Protein–RNA interactions for Protein: Q07990

YLR042C, Cell wall protein YLR042C, yeastyeast

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YLR042CQ07990 PAA1YDR071C 576 nt-0.51□□□□□ -2.49
YLR042CQ07990 CWC23YGL128C 852 nt-0.51□□□□□ -2.49
YLR042CQ07990 RSM23YGL129C 1353 nt-0.51□□□□□ -2.49
YLR042CQ07990 MAM33YIL070C 801 nt-0.51□□□□□ -2.49
YLR042CQ07990 YIR030W-AYIR030W-A 384 nt-0.51□□□□□ -2.49
YLR042CQ07990 POL32YJR043C 1053 nt-0.51□□□□□ -2.49
YLR042CQ07990 YMR013C-AYMR013C-A 150 nt-0.51□□□□□ -2.49
YLR042CQ07990 YBR064WYBR064W 429 nt-0.51□□□□□ -2.49
YLR042CQ07990 YPR170W-AYPR170W-A 186 nt-0.51□□□□□ -2.49
YLR042CQ07990 RAD34YDR314C 2079 nt-0.52□□□□□ -2.49
YLR042CQ07990 YLR198CYLR198C 360 nt-0.52□□□□□ -2.49
YLR042CQ07990 YAL067W-AYAL067W-A 228 nt-0.53□□□□□ -2.49
YLR042CQ07990 YMR141W-AYMR141W-A 225 nt-0.53□□□□□ -2.49
YLR042CQ07990 YNL146WYNL146W 303 nt-0.53□□□□□ -2.49
YLR042CQ07990 HAL9YOL089C 3093 nt-0.54□□□□□ -2.5
YLR042CQ07990 YLR399W-AYLR399W-A 105 nt-0.54□□□□□ -2.5
YLR042CQ07990 NIP100YPL174C 2607 nt-0.55□□□□□ -2.5
YLR042CQ07990 YNL211CYNL211C 261 nt-0.55□□□□□ -2.5
YLR042CQ07990 VAM3YOR106W 852 nt-0.55□□□□□ -2.5
YLR042CQ07990 SPO21YOL091W 1830 nt-0.56□□□□□ -2.5
YLR042CQ07990 NNF2YGR089W 2811 nt-0.56□□□□□ -2.5
YLR042CQ07990 YAP6YDR259C 1152 nt-0.56□□□□□ -2.5
YLR042CQ07990 SNU56YDR240C 1479 nt-0.57□□□□□ -2.5
YLR042CQ07990 YKU70YMR284W 1809 nt-0.58□□□□□ -2.5
YLR042CQ07990 YGL015CYGL015C 393 nt-0.58□□□□□ -2.5
YLR042CQ07990 YOR248WYOR248W 303 nt-0.58□□□□□ -2.5
YLR042CQ07990 ASE1YOR058C 2658 nt-0.59□□□□□ -2.5
YLR042CQ07990 YFR012W-AYFR012W-A 87 nt-0.59□□□□□ -2.5
YLR042CQ07990 YJL007CYJL007C 315 nt-0.59□□□□□ -2.5
YLR042CQ07990 PBI2YNL015W 228 nt-0.59□□□□□ -2.5
YLR042CQ07990 YBR076C-AYBR076C-A 267 nt-0.59□□□□□ -2.5
YLR042CQ07990 COY1YKL179C 2040 nt-0.6□□□□□ -2.51
YLR042CQ07990 YIR044CYIR044C 186 nt-0.6□□□□□ -2.51
YLR042CQ07990 ILM1YJR118C 612 nt-0.6□□□□□ -2.51
YLR042CQ07990 YPL225WYPL225W 441 nt-0.6□□□□□ -2.51
YLR042CQ07990 YKL068W-AYKL068W-A 237 nt-0.61□□□□□ -2.51
YLR042CQ07990 YOL160WYOL160W 342 nt-0.61□□□□□ -2.51
YLR042CQ07990 YKL023C-AYKL023C-A 228 nt-0.63□□□□□ -2.51
YLR042CQ07990 HTB2YBL002W 396 nt-0.63□□□□□ -2.51
YLR042CQ07990 NIP1YMR309C 2439 nt-0.63□□□□□ -2.51
YLR042CQ07990 YOR345CYOR345C 351 nt-0.64□□□□□ -2.51
YLR042CQ07990 YPL261CYPL261C 309 nt-0.64□□□□□ -2.51
YLR042CQ07990 YPR096CYPR096C 303 nt-0.64□□□□□ -2.51
YLR042CQ07990 YBL008W-AYBL008W-A 240 nt-0.65□□□□□ -2.51
YLR042CQ07990 IRC16YPR038W 360 nt-0.65□□□□□ -2.51
YLR042CQ07990 UBS1YBR165W 834 nt-0.66□□□□□ -2.52
YLR042CQ07990 YPL205CYPL205C 345 nt-0.67□□□□□ -2.52
YLR042CQ07990 YGL239CYGL239C 315 nt-0.69□□□□□ -2.52
YLR042CQ07990 YHL046W-AYHL046W-A 327 nt-0.69□□□□□ -2.52
