Protein–RNA interactions for Protein: Q9JK48

Sh3glb1, Endophilin-B1, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3glb1Q9JK48 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sh3glb1Q9JK48 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sh3glb1Q9JK48 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sh3glb1Q9JK48 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sh3glb1Q9JK48 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sh3glb1Q9JK48 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sh3glb1Q9JK48 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sh3glb1Q9JK48 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sh3glb1Q9JK48 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sh3glb1Q9JK48 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sh3glb1Q9JK48 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sh3glb1Q9JK48 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Sh3glb1Q9JK48 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sh3glb1Q9JK48 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sh3glb1Q9JK48 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sh3glb1Q9JK48 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sh3glb1Q9JK48 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sh3glb1Q9JK48 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sh3glb1Q9JK48 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sh3glb1Q9JK48 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sh3glb1Q9JK48 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sh3glb1Q9JK48 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sh3glb1Q9JK48 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sh3glb1Q9JK48 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sh3glb1Q9JK48 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sh3glb1Q9JK48 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sh3glb1Q9JK48 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sh3glb1Q9JK48 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sh3glb1Q9JK48 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sh3glb1Q9JK48 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sh3glb1Q9JK48 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sh3glb1Q9JK48 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sh3glb1Q9JK48 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sh3glb1Q9JK48 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sh3glb1Q9JK48 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sh3glb1Q9JK48 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sh3glb1Q9JK48 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sh3glb1Q9JK48 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sh3glb1Q9JK48 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sh3glb1Q9JK48 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sh3glb1Q9JK48 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sh3glb1Q9JK48 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sh3glb1Q9JK48 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sh3glb1Q9JK48 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sh3glb1Q9JK48 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Sh3glb1Q9JK48 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sh3glb1Q9JK48 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sh3glb1Q9JK48 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sh3glb1Q9JK48 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sh3glb1Q9JK48 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sh3glb1Q9JK48 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sh3glb1Q9JK48 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sh3glb1Q9JK48 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sh3glb1Q9JK48 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sh3glb1Q9JK48 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sh3glb1Q9JK48 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sh3glb1Q9JK48 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sh3glb1Q9JK48 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sh3glb1Q9JK48 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sh3glb1Q9JK48 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sh3glb1Q9JK48 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sh3glb1Q9JK48 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sh3glb1Q9JK48 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sh3glb1Q9JK48 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sh3glb1Q9JK48 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sh3glb1Q9JK48 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sh3glb1Q9JK48 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sh3glb1Q9JK48 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sh3glb1Q9JK48 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sh3glb1Q9JK48 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sh3glb1Q9JK48 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sh3glb1Q9JK48 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sh3glb1Q9JK48 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Sh3glb1Q9JK48 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sh3glb1Q9JK48 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sh3glb1Q9JK48 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sh3glb1Q9JK48 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sh3glb1Q9JK48 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sh3glb1Q9JK48 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Sh3glb1Q9JK48 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sh3glb1Q9JK48 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sh3glb1Q9JK48 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sh3glb1Q9JK48 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sh3glb1Q9JK48 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sh3glb1Q9JK48 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sh3glb1Q9JK48 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sh3glb1Q9JK48 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sh3glb1Q9JK48 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sh3glb1Q9JK48 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sh3glb1Q9JK48 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sh3glb1Q9JK48 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sh3glb1Q9JK48 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sh3glb1Q9JK48 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sh3glb1Q9JK48 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sh3glb1Q9JK48 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sh3glb1Q9JK48 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sh3glb1Q9JK48 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sh3glb1Q9JK48 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sh3glb1Q9JK48 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sh3glb1Q9JK48 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.7 ms