Protein–RNA interactions for Protein: Q3E811

RRT15, Regulator of rDNA transcription protein 15, yeastyeast

Predictions only

Length 62 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RRT15Q3E811 YMR141W-AYMR141W-A 225 nt-0.76□□□□□ -2.53
RRT15Q3E811 NIP1YMR309C 2439 nt-0.77□□□□□ -2.53
RRT15Q3E811 YDR269CYDR269C 324 nt-0.77□□□□□ -2.53
RRT15Q3E811 LIN1YHR156C 1023 nt-0.77□□□□□ -2.53
RRT15Q3E811 YKL023C-AYKL023C-A 228 nt-0.77□□□□□ -2.53
RRT15Q3E811 YAP6YDR259C 1152 nt-0.78□□□□□ -2.53
RRT15Q3E811 YLR198CYLR198C 360 nt-0.78□□□□□ -2.53
RRT15Q3E811 YBR064WYBR064W 429 nt-0.78□□□□□ -2.53
RRT15Q3E811 YLR163W-AYLR163W-A 114 nt-0.79□□□□□ -2.54
RRT15Q3E811 YPL205CYPL205C 345 nt-0.8□□□□□ -2.54
RRT15Q3E811 RRI2YOL117W 1938 nt-0.81□□□□□ -2.54
RRT15Q3E811 YIR044CYIR044C 186 nt-0.81□□□□□ -2.54
RRT15Q3E811 RPS30AYLR287C-A 192 nt-0.81□□□□□ -2.54
RRT15Q3E811 PBI2YNL015W 228 nt-0.81□□□□□ -2.54
RRT15Q3E811 YBR206WYBR206W 324 nt-0.81□□□□□ -2.54
RRT15Q3E811 COY1YKL179C 2040 nt-0.81□□□□□ -2.54
RRT15Q3E811 UBS1YBR165W 834 nt-0.82□□□□□ -2.54
RRT15Q3E811 YHR054CYHR054C 1065 nt-0.84□□□□□ -2.54
RRT15Q3E811 LRP1YHR081W 555 nt-0.84□□□□□ -2.54
RRT15Q3E811 ASE1YOR058C 2658 nt-0.85□□□□□ -2.55
RRT15Q3E811 YOR345CYOR345C 351 nt-0.85□□□□□ -2.55
RRT15Q3E811 YCR022CYCR022C 345 nt-0.86□□□□□ -2.55
RRT15Q3E811 YFR012W-AYFR012W-A 87 nt-0.86□□□□□ -2.55
RRT15Q3E811 YOR020W-AYOR020W-A 273 nt-0.86□□□□□ -2.55
RRT15Q3E811 YOR248WYOR248W 303 nt-0.86□□□□□ -2.55
RRT15Q3E811 YHR131W-AYHR131W-A 246 nt-0.87□□□□□ -2.55
RRT15Q3E811 ACF4YJR083C 930 nt-0.87□□□□□ -2.55
RRT15Q3E811 CWC23YGL128C 852 nt-0.89□□□□□ -2.55
RRT15Q3E811 YHL046W-AYHL046W-A 327 nt-0.89□□□□□ -2.55
RRT15Q3E811 YJR141WYJR141W 1044 nt-0.89□□□□□ -2.55
RRT15Q3E811 YKL068W-AYKL068W-A 237 nt-0.89□□□□□ -2.55
RRT15Q3E811 SPC24YMR117C 642 nt-0.89□□□□□ -2.55
RRT15Q3E811 YOL160WYOL160W 342 nt-0.89□□□□□ -2.55
RRT15Q3E811 tT(UGU)G1tT(UGU)G1 72 nt-0.91□□□□□ -2.56
RRT15Q3E811 tT(UGU)G2tT(UGU)G2 72 nt-0.91□□□□□ -2.56
RRT15Q3E811 tT(UGU)PtT(UGU)P 72 nt-0.91□□□□□ -2.56
RRT15Q3E811 YMR304C-AYMR304C-A 351 nt-0.91□□□□□ -2.56
RRT15Q3E811 YPL261CYPL261C 309 nt-0.91□□□□□ -2.56
RRT15Q3E811 YER188C-AYER188C-A 300 nt-0.92□□□□□ -2.56
RRT15Q3E811 snR36snR36 182 nt-0.92□□□□□ -2.56
RRT15Q3E811 PTP2YOR208W 2253 nt-0.92□□□□□ -2.56
RRT15Q3E811 LOC1YFR001W 615 nt-0.93□□□□□ -2.56
RRT15Q3E811 YHR050W-AYHR050W-A 171 nt-0.93□□□□□ -2.56
RRT15Q3E811 POL32YJR043C 1053 nt-0.94□□□□□ -2.56
RRT15Q3E811 ILM1YJR118C 612 nt-0.94□□□□□ -2.56
RRT15Q3E811 YDR220CYDR220C 294 nt-0.95□□□□□ -2.56
RRT15Q3E811 YLL006W-AYLL006W-A 177 nt-0.95□□□□□ -2.56
RRT15Q3E811 ATG16YMR159C 453 nt-0.95□□□□□ -2.56