YLR042CQ07990 YLR217WYLR217W 324 nt-0.7□□□□□ -2.52
YLR042CQ07990 GLG1YKR058W 1851 nt-0.7□□□□□ -2.52
YLR042CQ07990 BUD26YDR241W 288 nt-0.71□□□□□ -2.52
YLR042CQ07990 YML108WYML108W 318 nt-0.71□□□□□ -2.52
YLR042CQ07990 PTP2YOR208W 2253 nt-0.71□□□□□ -2.52
YLR042CQ07990 snR72snR72 98 nt-0.72□□□□□ -2.52
YLR042CQ07990 EMC4YGL231C 573 nt-0.72□□□□□ -2.52
YLR042CQ07990 YBR206WYBR206W 324 nt-0.72□□□□□ -2.52
YLR042CQ07990 DIE2YGR227W 1578 nt-0.73□□□□□ -2.53
YLR042CQ07990 YJR141WYJR141W 1044 nt-0.73□□□□□ -2.53
YLR042CQ07990 YKL202WYKL202W 582 nt-0.73□□□□□ -2.53
YLR042CQ07990 YGR228WYGR228W 345 nt-0.74□□□□□ -2.53
YLR042CQ07990 YHR131W-AYHR131W-A 246 nt-0.74□□□□□ -2.53
YLR042CQ07990 APQ13YJL075C 417 nt-0.74□□□□□ -2.53
YLR042CQ07990 DCP1YOL149W 696 nt-0.74□□□□□ -2.53
YLR042CQ07990 snR5snR5 204 nt-0.76□□□□□ -2.53
YLR042CQ07990 YJL026C-AYJL026C-A 222 nt-0.76□□□□□ -2.53
YLR042CQ07990 YLR171WYLR171W 390 nt-0.76□□□□□ -2.53
YLR042CQ07990 YPR039WYPR039W 336 nt-0.76□□□□□ -2.53
YLR042CQ07990 RPM2YML091C 3609 nt-0.77□□□□□ -2.53
YLR042CQ07990 tN(GUU)QtN(GUU)Q 71 nt-0.77□□□□□ -2.53
YLR042CQ07990 YCR022CYCR022C 345 nt-0.78□□□□□ -2.53
YLR042CQ07990 snR33snR33 183 nt-0.78□□□□□ -2.53
YLR042CQ07990 CUP1-1YHR053C 186 nt-0.79□□□□□ -2.54
YLR042CQ07990 CUP1-2YHR055C 186 nt-0.79□□□□□ -2.54
YLR042CQ07990 YLL006W-AYLL006W-A 177 nt-0.8□□□□□ -2.54
YLR042CQ07990 ECL1YGR146C 636 nt-0.83□□□□□ -2.54
YLR042CQ07990 tT(UGU)G1tT(UGU)G1 72 nt-0.83□□□□□ -2.54
YLR042CQ07990 tT(UGU)G2tT(UGU)G2 72 nt-0.83□□□□□ -2.54
YLR042CQ07990 tT(UGU)PtT(UGU)P 72 nt-0.83□□□□□ -2.54
YLR042CQ07990 snR51snR51 107 nt-0.83□□□□□ -2.54
YLR042CQ07990 YPL060C-AYPL060C-A 3315 nt-0.84□□□□□ -2.54
YLR042CQ07990 MRPL32YCR003W 552 nt-0.84□□□□□ -2.54
YLR042CQ07990 SEM1YDR363W-A 270 nt-0.84□□□□□ -2.54
YLR042CQ07990 YIL066W-AYIL066W-A 444 nt-0.84□□□□□ -2.54
YLR042CQ07990 YNL319WYNL319W 441 nt-0.84□□□□□ -2.54
YLR042CQ07990 IPP1YBR011C 864 nt-0.84□□□□□ -2.54
YLR042CQ07990 YGR115CYGR115C 780 nt-0.85□□□□□ -2.55
YLR042CQ07990 CMC1YKL137W 336 nt-0.85□□□□□ -2.55
YLR042CQ07990 YOL029CYOL029C 606 nt-0.85□□□□□ -2.55
YLR042CQ07990 YBL107W-AYBL107W-A 105 nt-0.85□□□□□ -2.55
YLR042CQ07990 YMR307C-AYMR307C-A 195 nt-0.86□□□□□ -2.55
YLR042CQ07990 YNL067W-BYNL067W-B 141 nt-0.86□□□□□ -2.55
YLR042CQ07990 RPS20YHL015W 366 nt-0.87□□□□□ -2.55
YLR042CQ07990 YCR018C-AYCR018C-A 255 nt-0.88□□□□□ -2.55
YLR042CQ07990 YPL182CYPL182C 384 nt-0.88□□□□□ -2.55
YLR042CQ07990 ATG31YDR022C 591 nt-0.89□□□□□ -2.55
YLR042CQ07990 YIL071W-AYIL071W-A 477 nt-0.89□□□□□ -2.55
YLR042CQ07990 YJL120WYJL120W 324 nt-0.89□□□□□ -2.55
YLR042CQ07990 YDL185C-AYDL185C-A 228 nt-0.9□□□□□ -2.55
YLR042CQ07990 RPF1YHR088W 888 nt-0.9□□□□□ -2.55
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 54.5 ms