Protein–RNA interactions for Protein: Q12208

USB1, U6 snRNA phosphodiesterase, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 290 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
USB1Q12208 YDR344CYDR344C 444 nt0.59□□□□□ -2.31
USB1Q12208 ALG13YGL047W 609 nt0.59□□□□□ -2.31
USB1Q12208 GPG1YGL121C 381 nt0.59□□□□□ -2.31
USB1Q12208 RPS20YHL015W 366 nt0.59□□□□□ -2.31
USB1Q12208 YJR011CYJR011C 786 nt0.59□□□□□ -2.31
USB1Q12208 YLR434CYLR434C 384 nt0.59□□□□□ -2.31
USB1Q12208 YOR108C-AYOR108C-A 210 nt0.59□□□□□ -2.31
USB1Q12208 INP2YMR163C 2118 nt0.58□□□□□ -2.32
USB1Q12208 tF(GAA)BtF(GAA)B 73 nt0.58□□□□□ -2.32
USB1Q12208 tF(GAA)FtF(GAA)F 73 nt0.58□□□□□ -2.32
USB1Q12208 tF(GAA)GtF(GAA)G 73 nt0.58□□□□□ -2.32
USB1Q12208 tF(GAA)H1tF(GAA)H1 73 nt0.58□□□□□ -2.32
USB1Q12208 tF(GAA)H2tF(GAA)H2 73 nt0.58□□□□□ -2.32
USB1Q12208 tF(GAA)MtF(GAA)M 73 nt0.58□□□□□ -2.32
USB1Q12208 tF(GAA)P1tF(GAA)P1 73 nt0.58□□□□□ -2.32
USB1Q12208 tF(GAA)P2tF(GAA)P2 73 nt0.58□□□□□ -2.32
USB1Q12208 tT(AGU)BtT(AGU)B 73 nt0.58□□□□□ -2.32
USB1Q12208 tT(AGU)CtT(AGU)C 73 nt0.58□□□□□ -2.32
USB1Q12208 tT(AGU)DtT(AGU)D 73 nt0.58□□□□□ -2.32
USB1Q12208 tT(AGU)HtT(AGU)H 73 nt0.58□□□□□ -2.32
USB1Q12208 tT(AGU)I1tT(AGU)I1 73 nt0.58□□□□□ -2.32
USB1Q12208 tT(AGU)I2tT(AGU)I2 73 nt0.58□□□□□ -2.32
USB1Q12208 tT(AGU)JtT(AGU)J 73 nt0.58□□□□□ -2.32
USB1Q12208 tT(AGU)N1tT(AGU)N1 73 nt0.58□□□□□ -2.32
USB1Q12208 tT(AGU)N2tT(AGU)N2 73 nt0.58□□□□□ -2.32
USB1Q12208 tT(AGU)O1tT(AGU)O1 73 nt0.58□□□□□ -2.32
USB1Q12208 tT(AGU)O2tT(AGU)O2 73 nt0.58□□□□□ -2.32
USB1Q12208 YLR406C-AYLR406C-A 150 nt0.58□□□□□ -2.32
USB1Q12208 YBR064WYBR064W 429 nt0.58□□□□□ -2.32
USB1Q12208 YDL073WYDL073W 2955 nt0.57□□□□□ -2.32
USB1Q12208 MAM33YIL070C 801 nt0.57□□□□□ -2.32
USB1Q12208 YJR157WYJR157W 363 nt0.57□□□□□ -2.32
USB1Q12208 YMR272W-AYMR272W-A 114 nt0.57□□□□□ -2.32
USB1Q12208 YPL261CYPL261C 309 nt0.57□□□□□ -2.32
USB1Q12208 YBR206WYBR206W 324 nt0.57□□□□□ -2.32
USB1Q12208 YMR160WYMR160W 2451 nt0.56□□□□□ -2.32
USB1Q12208 YGR174W-AYGR174W-A 87 nt0.56□□□□□ -2.32
USB1Q12208 YLR202CYLR202C 327 nt0.56□□□□□ -2.32
USB1Q12208 YMR290W-AYMR290W-A 348 nt0.56□□□□□ -2.32
USB1Q12208 YNL058CYNL058C 951 nt0.56□□□□□ -2.32
USB1Q12208 YLL007CYLL007C 1998 nt0.56□□□□□ -2.32
USB1Q12208 DBP6YNR038W 1890 nt0.55□□□□□ -2.32
USB1Q12208 ATG31YDR022C 591 nt0.55□□□□□ -2.32
USB1Q12208 MCM10YIL150C 1716 nt0.55□□□□□ -2.32
USB1Q12208 UTP10YJL109C 5310 nt0.55□□□□□ -2.32
USB1Q12208 LTE1YAL024C 4308 nt0.54□□□□□ -2.32
USB1Q12208 YPL185WYPL185W 396 nt0.54□□□□□ -2.32
USB1Q12208 YPL205CYPL205C 345 nt0.54□□□□□ -2.32
