Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WPV9

1700019A02Rik, RIKEN cDNA 1700019A02 gene, mousemouse

Predictions only

Length 146 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700019A02RikA0A087WPV9 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
1700019A02RikA0A087WPV9 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
1700019A02RikA0A087WPV9 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
1700019A02RikA0A087WPV9 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
1700019A02RikA0A087WPV9 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
1700019A02RikA0A087WPV9 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
1700019A02RikA0A087WPV9 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
1700019A02RikA0A087WPV9 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
1700019A02RikA0A087WPV9 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
1700019A02RikA0A087WPV9 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
1700019A02RikA0A087WPV9 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
1700019A02RikA0A087WPV9 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
1700019A02RikA0A087WPV9 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
1700019A02RikA0A087WPV9 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
1700019A02RikA0A087WPV9 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
1700019A02RikA0A087WPV9 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
1700019A02RikA0A087WPV9 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
1700019A02RikA0A087WPV9 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
1700019A02RikA0A087WPV9 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
1700019A02RikA0A087WPV9 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
1700019A02RikA0A087WPV9 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
1700019A02RikA0A087WPV9 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
1700019A02RikA0A087WPV9 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
1700019A02RikA0A087WPV9 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
1700019A02RikA0A087WPV9 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
1700019A02RikA0A087WPV9 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
1700019A02RikA0A087WPV9 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
1700019A02RikA0A087WPV9 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
1700019A02RikA0A087WPV9 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
1700019A02RikA0A087WPV9 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
1700019A02RikA0A087WPV9 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
1700019A02RikA0A087WPV9 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
1700019A02RikA0A087WPV9 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
1700019A02RikA0A087WPV9 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
1700019A02RikA0A087WPV9 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
1700019A02RikA0A087WPV9 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
1700019A02RikA0A087WPV9 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
1700019A02RikA0A087WPV9 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
1700019A02RikA0A087WPV9 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
1700019A02RikA0A087WPV9 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
1700019A02RikA0A087WPV9 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
1700019A02RikA0A087WPV9 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
1700019A02RikA0A087WPV9 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
1700019A02RikA0A087WPV9 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
1700019A02RikA0A087WPV9 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
1700019A02RikA0A087WPV9 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
1700019A02RikA0A087WPV9 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
1700019A02RikA0A087WPV9 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
1700019A02RikA0A087WPV9 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
1700019A02RikA0A087WPV9 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
1700019A02RikA0A087WPV9 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
1700019A02RikA0A087WPV9 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
1700019A02RikA0A087WPV9 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
1700019A02RikA0A087WPV9 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
1700019A02RikA0A087WPV9 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
1700019A02RikA0A087WPV9 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
1700019A02RikA0A087WPV9 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
1700019A02RikA0A087WPV9 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
1700019A02RikA0A087WPV9 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
1700019A02RikA0A087WPV9 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
1700019A02RikA0A087WPV9 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
1700019A02RikA0A087WPV9 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
1700019A02RikA0A087WPV9 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
1700019A02RikA0A087WPV9 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
1700019A02RikA0A087WPV9 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
1700019A02RikA0A087WPV9 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
1700019A02RikA0A087WPV9 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
1700019A02RikA0A087WPV9 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
1700019A02RikA0A087WPV9 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
1700019A02RikA0A087WPV9 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
1700019A02RikA0A087WPV9 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
1700019A02RikA0A087WPV9 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
1700019A02RikA0A087WPV9 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
1700019A02RikA0A087WPV9 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
1700019A02RikA0A087WPV9 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
1700019A02RikA0A087WPV9 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
1700019A02RikA0A087WPV9 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
1700019A02RikA0A087WPV9 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
1700019A02RikA0A087WPV9 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
1700019A02RikA0A087WPV9 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
1700019A02RikA0A087WPV9 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
1700019A02RikA0A087WPV9 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
1700019A02RikA0A087WPV9 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
1700019A02RikA0A087WPV9 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
1700019A02RikA0A087WPV9 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
1700019A02RikA0A087WPV9 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
1700019A02RikA0A087WPV9 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
1700019A02RikA0A087WPV9 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
1700019A02RikA0A087WPV9 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
1700019A02RikA0A087WPV9 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
1700019A02RikA0A087WPV9 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.1 ms