Protein–RNA interactions for Protein: Q12175

MSH5, MutS protein homolog 5, yeastyeast

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Length 901 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
MSH5Q12175 PMP1YCR024C-A 123 nt0.53□□□□□ -2.32
MSH5Q12175 FYV7YLR068W 456 nt0.53□□□□□ -2.32
MSH5Q12175 YPL229WYPL229W 621 nt0.53□□□□□ -2.32
MSH5Q12175 UTP10YJL109C 5310 nt0.52□□□□□ -2.33
MSH5Q12175 snR41snR41 95 nt0.52□□□□□ -2.33
MSH5Q12175 SDH7YDR511W 402 nt0.51□□□□□ -2.33
MSH5Q12175 YHL041WYHL041W 450 nt0.51□□□□□ -2.33
MSH5Q12175 OST1YJL002C 1431 nt0.51□□□□□ -2.33
MSH5Q12175 NOP9YJL010C 2001 nt0.51□□□□□ -2.33
MSH5Q12175 YLR171WYLR171W 390 nt0.51□□□□□ -2.33
MSH5Q12175 YMR160WYMR160W 2451 nt0.51□□□□□ -2.33
MSH5Q12175 RPS30BYOR182C 192 nt0.51□□□□□ -2.33
MSH5Q12175 UTP20YBL004W 7482 nt0.51□□□□□ -2.33
MSH5Q12175 INP2YMR163C 2118 nt0.5□□□□□ -2.33
MSH5Q12175 LTE1YAL024C 4308 nt0.5□□□□□ -2.33
MSH5Q12175 YDR344CYDR344C 444 nt0.5□□□□□ -2.33
MSH5Q12175 YER006C-AYER006C-A 318 nt0.5□□□□□ -2.33
MSH5Q12175 YIL142C-AYIL142C-A 333 nt0.5□□□□□ -2.33
MSH5Q12175 YAR047CYAR047C 321 nt0.5□□□□□ -2.33
MSH5Q12175 RPL26AYLR344W 384 nt0.5□□□□□ -2.33
MSH5Q12175 YNL058CYNL058C 951 nt0.5□□□□□ -2.33
MSH5Q12175 YOR072W-AYOR072W-A 249 nt0.5□□□□□ -2.33
MSH5Q12175 PCF11YDR228C 1881 nt0.5□□□□□ -2.33
MSH5Q12175 NPR2YEL062W 1848 nt0.5□□□□□ -2.33
MSH5Q12175 INA22YIR024C 651 nt0.49□□□□□ -2.33
MSH5Q12175 TOM22YNL131W 459 nt0.49□□□□□ -2.33
MSH5Q12175 YPL044CYPL044C 549 nt0.49□□□□□ -2.33
MSH5Q12175 CHS6YJL099W 2241 nt0.48□□□□□ -2.33
MSH5Q12175 YOL013W-BYOL013W-B 291 nt0.48□□□□□ -2.33
MSH5Q12175 CBS1YDL069C 690 nt0.47□□□□□ -2.33
MSH5Q12175 YGR174W-AYGR174W-A 87 nt0.47□□□□□ -2.33
MSH5Q12175 YLR101CYLR101C 396 nt0.47□□□□□ -2.33
MSH5Q12175 YBL008W-AYBL008W-A 240 nt0.47□□□□□ -2.33
MSH5Q12175 YNL303WYNL303W 348 nt0.47□□□□□ -2.33
MSH5Q12175 snR189snR189 189 nt0.47□□□□□ -2.33
MSH5Q12175 PTP2YOR208W 2253 nt0.47□□□□□ -2.33
MSH5Q12175 YCK3YER123W 1575 nt0.46□□□□□ -2.34
MSH5Q12175 UBC7YMR022W 498 nt0.46□□□□□ -2.34
MSH5Q12175 YOR218CYOR218C 420 nt0.46□□□□□ -2.34
MSH5Q12175 YPL185WYPL185W 396 nt0.46□□□□□ -2.34
MSH5Q12175 tF(GAA)BtF(GAA)B 73 nt0.45□□□□□ -2.34
MSH5Q12175 tF(GAA)FtF(GAA)F 73 nt0.45□□□□□ -2.34
MSH5Q12175 tF(GAA)GtF(GAA)G 73 nt0.45□□□□□ -2.34
MSH5Q12175 tF(GAA)H1tF(GAA)H1 73 nt0.45□□□□□ -2.34
MSH5Q12175 tF(GAA)H2tF(GAA)H2 73 nt0.45□□□□□ -2.34
MSH5Q12175 tF(GAA)MtF(GAA)M 73 nt0.45□□□□□ -2.34
MSH5Q12175 tF(GAA)P1tF(GAA)P1 73 nt0.45□□□□□ -2.34
MSH5Q12175 tF(GAA)P2tF(GAA)P2 73 nt0.45□□□□□ -2.34