RRT15Q3E811 YNL146C-AYNL146C-A 195 nt-0.95□□□□□ -2.56
RRT15Q3E811 YML108WYML108W 318 nt-0.97□□□□□ -2.56
RRT15Q3E811 YCR038W-AYCR038W-A 126 nt-0.98□□□□□ -2.57
RRT15Q3E811 ECL1YGR146C 636 nt-0.98□□□□□ -2.57
RRT15Q3E811 TIM13YGR181W 318 nt-0.98□□□□□ -2.57
RRT15Q3E811 YBL008W-AYBL008W-A 240 nt-0.98□□□□□ -2.57
RRT15Q3E811 YPR096CYPR096C 303 nt-0.98□□□□□ -2.57
RRT15Q3E811 DIE2YGR227W 1578 nt-1□□□□□ -2.57
RRT15Q3E811 tN(GUU)QtN(GUU)Q 71 nt-1□□□□□ -2.57
RRT15Q3E811 YGR115CYGR115C 780 nt-1□□□□□ -2.57
RRT15Q3E811 VAM3YOR106W 852 nt-1□□□□□ -2.57
RRT15Q3E811 EMC4YGL231C 573 nt-1.01□□□□□ -2.57
RRT15Q3E811 YLR171WYLR171W 390 nt-1.01□□□□□ -2.57
RRT15Q3E811 YMR013C-AYMR013C-A 150 nt-1.02□□□□□ -2.57
RRT15Q3E811 YMR075C-AYMR075C-A 366 nt-1.02□□□□□ -2.57
RRT15Q3E811 IPP1YBR011C 864 nt-1.02□□□□□ -2.57
RRT15Q3E811 SEM1YDR363W-A 270 nt-1.03□□□□□ -2.57
RRT15Q3E811 YKL202WYKL202W 582 nt-1.03□□□□□ -2.57
RRT15Q3E811 DCP1YOL149W 696 nt-1.03□□□□□ -2.57
RRT15Q3E811 MRPS8YMR158W 468 nt-1.04□□□□□ -2.58
RRT15Q3E811 YMR307C-AYMR307C-A 195 nt-1.04□□□□□ -2.58
RRT15Q3E811 IRC16YPR038W 360 nt-1.04□□□□□ -2.58
RRT15Q3E811 RPM2YML091C 3609 nt-1.04□□□□□ -2.58
RRT15Q3E811 RPL22BYFL034C-A 369 nt-1.05□□□□□ -2.58
RRT15Q3E811 YGL015CYGL015C 393 nt-1.05□□□□□ -2.58
RRT15Q3E811 YGL239CYGL239C 315 nt-1.05□□□□□ -2.58
RRT15Q3E811 snR33snR33 183 nt-1.05□□□□□ -2.58
RRT15Q3E811 YHL009W-BYHL009W-B 5409 nt-1.06□□□□□ -2.58
RRT15Q3E811 snR72snR72 98 nt-1.07□□□□□ -2.58
RRT15Q3E811 SRB7YDR308C 423 nt-1.08□□□□□ -2.58
RRT15Q3E811 YGR270C-AYGR270C-A 219 nt-1.08□□□□□ -2.58
RRT15Q3E811 YCR018C-AYCR018C-A 255 nt-1.1□□□□□ -2.59
RRT15Q3E811 YJL120WYJL120W 324 nt-1.1□□□□□ -2.59
RRT15Q3E811 YIL071W-AYIL071W-A 477 nt-1.11□□□□□ -2.59
RRT15Q3E811 YNL319WYNL319W 441 nt-1.11□□□□□ -2.59
RRT15Q3E811 YBR223W-AYBR223W-A 120 nt-1.11□□□□□ -2.59
RRT15Q3E811 APQ13YJL075C 417 nt-1.12□□□□□ -2.59
RRT15Q3E811 GRX5YPL059W 453 nt-1.12□□□□□ -2.59
RRT15Q3E811 BUD26YDR241W 288 nt-1.13□□□□□ -2.59
RRT15Q3E811 snR161snR161 161 nt-1.13□□□□□ -2.59
RRT15Q3E811 snR34snR34 203 nt-1.13□□□□□ -2.59
RRT15Q3E811 RPF1YHR088W 888 nt-1.14□□□□□ -2.59
RRT15Q3E811 RPS20YHL015W 366 nt-1.15□□□□□ -2.59
RRT15Q3E811 YLR287CYLR287C 1068 nt-1.15□□□□□ -2.59
RRT15Q3E811 ATG31YDR022C 591 nt-1.16□□□□□ -2.6
RRT15Q3E811 YLR041WYLR041W 321 nt-1.17□□□□□ -2.6
RRT15Q3E811 BER1YLR412W 825 nt-1.17□□□□□ -2.6
RRT15Q3E811 YBL107W-AYBL107W-A 105 nt-1.17□□□□□ -2.6
RRT15Q3E811 YBR099CYBR099C 384 nt-1.17□□□□□ -2.6
RRT15Q3E811 snR51snR51 107 nt-1.17□□□□□ -2.6
RRT15Q3E811 YDL185C-AYDL185C-A 228 nt-1.18□□□□□ -2.6
RRT15Q3E811 YOL029CYOL029C 606 nt-1.18□□□□□ -2.6
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