8VDU3 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Apol9aQ8VDU3 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Apol9aQ8VDU3 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Apol9aQ8VDU3 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Apol9aQ8VDU3 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Apol9aQ8VDU3 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Apol9aQ8VDU3 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Apol9aQ8VDU3 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Apol9aQ8VDU3 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Apol9aQ8VDU3 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Apol9aQ8VDU3 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Apol9aQ8VDU3 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Apol9aQ8VDU3 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Apol9aQ8VDU3 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Apol9aQ8VDU3 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Apol9aQ8VDU3 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Apol9aQ8VDU3 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Apol9aQ8VDU3 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Apol9aQ8VDU3 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Apol9aQ8VDU3 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Apol9aQ8VDU3 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Apol9aQ8VDU3 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Apol9aQ8VDU3 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Apol9aQ8VDU3 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Apol9aQ8VDU3 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Apol9aQ8VDU3 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Apol9aQ8VDU3 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Apol9aQ8VDU3 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Apol9aQ8VDU3 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Apol9aQ8VDU3 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Apol9aQ8VDU3 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Apol9aQ8VDU3 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Apol9aQ8VDU3 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Apol9aQ8VDU3 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Apol9aQ8VDU3 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Apol9aQ8VDU3 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Apol9aQ8VDU3 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Apol9aQ8VDU3 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Apol9aQ8VDU3 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Apol9aQ8VDU3 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Apol9aQ8VDU3 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Apol9aQ8VDU3 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.5 ms