Protein–RNA interactions for Protein: Q06410

ATG17, Autophagy-related protein 17, yeastyeast

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
ATG17Q06410 YNL058CYNL058C 951 nt0.59□□□□□ -2.31
ATG17Q06410 LTE1YAL024C 4308 nt0.59□□□□□ -2.32
ATG17Q06410 NIP100YPL174C 2607 nt0.59□□□□□ -2.32
ATG17Q06410 UBP3YER151C 2739 nt0.58□□□□□ -2.32
ATG17Q06410 ATG31YDR022C 591 nt0.58□□□□□ -2.32
ATG17Q06410 YOR282WYOR282W 321 nt0.58□□□□□ -2.32
ATG17Q06410 YML002WYML002W 2214 nt0.58□□□□□ -2.32
ATG17Q06410 NOP9YJL010C 2001 nt0.57□□□□□ -2.32
ATG17Q06410 PCF11YDR228C 1881 nt0.57□□□□□ -2.32
ATG17Q06410 YDR344CYDR344C 444 nt0.57□□□□□ -2.32
ATG17Q06410 MAM33YIL070C 801 nt0.57□□□□□ -2.32
ATG17Q06410 YIR044CYIR044C 186 nt0.57□□□□□ -2.32
ATG17Q06410 YJR011CYJR011C 786 nt0.57□□□□□ -2.32
ATG17Q06410 YBR064WYBR064W 429 nt0.57□□□□□ -2.32
ATG17Q06410 CUL3YGR003W 2235 nt0.56□□□□□ -2.32
ATG17Q06410 RPS20YHL015W 366 nt0.56□□□□□ -2.32
ATG17Q06410 tT(AGU)BtT(AGU)B 73 nt0.56□□□□□ -2.32
ATG17Q06410 tT(AGU)CtT(AGU)C 73 nt0.56□□□□□ -2.32
ATG17Q06410 tT(AGU)DtT(AGU)D 73 nt0.56□□□□□ -2.32
ATG17Q06410 tT(AGU)HtT(AGU)H 73 nt0.56□□□□□ -2.32
ATG17Q06410 tT(AGU)I1tT(AGU)I1 73 nt0.56□□□□□ -2.32
ATG17Q06410 tT(AGU)I2tT(AGU)I2 73 nt0.56□□□□□ -2.32
ATG17Q06410 tT(AGU)JtT(AGU)J 73 nt0.56□□□□□ -2.32
ATG17Q06410 tT(AGU)N1tT(AGU)N1 73 nt0.56□□□□□ -2.32
ATG17Q06410 tT(AGU)N2tT(AGU)N2 73 nt0.56□□□□□ -2.32
ATG17Q06410 tT(AGU)O1tT(AGU)O1 73 nt0.56□□□□□ -2.32
ATG17Q06410 tT(AGU)O2tT(AGU)O2 73 nt0.56□□□□□ -2.32
ATG17Q06410 UTP10YJL109C 5310 nt0.56□□□□□ -2.32
ATG17Q06410 PMP1YCR024C-A 123 nt0.55□□□□□ -2.32
ATG17Q06410 ECM12YHR021W-A 456 nt0.55□□□□□ -2.32
ATG17Q06410 YHR063W-AYHR063W-A 336 nt0.55□□□□□ -2.32
ATG17Q06410 YBR206WYBR206W 324 nt0.55□□□□□ -2.32
ATG17Q06410 YCK3YER123W 1575 nt0.54□□□□□ -2.32
ATG17Q06410 YLL007CYLL007C 1998 nt0.54□□□□□ -2.32
ATG17Q06410 YGR174W-AYGR174W-A 87 nt0.54□□□□□ -2.32
ATG17Q06410 RPS24BYIL069C 408 nt0.54□□□□□ -2.32
ATG17Q06410 RPL38YLR325C 237 nt0.54□□□□□ -2.32
ATG17Q06410 CHS6YJL099W 2241 nt0.54□□□□□ -2.32
ATG17Q06410 MCM10YIL150C 1716 nt0.53□□□□□ -2.32
ATG17Q06410 YIL142C-AYIL142C-A 333 nt0.53□□□□□ -2.32
ATG17Q06410 YPR002C-AYPR002C-A 198 nt0.51□□□□□ -2.33
ATG17Q06410 NPR2YEL062W 1848 nt0.5□□□□□ -2.33
ATG17Q06410 OLI1Q0130 231 nt0.5□□□□□ -2.33
ATG17Q06410 YML007C-AYML007C-A 111 nt0.5□□□□□ -2.33
ATG17Q06410 YPL044CYPL044C 549 nt0.5□□□□□ -2.33
ATG17Q06410 ASE1YOR058C 2658 nt0.49□□□□□ -2.33
ATG17Q06410 YLR456WYLR456W 615 nt0.49□□□□□ -2.33
ATG17Q06410 PTP2YOR208W 2253 nt0.48□□□□□ -2.33
ATG17Q06410 YPL185WYPL185W 396 nt0.47□□□□□ -2.33
