Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1D1

Tspan11, Tetraspanin-11, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan11Q9D1D1 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tspan11Q9D1D1 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tspan11Q9D1D1 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tspan11Q9D1D1 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tspan11Q9D1D1 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tspan11Q9D1D1 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Tspan11Q9D1D1 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tspan11Q9D1D1 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tspan11Q9D1D1 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tspan11Q9D1D1 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tspan11Q9D1D1 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tspan11Q9D1D1 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tspan11Q9D1D1 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tspan11Q9D1D1 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tspan11Q9D1D1 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tspan11Q9D1D1 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tspan11Q9D1D1 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tspan11Q9D1D1 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tspan11Q9D1D1 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tspan11Q9D1D1 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tspan11Q9D1D1 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tspan11Q9D1D1 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tspan11Q9D1D1 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tspan11Q9D1D1 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Tspan11Q9D1D1 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tspan11Q9D1D1 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tspan11Q9D1D1 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tspan11Q9D1D1 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tspan11Q9D1D1 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tspan11Q9D1D1 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tspan11Q9D1D1 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tspan11Q9D1D1 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Tspan11Q9D1D1 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Tspan11Q9D1D1 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Tspan11Q9D1D1 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Tspan11Q9D1D1 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tspan11Q9D1D1 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tspan11Q9D1D1 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Tspan11Q9D1D1 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tspan11Q9D1D1 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tspan11Q9D1D1 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tspan11Q9D1D1 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tspan11Q9D1D1 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tspan11Q9D1D1 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tspan11Q9D1D1 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Tspan11Q9D1D1 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tspan11Q9D1D1 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tspan11Q9D1D1 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tspan11Q9D1D1 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tspan11Q9D1D1 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tspan11Q9D1D1 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tspan11Q9D1D1 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tspan11Q9D1D1 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tspan11Q9D1D1 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tspan11Q9D1D1 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tspan11Q9D1D1 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tspan11Q9D1D1 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tspan11Q9D1D1 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tspan11Q9D1D1 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tspan11Q9D1D1 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tspan11Q9D1D1 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tspan11Q9D1D1 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tspan11Q9D1D1 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tspan11Q9D1D1 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tspan11Q9D1D1 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tspan11Q9D1D1 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tspan11Q9D1D1 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tspan11Q9D1D1 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tspan11Q9D1D1 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tspan11Q9D1D1 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tspan11Q9D1D1 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tspan11Q9D1D1 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Tspan11Q9D1D1 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tspan11Q9D1D1 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tspan11Q9D1D1 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tspan11Q9D1D1 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tspan11Q9D1D1 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tspan11Q9D1D1 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tspan11Q9D1D1 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Tspan11Q9D1D1 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tspan11Q9D1D1 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tspan11Q9D1D1 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tspan11Q9D1D1 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Tspan11Q9D1D1 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tspan11Q9D1D1 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tspan11Q9D1D1 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tspan11Q9D1D1 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tspan11Q9D1D1 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tspan11Q9D1D1 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tspan11Q9D1D1 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tspan11Q9D1D1 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tspan11Q9D1D1 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tspan11Q9D1D1 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tspan11Q9D1D1 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tspan11Q9D1D1 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tspan11Q9D1D1 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tspan11Q9D1D1 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tspan11Q9D1D1 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tspan11Q9D1D1 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tspan11Q9D1D1 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms