Protein–RNA interactions for Protein: P40057

YER084W, Uncharacterized protein YER084W, yeastyeast

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YER084WP40057 YJL120WYJL120W 324 nt0.71□□□□□ -2.3
YER084WP40057 IES4YOR189W 351 nt0.71□□□□□ -2.3
YER084WP40057 YDR344CYDR344C 444 nt0.7□□□□□ -2.3
YER084WP40057 RPS27BYHR021C 249 nt0.7□□□□□ -2.3
YER084WP40057 COG8YML071C 1824 nt0.69□□□□□ -2.3
YER084WP40057 ISD11YER048W-A 285 nt0.69□□□□□ -2.3
YER084WP40057 INA22YIR024C 651 nt0.69□□□□□ -2.3
YER084WP40057 SGF11YPL047W 300 nt0.69□□□□□ -2.3
YER084WP40057 PAA1YDR071C 576 nt0.68□□□□□ -2.3
YER084WP40057 YMR031W-AYMR031W-A 327 nt0.68□□□□□ -2.3
YER084WP40057 YOR282WYOR282W 321 nt0.68□□□□□ -2.3
YER084WP40057 YPL044CYPL044C 549 nt0.68□□□□□ -2.3
YER084WP40057 YDL196WYDL196W 330 nt0.67□□□□□ -2.3
YER084WP40057 CMC4YMR194C-B 222 nt0.67□□□□□ -2.3
YER084WP40057 YNL028WYNL028W 318 nt0.67□□□□□ -2.3
YER084WP40057 MCM10YIL150C 1716 nt0.67□□□□□ -2.3
YER084WP40057 EMT1tM(CAU)D 73 nt0.66□□□□□ -2.3
YER084WP40057 EMT5tM(CAU)J1 73 nt0.66□□□□□ -2.3
YER084WP40057 EMT3tM(CAU)J2 73 nt0.66□□□□□ -2.3
YER084WP40057 EMT4tM(CAU)M 73 nt0.66□□□□□ -2.3
YER084WP40057 EMT2tM(CAU)O2 73 nt0.66□□□□□ -2.3
YER084WP40057 NOP9YJL010C 2001 nt0.65□□□□□ -2.3
YER084WP40057 YNL211CYNL211C 261 nt0.65□□□□□ -2.31
YER084WP40057 SCC2YDR180W 4482 nt0.64□□□□□ -2.31
YER084WP40057 SEC1YDR164C 2175 nt0.64□□□□□ -2.31
YER084WP40057 RPL26BYGR034W 384 nt0.63□□□□□ -2.31
YER084WP40057 YJR029WYJR029W 5268 nt0.62□□□□□ -2.31
YER084WP40057 YPR137C-BYPR137C-B 5268 nt0.62□□□□□ -2.31
YER084WP40057 RAD61YDR014W 1944 nt0.62□□□□□ -2.31
YER084WP40057 KAP120YPL125W 3099 nt0.62□□□□□ -2.31
YER084WP40057 BFR2YDR299W 1605 nt0.61□□□□□ -2.31
YER084WP40057 tT(AGU)BtT(AGU)B 73 nt0.61□□□□□ -2.31
YER084WP40057 tT(AGU)CtT(AGU)C 73 nt0.61□□□□□ -2.31
YER084WP40057 tT(AGU)DtT(AGU)D 73 nt0.61□□□□□ -2.31
YER084WP40057 tT(AGU)HtT(AGU)H 73 nt0.61□□□□□ -2.31
YER084WP40057 tT(AGU)I1tT(AGU)I1 73 nt0.61□□□□□ -2.31
YER084WP40057 tT(AGU)I2tT(AGU)I2 73 nt0.61□□□□□ -2.31
YER084WP40057 tT(AGU)JtT(AGU)J 73 nt0.61□□□□□ -2.31
YER084WP40057 tT(AGU)N1tT(AGU)N1 73 nt0.61□□□□□ -2.31
YER084WP40057 tT(AGU)N2tT(AGU)N2 73 nt0.61□□□□□ -2.31
YER084WP40057 tT(AGU)O1tT(AGU)O1 73 nt0.61□□□□□ -2.31
YER084WP40057 tT(AGU)O2tT(AGU)O2 73 nt0.61□□□□□ -2.31
YER084WP40057 YNL146WYNL146W 303 nt0.61□□□□□ -2.31
YER084WP40057 YDR354C-AYDR354C-A 144 nt0.6□□□□□ -2.31
YER084WP40057 YGR069WYGR069W 336 nt0.6□□□□□ -2.31
YER084WP40057 YHR063W-AYHR063W-A 336 nt0.6□□□□□ -2.31
YER084WP40057 YOR008C-AYOR008C-A 225 nt0.6□□□□□ -2.31
YER084WP40057 YCR018C-AYCR018C-A 255 nt0.59□□□□□ -2.31
YER084WP40057 PMP1YCR024C-A 123 nt0.59□□□□□ -2.31
YER084WP40057 snR65snR65 100 nt0.58□□□□□ -2.32
YER084WP40057 YJL197C-AYJL197C-A 282 nt0.58□□□□□ -2.32
YER084WP40057 YAL067W-AYAL067W-A 228 nt0.58□□□□□ -2.32
YER084WP40057 YOR072W-BYOR072W-B 162 nt0.58□□□□□ -2.32
YER084WP40057 NPR2YEL062W 1848 nt0.58□□□□□ -2.32
YER084WP40057 DOP1YDR141C 5097 nt0.58□□□□□ -2.32
YER084WP40057 UTP20YBL004W 7482 nt0.58□□□□□ -2.32
YER084WP40057 YMR160WYMR160W 2451 nt0.57□□□□□ -2.32
YER084WP40057 YFR012W-AYFR012W-A 87 nt0.57□□□□□ -2.32
YER084WP40057 YLL019W-AYLL019W-A 93 nt0.57□□□□□ -2.32
YER084WP40057 RKR1YMR247C 4689 nt0.56□□□□□ -2.32
YER084WP40057 tF(GAA)BtF(GAA)B 73 nt0.56□□□□□ -2.32
YER084WP40057 tF(GAA)FtF(GAA)F 73 nt0.56□□□□□ -2.32
YER084WP40057 tF(GAA)GtF(GAA)G 73 nt0.56□□□□□ -2.32
YER084WP40057 tF(GAA)H1tF(GAA)H1 73 nt0.56□□□□□ -2.32
YER084WP40057 tF(GAA)H2tF(GAA)H2 73 nt0.56□□□□□ -2.32
YER084WP40057 tF(GAA)MtF(GAA)M 73 nt0.56□□□□□ -2.32
YER084WP40057 tF(GAA)P1tF(GAA)P1 73 nt0.56□□□□□ -2.32
YER084WP40057 tF(GAA)P2tF(GAA)P2 73 nt0.56□□□□□ -2.32
YER084WP40057 YLR120W-AYLR120W-A 102 nt0.56□□□□□ -2.32
YER084WP40057 YNL277W-AYNL277W-A 189 nt0.56□□□□□ -2.32
YER084WP40057 YPR092WYPR092W 306 nt0.56□□□□□ -2.32
YER084WP40057 PRP16YKR086W 3216 nt0.56□□□□□ -2.32
YER084WP40057 SEC8YPR055W 3198 nt0.55□□□□□ -2.32
YER084WP40057 YGL052WYGL052W 306 nt0.55□□□□□ -2.32
YER084WP40057 YMR307C-AYMR307C-A 195 nt0.55□□□□□ -2.32
YER084WP40057 YOR015WYOR015W 360 nt0.55□□□□□ -2.32
YER084WP40057 snR190snR190 190 nt0.55□□□□□ -2.32
YER084WP40057 YDL185C-AYDL185C-A 228 nt0.53□□□□□ -2.32
YER084WP40057 YEL020C-BYEL020C-B 198 nt0.53□□□□□ -2.32
YER084WP40057 COX5BYIL111W 456 nt0.53□□□□□ -2.32
YER084WP40057 YJL026C-AYJL026C-A 222 nt0.53□□□□□ -2.32
YER084WP40057 YML002WYML002W 2214 nt0.53□□□□□ -2.33
YER084WP40057 YDL073WYDL073W 2955 nt0.53□□□□□ -2.33
YER084WP40057 COY1YKL179C 2040 nt0.52□□□□□ -2.33
YER084WP40057 YMR172C-AYMR172C-A 384 nt0.52□□□□□ -2.33
YER084WP40057 YPR010C-AYPR010C-A 219 nt0.52□□□□□ -2.33
YER084WP40057 CHS6YJL099W 2241 nt0.51□□□□□ -2.33
YER084WP40057 YLR282CYLR282C 342 nt0.51□□□□□ -2.33
YER084WP40057 YLR399W-AYLR399W-A 105 nt0.51□□□□□ -2.33
YER084WP40057 YGL123C-AYGL123C-A 231 nt0.5□□□□□ -2.33
YER084WP40057 BLI1YKL061W 342 nt0.5□□□□□ -2.33
YER084WP40057 YKL100W-AYKL100W-A 90 nt0.5□□□□□ -2.33
YER084WP40057 YPR159C-AYPR159C-A 102 nt0.5□□□□□ -2.33
YER084WP40057 YPR160W-AYPR160W-A 81 nt0.5□□□□□ -2.33
YER084WP40057 snR74snR74 88 nt0.49□□□□□ -2.33
YER084WP40057 YOR231C-AYOR231C-A 201 nt0.49□□□□□ -2.33
YER084WP40057 ASE1YOR058C 2658 nt0.48□□□□□ -2.33
YER084WP40057 QCR9YGR183C 201 nt0.48□□□□□ -2.33
YER084WP40057 FYV10YIL097W 1551 nt0.48□□□□□ -2.33
YER084WP40057 snR55snR55 98 nt0.47□□□□□ -2.33
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 12.9 ms