Protein–RNA interactions for Protein: Q04368

CSI1, Cop9 signalosome-interactor 1, yeastyeast

Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CSI1Q04368 YDR524W-CYDR524W-C 90 nt0.82□□□□□ -2.28
CSI1Q04368 ECM12YHR021W-A 456 nt0.82□□□□□ -2.28
CSI1Q04368 MCM10YIL150C 1716 nt0.81□□□□□ -2.28
CSI1Q04368 WAR1YML076C 2835 nt0.81□□□□□ -2.28
CSI1Q04368 RPS25BYLR333C 327 nt0.81□□□□□ -2.28
CSI1Q04368 YDR413CYDR413C 576 nt0.8□□□□□ -2.28
CSI1Q04368 YOR011W-AYOR011W-A 207 nt0.8□□□□□ -2.28
CSI1Q04368 YPL038W-AYPL038W-A 192 nt0.8□□□□□ -2.28
CSI1Q04368 YDR183C-AYDR183C-A 258 nt0.79□□□□□ -2.28
CSI1Q04368 YER097WYER097W 330 nt0.79□□□□□ -2.28
CSI1Q04368 YFL063WYFL063W 456 nt0.79□□□□□ -2.28
CSI1Q04368 YHL042WYHL042W 453 nt0.79□□□□□ -2.28
CSI1Q04368 YIR044CYIR044C 186 nt0.79□□□□□ -2.28
CSI1Q04368 YKL118WYKL118W 312 nt0.79□□□□□ -2.28
CSI1Q04368 COG8YML071C 1824 nt0.78□□□□□ -2.28
CSI1Q04368 snR60snR60 104 nt0.78□□□□□ -2.28
CSI1Q04368 YDL196WYDL196W 330 nt0.78□□□□□ -2.28
CSI1Q04368 YMR160WYMR160W 2451 nt0.77□□□□□ -2.29
CSI1Q04368 BFR2YDR299W 1605 nt0.77□□□□□ -2.29
CSI1Q04368 PTP2YOR208W 2253 nt0.77□□□□□ -2.29
CSI1Q04368 HTL1YCR020W-B 237 nt0.76□□□□□ -2.29
CSI1Q04368 ISD11YER048W-A 285 nt0.76□□□□□ -2.29
CSI1Q04368 OLI1Q0130 231 nt0.76□□□□□ -2.29
CSI1Q04368 SGF11YPL047W 300 nt0.76□□□□□ -2.29
CSI1Q04368 ASE1YOR058C 2658 nt0.75□□□□□ -2.29
CSI1Q04368 HMRA2YCR096C 360 nt0.75□□□□□ -2.29
CSI1Q04368 YFR012W-AYFR012W-A 87 nt0.75□□□□□ -2.29
CSI1Q04368 ALG13YGL047W 609 nt0.75□□□□□ -2.29
CSI1Q04368 YIL032CYIL032C 357 nt0.75□□□□□ -2.29
CSI1Q04368 YPR010C-AYPR010C-A 219 nt0.74□□□□□ -2.29
CSI1Q04368 Q0142Q0142 177 nt0.73□□□□□ -2.29
CSI1Q04368 YMR193C-AYMR193C-A 387 nt0.73□□□□□ -2.29
CSI1Q04368 YNL211CYNL211C 261 nt0.73□□□□□ -2.29
CSI1Q04368 VIK1YPL253C 1944 nt0.73□□□□□ -2.29
CSI1Q04368 YOR015WYOR015W 360 nt0.72□□□□□ -2.29
CSI1Q04368 STE5YDR103W 2754 nt0.72□□□□□ -2.29
CSI1Q04368 YDR354C-AYDR354C-A 144 nt0.71□□□□□ -2.3
CSI1Q04368 tF(GAA)BtF(GAA)B 73 nt0.71□□□□□ -2.3
CSI1Q04368 tF(GAA)FtF(GAA)F 73 nt0.71□□□□□ -2.3
CSI1Q04368 tF(GAA)GtF(GAA)G 73 nt0.71□□□□□ -2.3
CSI1Q04368 tF(GAA)H1tF(GAA)H1 73 nt0.71□□□□□ -2.3
CSI1Q04368 tF(GAA)H2tF(GAA)H2 73 nt0.71□□□□□ -2.3
CSI1Q04368 tF(GAA)MtF(GAA)M 73 nt0.71□□□□□ -2.3
CSI1Q04368 tF(GAA)P1tF(GAA)P1 73 nt0.71□□□□□ -2.3
CSI1Q04368 tF(GAA)P2tF(GAA)P2 73 nt0.71□□□□□ -2.3
CSI1Q04368 YGL149WYGL149W 306 nt0.71□□□□□ -2.3
CSI1Q04368 YKL136WYKL136W 399 nt0.7□□□□□ -2.3
CSI1Q04368 YOR218CYOR218C 420 nt0.7□□□□□ -2.3
CSI1Q04368 YPR159C-AYPR159C-A 102 nt0.7□□□□□ -2.3
CSI1Q04368 NOP9YJL010C 2001 nt0.69□□□□□ -2.3
CSI1Q04368 RPS27BYHR021C 249 nt0.69□□□□□ -2.3
CSI1Q04368 CSE2YNR010W 450 nt0.69□□□□□ -2.3
CSI1Q04368 YOR282WYOR282W 321 nt0.69□□□□□ -2.3
CSI1Q04368 YDL185C-AYDL185C-A 228 nt0.68□□□□□ -2.3
CSI1Q04368 YMR321CYMR321C 318 nt0.68□□□□□ -2.3
CSI1Q04368 IES4YOR189W 351 nt0.68□□□□□ -2.3
CSI1Q04368 QCR9YGR183C 201 nt0.67□□□□□ -2.3
CSI1Q04368 LTE1YAL024C 4308 nt0.66□□□□□ -2.3
CSI1Q04368 RAD61YDR014W 1944 nt0.66□□□□□ -2.3
CSI1Q04368 PMP1YCR024C-A 123 nt0.65□□□□□ -2.31
CSI1Q04368 YMR031W-AYMR031W-A 327 nt0.65□□□□□ -2.31
CSI1Q04368 YPL044CYPL044C 549 nt0.64□□□□□ -2.31
CSI1Q04368 snR74snR74 88 nt0.63□□□□□ -2.31
CSI1Q04368 YGR069WYGR069W 336 nt0.63□□□□□ -2.31
CSI1Q04368 YHR063W-AYHR063W-A 336 nt0.63□□□□□ -2.31
CSI1Q04368 RPL39YJL189W 156 nt0.63□□□□□ -2.31
CSI1Q04368 YLR120W-AYLR120W-A 102 nt0.63□□□□□ -2.31
CSI1Q04368 YMR172C-AYMR172C-A 384 nt0.63□□□□□ -2.31
CSI1Q04368 YNL028WYNL028W 318 nt0.63□□□□□ -2.31
CSI1Q04368 UTP20YBL004W 7482 nt0.63□□□□□ -2.31
CSI1Q04368 FMP27YLR454W 7887 nt0.62□□□□□ -2.31
CSI1Q04368 YEL020C-BYEL020C-B 198 nt0.62□□□□□ -2.31
CSI1Q04368 YJL026C-AYJL026C-A 222 nt0.62□□□□□ -2.31
CSI1Q04368 YLL019W-AYLL019W-A 93 nt0.62□□□□□ -2.31
CSI1Q04368 YMR272W-AYMR272W-A 114 nt0.62□□□□□ -2.31
CSI1Q04368 YNL277W-AYNL277W-A 189 nt0.62□□□□□ -2.31
CSI1Q04368 CHS6YJL099W 2241 nt0.62□□□□□ -2.31
CSI1Q04368 NPR2YEL062W 1848 nt0.6□□□□□ -2.31
CSI1Q04368 PAU12YGR294W 363 nt0.6□□□□□ -2.31
CSI1Q04368 YKL145W-AYKL145W-A 93 nt0.6□□□□□ -2.31
CSI1Q04368 YAL067W-AYAL067W-A 228 nt0.6□□□□□ -2.31
CSI1Q04368 ULP2YIL031W 3105 nt0.6□□□□□ -2.31
CSI1Q04368 YGL052WYGL052W 306 nt0.59□□□□□ -2.31
CSI1Q04368 PAA1YDR071C 576 nt0.58□□□□□ -2.32
CSI1Q04368 YJL197C-AYJL197C-A 282 nt0.58□□□□□ -2.32
CSI1Q04368 YNL146WYNL146W 303 nt0.58□□□□□ -2.32
CSI1Q04368 YPR092WYPR092W 306 nt0.58□□□□□ -2.32
CSI1Q04368 snR190snR190 190 nt0.58□□□□□ -2.32
CSI1Q04368 COY1YKL179C 2040 nt0.58□□□□□ -2.32
CSI1Q04368 RPL26BYGR034W 384 nt0.57□□□□□ -2.32
CSI1Q04368 YOR161W-AYOR161W-A 81 nt0.57□□□□□ -2.32
CSI1Q04368 YML002WYML002W 2214 nt0.57□□□□□ -2.32
CSI1Q04368 YCR018C-AYCR018C-A 255 nt0.56□□□□□ -2.32
CSI1Q04368 YOR231C-AYOR231C-A 201 nt0.56□□□□□ -2.32
CSI1Q04368 FYV10YIL097W 1551 nt0.56□□□□□ -2.32
CSI1Q04368 snR65snR65 100 nt0.55□□□□□ -2.32
CSI1Q04368 tN(GUU)QtN(GUU)Q 71 nt0.55□□□□□ -2.32
CSI1Q04368 YIL134C-AYIL134C-A 204 nt0.55□□□□□ -2.32
CSI1Q04368 PRP5YBR237W 2550 nt0.55□□□□□ -2.32
CSI1Q04368 ULI1YFR026C 510 nt0.54□□□□□ -2.32
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 13.9 ms