Protein–RNA interactions for Protein: O35955

Psmb10, Proteasome subunit beta type-10, mousemouse

Predictions only

Length 273 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb10O35955 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Psmb10O35955 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Psmb10O35955 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Psmb10O35955 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Psmb10O35955 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Psmb10O35955 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Psmb10O35955 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Psmb10O35955 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Psmb10O35955 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Psmb10O35955 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Psmb10O35955 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Psmb10O35955 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Psmb10O35955 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Psmb10O35955 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Psmb10O35955 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Psmb10O35955 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Psmb10O35955 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Psmb10O35955 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Psmb10O35955 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Psmb10O35955 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Psmb10O35955 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Psmb10O35955 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Psmb10O35955 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Psmb10O35955 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Psmb10O35955 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Psmb10O35955 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Psmb10O35955 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Psmb10O35955 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Psmb10O35955 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Psmb10O35955 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Psmb10O35955 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Psmb10O35955 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Psmb10O35955 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Psmb10O35955 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Psmb10O35955 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Psmb10O35955 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Psmb10O35955 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Psmb10O35955 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Psmb10O35955 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Psmb10O35955 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Psmb10O35955 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Psmb10O35955 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Psmb10O35955 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Psmb10O35955 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Psmb10O35955 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Psmb10O35955 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Psmb10O35955 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Psmb10O35955 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Psmb10O35955 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Psmb10O35955 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Psmb10O35955 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Psmb10O35955 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Psmb10O35955 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Psmb10O35955 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Psmb10O35955 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Psmb10O35955 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Psmb10O35955 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Psmb10O35955 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Psmb10O35955 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Psmb10O35955 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Psmb10O35955 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Psmb10O35955 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Psmb10O35955 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Psmb10O35955 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Psmb10O35955 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Psmb10O35955 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Psmb10O35955 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Psmb10O35955 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Psmb10O35955 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Psmb10O35955 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Psmb10O35955 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Psmb10O35955 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Psmb10O35955 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Psmb10O35955 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Psmb10O35955 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Psmb10O35955 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Psmb10O35955 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Psmb10O35955 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Psmb10O35955 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Psmb10O35955 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Psmb10O35955 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Psmb10O35955 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Psmb10O35955 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Psmb10O35955 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Psmb10O35955 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Psmb10O35955 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Psmb10O35955 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Psmb10O35955 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Psmb10O35955 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Psmb10O35955 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Psmb10O35955 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Psmb10O35955 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Psmb10O35955 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Psmb10O35955 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Psmb10O35955 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Psmb10O35955 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Psmb10O35955 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Psmb10O35955 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Psmb10O35955 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Psmb10O35955 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.2 ms