Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHX8

Nkx6-3, Homeobox protein Nkx-6.3, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx6-3Q3UHX8 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nkx6-3Q3UHX8 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nkx6-3Q3UHX8 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nkx6-3Q3UHX8 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nkx6-3Q3UHX8 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nkx6-3Q3UHX8 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nkx6-3Q3UHX8 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nkx6-3Q3UHX8 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nkx6-3Q3UHX8 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nkx6-3Q3UHX8 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nkx6-3Q3UHX8 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nkx6-3Q3UHX8 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nkx6-3Q3UHX8 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nkx6-3Q3UHX8 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nkx6-3Q3UHX8 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Nkx6-3Q3UHX8 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nkx6-3Q3UHX8 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nkx6-3Q3UHX8 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nkx6-3Q3UHX8 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nkx6-3Q3UHX8 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nkx6-3Q3UHX8 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nkx6-3Q3UHX8 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nkx6-3Q3UHX8 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nkx6-3Q3UHX8 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nkx6-3Q3UHX8 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nkx6-3Q3UHX8 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nkx6-3Q3UHX8 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nkx6-3Q3UHX8 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nkx6-3Q3UHX8 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nkx6-3Q3UHX8 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nkx6-3Q3UHX8 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nkx6-3Q3UHX8 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nkx6-3Q3UHX8 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nkx6-3Q3UHX8 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nkx6-3Q3UHX8 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nkx6-3Q3UHX8 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nkx6-3Q3UHX8 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Nkx6-3Q3UHX8 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nkx6-3Q3UHX8 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nkx6-3Q3UHX8 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nkx6-3Q3UHX8 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nkx6-3Q3UHX8 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nkx6-3Q3UHX8 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Nkx6-3Q3UHX8 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nkx6-3Q3UHX8 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nkx6-3Q3UHX8 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nkx6-3Q3UHX8 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nkx6-3Q3UHX8 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nkx6-3Q3UHX8 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Nkx6-3Q3UHX8 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nkx6-3Q3UHX8 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nkx6-3Q3UHX8 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nkx6-3Q3UHX8 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nkx6-3Q3UHX8 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nkx6-3Q3UHX8 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nkx6-3Q3UHX8 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nkx6-3Q3UHX8 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Nkx6-3Q3UHX8 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nkx6-3Q3UHX8 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nkx6-3Q3UHX8 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nkx6-3Q3UHX8 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nkx6-3Q3UHX8 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nkx6-3Q3UHX8 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nkx6-3Q3UHX8 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nkx6-3Q3UHX8 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Nkx6-3Q3UHX8 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nkx6-3Q3UHX8 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nkx6-3Q3UHX8 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nkx6-3Q3UHX8 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nkx6-3Q3UHX8 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nkx6-3Q3UHX8 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nkx6-3Q3UHX8 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nkx6-3Q3UHX8 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nkx6-3Q3UHX8 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nkx6-3Q3UHX8 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nkx6-3Q3UHX8 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nkx6-3Q3UHX8 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nkx6-3Q3UHX8 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nkx6-3Q3UHX8 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nkx6-3Q3UHX8 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nkx6-3Q3UHX8 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nkx6-3Q3UHX8 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nkx6-3Q3UHX8 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nkx6-3Q3UHX8 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Nkx6-3Q3UHX8 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nkx6-3Q3UHX8 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nkx6-3Q3UHX8 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nkx6-3Q3UHX8 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nkx6-3Q3UHX8 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nkx6-3Q3UHX8 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nkx6-3Q3UHX8 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nkx6-3Q3UHX8 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nkx6-3Q3UHX8 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nkx6-3Q3UHX8 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nkx6-3Q3UHX8 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nkx6-3Q3UHX8 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nkx6-3Q3UHX8 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nkx6-3Q3UHX8 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nkx6-3Q3UHX8 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nkx6-3Q3UHX8 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.4 ms