USB1Q12208 YHR063W-AYHR063W-A 336 nt0.53□□□□□ -2.32
USB1Q12208 YJL007CYJL007C 315 nt0.53□□□□□ -2.32
USB1Q12208 YPR002C-AYPR002C-A 198 nt0.53□□□□□ -2.32
USB1Q12208 Q0017Q0017 162 nt0.53□□□□□ -2.32
USB1Q12208 NIP100YPL174C 2607 nt0.52□□□□□ -2.33
USB1Q12208 YDR426CYDR426C 378 nt0.52□□□□□ -2.33
USB1Q12208 YHL042WYHL042W 453 nt0.52□□□□□ -2.33
USB1Q12208 ECM12YHR021W-A 456 nt0.52□□□□□ -2.33
USB1Q12208 YKL145W-AYKL145W-A 93 nt0.52□□□□□ -2.33
USB1Q12208 CUL3YGR003W 2235 nt0.52□□□□□ -2.33
USB1Q12208 CSN9YDR179C 489 nt0.51□□□□□ -2.33
USB1Q12208 ISD11YER048W-A 285 nt0.51□□□□□ -2.33
USB1Q12208 RPL38YLR325C 237 nt0.51□□□□□ -2.33
USB1Q12208 YML002WYML002W 2214 nt0.51□□□□□ -2.33
USB1Q12208 YML007C-AYML007C-A 111 nt0.51□□□□□ -2.33
USB1Q12208 PRM3YPL192C 402 nt0.51□□□□□ -2.33
USB1Q12208 PAN2YGL094C 3348 nt0.51□□□□□ -2.33
USB1Q12208 YCK3YER123W 1575 nt0.5□□□□□ -2.33
USB1Q12208 YER079WYER079W 633 nt0.49□□□□□ -2.33
USB1Q12208 YFR012W-AYFR012W-A 87 nt0.49□□□□□ -2.33
USB1Q12208 OLI1Q0130 231 nt0.49□□□□□ -2.33
USB1Q12208 YOR032W-AYOR032W-A 201 nt0.49□□□□□ -2.33
USB1Q12208 YPL068CYPL068C 882 nt0.49□□□□□ -2.33
USB1Q12208 UTP20YBL004W 7482 nt0.49□□□□□ -2.33
USB1Q12208 NOP9YJL010C 2001 nt0.48□□□□□ -2.33
USB1Q12208 YER137W-AYER137W-A 306 nt0.48□□□□□ -2.33
USB1Q12208 YBR285WYBR285W 435 nt0.48□□□□□ -2.33
USB1Q12208 CHS6YJL099W 2241 nt0.48□□□□□ -2.33
USB1Q12208 PMP1YCR024C-A 123 nt0.47□□□□□ -2.33
USB1Q12208 QCR9YGR183C 201 nt0.47□□□□□ -2.33
USB1Q12208 PAU12YGR294W 363 nt0.47□□□□□ -2.33
USB1Q12208 NPR2YEL062W 1848 nt0.47□□□□□ -2.33
USB1Q12208 YIR044CYIR044C 186 nt0.46□□□□□ -2.34
USB1Q12208 YOR282WYOR282W 321 nt0.46□□□□□ -2.34
USB1Q12208 YOL014WYOL014W 375 nt0.45□□□□□ -2.34
USB1Q12208 ASE1YOR058C 2658 nt0.45□□□□□ -2.34
USB1Q12208 YLR334CYLR334C 381 nt0.44□□□□□ -2.34
USB1Q12208 BSC3YLR465C 309 nt0.44□□□□□ -2.34
USB1Q12208 VPS20YMR077C 666 nt0.44□□□□□ -2.34
USB1Q12208 YOR218CYOR218C 420 nt0.44□□□□□ -2.34
USB1Q12208 PTP2YOR208W 2253 nt0.43□□□□□ -2.34
USB1Q12208 YKL063CYKL063C 504 nt0.43□□□□□ -2.34
USB1Q12208 YNL211CYNL211C 261 nt0.43□□□□□ -2.34
USB1Q12208 YOR011W-AYOR011W-A 207 nt0.43□□□□□ -2.34
USB1Q12208 YOR293C-AYOR293C-A 150 nt0.43□□□□□ -2.34
USB1Q12208 YPL044CYPL044C 549 nt0.43□□□□□ -2.34
USB1Q12208 PRP16YKR086W 3216 nt0.42□□□□□ -2.34
USB1Q12208 AGA2YGL032C 264 nt0.42□□□□□ -2.34
USB1Q12208 tW(UCA)QtW(UCA)Q 74 nt0.42□□□□□ -2.34
USB1Q12208 SGF11YPL047W 300 nt0.42□□□□□ -2.34
USB1Q12208 LEE1YPL054W 906 nt0.42□□□□□ -2.34
USB1Q12208 RPL26BYGR034W 384 nt0.41□□□□□ -2.34
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