Protein–RNA interactions for Protein: Q8BPC6

Probable isocitrate dehydrogenase [NAD] gamma 2, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8BPC6 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q8BPC6 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q8BPC6 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q8BPC6 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Q8BPC6 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Q8BPC6 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q8BPC6 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q8BPC6 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q8BPC6 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q8BPC6 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q8BPC6 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q8BPC6 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q8BPC6 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q8BPC6 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q8BPC6 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q8BPC6 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q8BPC6 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q8BPC6 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q8BPC6 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q8BPC6 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q8BPC6 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q8BPC6 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q8BPC6 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q8BPC6 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Q8BPC6 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q8BPC6 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q8BPC6 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Q8BPC6 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q8BPC6 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q8BPC6 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q8BPC6 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q8BPC6 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q8BPC6 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q8BPC6 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Q8BPC6 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q8BPC6 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q8BPC6 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q8BPC6 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q8BPC6 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q8BPC6 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q8BPC6 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q8BPC6 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Q8BPC6 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q8BPC6 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q8BPC6 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q8BPC6 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q8BPC6 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q8BPC6 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q8BPC6 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q8BPC6 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q8BPC6 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q8BPC6 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q8BPC6 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q8BPC6 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Q8BPC6 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q8BPC6 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q8BPC6 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q8BPC6 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q8BPC6 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q8BPC6 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q8BPC6 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q8BPC6 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q8BPC6 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q8BPC6 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q8BPC6 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q8BPC6 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q8BPC6 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q8BPC6 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Q8BPC6 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q8BPC6 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q8BPC6 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q8BPC6 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q8BPC6 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q8BPC6 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q8BPC6 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q8BPC6 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q8BPC6 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q8BPC6 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q8BPC6 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q8BPC6 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Q8BPC6 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q8BPC6 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q8BPC6 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q8BPC6 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q8BPC6 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q8BPC6 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q8BPC6 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q8BPC6 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q8BPC6 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q8BPC6 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q8BPC6 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q8BPC6 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q8BPC6 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q8BPC6 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q8BPC6 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q8BPC6 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q8BPC6 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Q8BPC6 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q8BPC6 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q8BPC6 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
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