Protein–RNA interactions for Protein: P15409

Rho, Rhodopsin, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhoP15409 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
RhoP15409 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RhoP15409 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RhoP15409 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RhoP15409 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RhoP15409 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
RhoP15409 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RhoP15409 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RhoP15409 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RhoP15409 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
RhoP15409 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RhoP15409 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RhoP15409 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RhoP15409 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RhoP15409 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RhoP15409 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
RhoP15409 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RhoP15409 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RhoP15409 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
RhoP15409 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RhoP15409 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RhoP15409 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RhoP15409 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RhoP15409 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RhoP15409 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RhoP15409 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RhoP15409 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RhoP15409 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RhoP15409 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RhoP15409 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RhoP15409 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RhoP15409 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RhoP15409 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RhoP15409 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RhoP15409 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RhoP15409 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RhoP15409 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RhoP15409 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RhoP15409 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RhoP15409 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RhoP15409 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RhoP15409 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RhoP15409 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RhoP15409 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RhoP15409 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RhoP15409 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RhoP15409 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RhoP15409 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RhoP15409 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RhoP15409 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
RhoP15409 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RhoP15409 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RhoP15409 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RhoP15409 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RhoP15409 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RhoP15409 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RhoP15409 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RhoP15409 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RhoP15409 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RhoP15409 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RhoP15409 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RhoP15409 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
RhoP15409 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RhoP15409 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RhoP15409 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RhoP15409 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RhoP15409 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RhoP15409 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RhoP15409 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RhoP15409 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RhoP15409 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RhoP15409 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RhoP15409 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RhoP15409 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RhoP15409 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RhoP15409 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RhoP15409 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RhoP15409 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RhoP15409 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RhoP15409 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
RhoP15409 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RhoP15409 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RhoP15409 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RhoP15409 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RhoP15409 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RhoP15409 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RhoP15409 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RhoP15409 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RhoP15409 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
RhoP15409 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RhoP15409 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
RhoP15409 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RhoP15409 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RhoP15409 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RhoP15409 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RhoP15409 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RhoP15409 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RhoP15409 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RhoP15409 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RhoP15409 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.2 ms