ATG17Q06410 YDR426CYDR426C 378 nt0.46□□□□□ -2.34
ATG17Q06410 BSC3YLR465C 309 nt0.46□□□□□ -2.34
ATG17Q06410 YLR434CYLR434C 384 nt0.45□□□□□ -2.34
ATG17Q06410 YSP1YHR155W 3687 nt0.44□□□□□ -2.34
ATG17Q06410 YFR012W-AYFR012W-A 87 nt0.43□□□□□ -2.34
ATG17Q06410 INA22YIR024C 651 nt0.43□□□□□ -2.34
ATG17Q06410 YLR406C-AYLR406C-A 150 nt0.43□□□□□ -2.34
ATG17Q06410 YOR072W-AYOR072W-A 249 nt0.43□□□□□ -2.34
ATG17Q06410 OST1YJL002C 1431 nt0.42□□□□□ -2.34
ATG17Q06410 YOR218CYOR218C 420 nt0.42□□□□□ -2.34
ATG17Q06410 FYV10YIL097W 1551 nt0.41□□□□□ -2.34
ATG17Q06410 RPL26BYGR034W 384 nt0.41□□□□□ -2.34
ATG17Q06410 YIL134C-AYIL134C-A 204 nt0.41□□□□□ -2.34
ATG17Q06410 YJL007CYJL007C 315 nt0.4□□□□□ -2.35
ATG17Q06410 YOR029WYOR029W 336 nt0.4□□□□□ -2.35
ATG17Q06410 PAA1YDR071C 576 nt0.39□□□□□ -2.35
ATG17Q06410 PCC1YKR095W-A 267 nt0.39□□□□□ -2.35
ATG17Q06410 YNL211CYNL211C 261 nt0.39□□□□□ -2.35
ATG17Q06410 YOR053WYOR053W 342 nt0.39□□□□□ -2.35
ATG17Q06410 YMR160WYMR160W 2451 nt0.39□□□□□ -2.35
ATG17Q06410 SPO21YOL091W 1830 nt0.38□□□□□ -2.35
ATG17Q06410 YLR334CYLR334C 381 nt0.38□□□□□ -2.35
ATG17Q06410 YOR011W-AYOR011W-A 207 nt0.38□□□□□ -2.35
ATG17Q06410 YPL068CYPL068C 882 nt0.38□□□□□ -2.35
ATG17Q06410 YJL127W-AYJL127W-A 117 nt0.37□□□□□ -2.35
ATG17Q06410 VPS20YMR077C 666 nt0.36□□□□□ -2.35
ATG17Q06410 HMRA2YCR096C 360 nt0.35□□□□□ -2.35
ATG17Q06410 YKL063CYKL063C 504 nt0.35□□□□□ -2.35
ATG17Q06410 YPL205CYPL205C 345 nt0.35□□□□□ -2.35
ATG17Q06410 PRP5YBR237W 2550 nt0.35□□□□□ -2.35
ATG17Q06410 CSN9YDR179C 489 nt0.34□□□□□ -2.36
ATG17Q06410 YPR160W-AYPR160W-A 81 nt0.34□□□□□ -2.36
ATG17Q06410 HAL9YOL089C 3093 nt0.34□□□□□ -2.36
ATG17Q06410 SBH1YER087C-B 249 nt0.33□□□□□ -2.36
ATG17Q06410 PAU12YGR294W 363 nt0.33□□□□□ -2.36
ATG17Q06410 YJL120WYJL120W 324 nt0.33□□□□□ -2.36
ATG17Q06410 TAR1YLR154W-C 375 nt0.33□□□□□ -2.36
ATG17Q06410 ABF2YMR072W 552 nt0.33□□□□□ -2.36
ATG17Q06410 YPL225WYPL225W 441 nt0.33□□□□□ -2.36
ATG17Q06410 YHL046W-AYHL046W-A 327 nt0.32□□□□□ -2.36
ATG17Q06410 RPS30BYOR182C 192 nt0.32□□□□□ -2.36
ATG17Q06410 SGF11YPL047W 300 nt0.32□□□□□ -2.36
ATG17Q06410 PET111YMR257C 2403 nt0.32□□□□□ -2.36
ATG17Q06410 SEC8YPR055W 3198 nt0.31□□□□□ -2.36
ATG17Q06410 YER079WYER079W 633 nt0.31□□□□□ -2.36
ATG17Q06410 COX5BYIL111W 456 nt0.31□□□□□ -2.36
ATG17Q06410 RPS25BYLR333C 327 nt0.31□□□□□ -2.36
ATG17Q06410 BEM3YPL115C 3387 nt0.31□□□□□ -2.36
ATG17Q06410 YOR192C-BYOR192C-B 5313 nt0.31□□□□□ -2.36
ATG17Q06410 OST4YDL232W 111 nt0.3□□□□□ -2.36
ATG17Q06410 PRM3YPL192C 402 nt0.3□□□□□ -2.36
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 148.2 ms