MSH5Q12175 YEL030C-AYEL030C-A 315 nt0.45□□□□□ -2.34
MSH5Q12175 YAP6YDR259C 1152 nt0.44□□□□□ -2.34
MSH5Q12175 RPS20YHL015W 366 nt0.44□□□□□ -2.34
MSH5Q12175 MAM33YIL070C 801 nt0.44□□□□□ -2.34
MSH5Q12175 YBR064WYBR064W 429 nt0.44□□□□□ -2.34
MSH5Q12175 OLI1Q0130 231 nt0.43□□□□□ -2.34
MSH5Q12175 BSC3YLR465C 309 nt0.42□□□□□ -2.34
MSH5Q12175 ATG31YDR022C 591 nt0.41□□□□□ -2.34
MSH5Q12175 YJR011CYJR011C 786 nt0.41□□□□□ -2.34
MSH5Q12175 ISF1YMR081C 1017 nt0.41□□□□□ -2.34
MSH5Q12175 YIL134C-AYIL134C-A 204 nt0.4□□□□□ -2.35
MSH5Q12175 NIP100YPL174C 2607 nt0.4□□□□□ -2.35
MSH5Q12175 PAA1YDR071C 576 nt0.39□□□□□ -2.35
MSH5Q12175 YDR426CYDR426C 378 nt0.39□□□□□ -2.35
MSH5Q12175 RPS24BYIL069C 408 nt0.39□□□□□ -2.35
MSH5Q12175 YKL145W-AYKL145W-A 93 nt0.39□□□□□ -2.35
MSH5Q12175 YBR206WYBR206W 324 nt0.39□□□□□ -2.35
MSH5Q12175 MCM10YIL150C 1716 nt0.38□□□□□ -2.35
MSH5Q12175 RPL26BYGR034W 384 nt0.38□□□□□ -2.35
MSH5Q12175 YML007C-AYML007C-A 111 nt0.38□□□□□ -2.35
MSH5Q12175 SPO21YOL091W 1830 nt0.38□□□□□ -2.35
MSH5Q12175 YPR002C-AYPR002C-A 198 nt0.37□□□□□ -2.35
MSH5Q12175 FMP27YLR454W 7887 nt0.36□□□□□ -2.35
MSH5Q12175 MRPL50YNR022C 420 nt0.36□□□□□ -2.35
MSH5Q12175 YJL127W-AYJL127W-A 117 nt0.35□□□□□ -2.35
MSH5Q12175 ATP19YOL077W-A 207 nt0.35□□□□□ -2.35
MSH5Q12175 FYV10YIL097W 1551 nt0.35□□□□□ -2.35
MSH5Q12175 YSP1YHR155W 3687 nt0.34□□□□□ -2.35
MSH5Q12175 MLP1YKR095W 5628 nt0.34□□□□□ -2.36
MSH5Q12175 BEM3YPL115C 3387 nt0.34□□□□□ -2.36
MSH5Q12175 PET111YMR257C 2403 nt0.33□□□□□ -2.36
MSH5Q12175 PCC1YKR095W-A 267 nt0.33□□□□□ -2.36
MSH5Q12175 YOL014WYOL014W 375 nt0.33□□□□□ -2.36
MSH5Q12175 AI1Q0050 2505 nt0.33□□□□□ -2.36
MSH5Q12175 SBH1YER087C-B 249 nt0.32□□□□□ -2.36
MSH5Q12175 YLR456WYLR456W 615 nt0.31□□□□□ -2.36
MSH5Q12175 ULP2YIL031W 3105 nt0.3□□□□□ -2.36
MSH5Q12175 YOR011W-AYOR011W-A 207 nt0.3□□□□□ -2.36
MSH5Q12175 YPL068CYPL068C 882 nt0.3□□□□□ -2.36
MSH5Q12175 SEC8YPR055W 3198 nt0.3□□□□□ -2.36
MSH5Q12175 VIK1YPL253C 1944 nt0.29□□□□□ -2.36
MSH5Q12175 HMRA2YCR096C 360 nt0.29□□□□□ -2.36
MSH5Q12175 YFR012W-AYFR012W-A 87 nt0.29□□□□□ -2.36
MSH5Q12175 ABF2YMR072W 552 nt0.29□□□□□ -2.36
MSH5Q12175 YMR321CYMR321C 318 nt0.29□□□□□ -2.36
MSH5Q12175 TRS65YGR166W 1683 nt0.28□□□□□ -2.36
MSH5Q12175 ASE1YOR058C 2658 nt0.28□□□□□ -2.36
MSH5Q12175 QCR9YGR183C 201 nt0.28□□□□□ -2.36
MSH5Q12175 PAU12YGR294W 363 nt0.28□□□□□ -2.36
MSH5Q12175 YNL211CYNL211C 261 nt0.28□□□□□ -2.36
MSH5Q12175 SGF11YPL047W 300 nt0.28□□□□□ -2.36
MSH5Q12175 COX5BYIL111W 456 nt0.27□□□□□ -2.37
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