Protein–RNA interactions for Protein: Q06336

GGA1, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA1, yeastyeast

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
GGA1Q06336 snR51snR51 107 nt0.31□□□□□ -2.36
GGA1Q06336 ESP1YGR098C 4893 nt0.31□□□□□ -2.36
GGA1Q06336 RAD34YDR314C 2079 nt0.31□□□□□ -2.36
GGA1Q06336 tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 73 nt0.3□□□□□ -2.36
GGA1Q06336 YIR044CYIR044C 186 nt0.3□□□□□ -2.36
GGA1Q06336 YNL054W-BYNL054W-B 5250 nt0.29□□□□□ -2.36
GGA1Q06336 BSC3YLR465C 309 nt0.29□□□□□ -2.36
GGA1Q06336 PBI2YNL015W 228 nt0.29□□□□□ -2.36
GGA1Q06336 snR78snR78 87 nt0.28□□□□□ -2.36
GGA1Q06336 SBH1YER087C-B 249 nt0.28□□□□□ -2.36
GGA1Q06336 EMC4YGL231C 573 nt0.28□□□□□ -2.36
GGA1Q06336 YOR192C-BYOR192C-B 5313 nt0.28□□□□□ -2.36
GGA1Q06336 YBL100W-BYBL100W-B 5313 nt0.28□□□□□ -2.37
GGA1Q06336 MCM10YIL150C 1716 nt0.27□□□□□ -2.37
GGA1Q06336 OLI1Q0130 231 nt0.27□□□□□ -2.37
GGA1Q06336 EAF6YJR082C 342 nt0.27□□□□□ -2.37
GGA1Q06336 YBL071CYBL071C 309 nt0.27□□□□□ -2.37
GGA1Q06336 PET111YMR257C 2403 nt0.27□□□□□ -2.37
GGA1Q06336 IQG1YPL242C 4488 nt0.26□□□□□ -2.37
GGA1Q06336 INP2YMR163C 2118 nt0.26□□□□□ -2.37
GGA1Q06336 AI1Q0050 2505 nt0.26□□□□□ -2.37
GGA1Q06336 YLR287CYLR287C 1068 nt0.26□□□□□ -2.37
GGA1Q06336 FYV10YIL097W 1551 nt0.26□□□□□ -2.37
GGA1Q06336 SDH7YDR511W 402 nt0.25□□□□□ -2.37
GGA1Q06336 YJL020W-AYJL020W-A 258 nt0.25□□□□□ -2.37
GGA1Q06336 YJL127W-AYJL127W-A 117 nt0.25□□□□□ -2.37
GGA1Q06336 YNL058CYNL058C 951 nt0.25□□□□□ -2.37
GGA1Q06336 PTP2YOR208W 2253 nt0.25□□□□□ -2.37
GGA1Q06336 YDL011CYDL011C 324 nt0.24□□□□□ -2.37
GGA1Q06336 YML108WYML108W 318 nt0.24□□□□□ -2.37
GGA1Q06336 YBR206WYBR206W 324 nt0.24□□□□□ -2.37
GGA1Q06336 YAP6YDR259C 1152 nt0.23□□□□□ -2.37
GGA1Q06336 PAU12YGR294W 363 nt0.23□□□□□ -2.37
GGA1Q06336 HUG1YML058W-A 207 nt0.23□□□□□ -2.37
GGA1Q06336 YPL229WYPL229W 621 nt0.23□□□□□ -2.37
GGA1Q06336 PAA1YDR071C 576 nt0.22□□□□□ -2.37
GGA1Q06336 YFR012W-AYFR012W-A 87 nt0.22□□□□□ -2.37
GGA1Q06336 YHL041WYHL041W 450 nt0.22□□□□□ -2.37
GGA1Q06336 YHR125WYHR125W 306 nt0.22□□□□□ -2.37
GGA1Q06336 MLP2YIL149C 5040 nt0.22□□□□□ -2.37
GGA1Q06336 SPO21YOL091W 1830 nt0.22□□□□□ -2.37
GGA1Q06336 MAM33YIL070C 801 nt0.21□□□□□ -2.38
GGA1Q06336 YKL145W-AYKL145W-A 93 nt0.21□□□□□ -2.38
GGA1Q06336 YPL185WYPL185W 396 nt0.21□□□□□ -2.38
GGA1Q06336 MLP1YKR095W 5628 nt0.21□□□□□ -2.38
GGA1Q06336 BEM3YPL115C 3387 nt0.2□□□□□ -2.38
GGA1Q06336 YJR011CYJR011C 786 nt0.2□□□□□ -2.38
GGA1Q06336 ZEO1YOL109W 342 nt0.2□□□□□ -2.38
GGA1Q06336 VIK1YPL253C 1944 nt0.2□□□□□ -2.38
GGA1Q06336 NIP100YPL174C 2607 nt0.19□□□□□ -2.38
GGA1Q06336 YER084W-AYER084W-A 513 nt0.19□□□□□ -2.38
GGA1Q06336 YKL083WYKL083W 615 nt0.19□□□□□ -2.38
GGA1Q06336 RPS20YHL015W 366 nt0.18□□□□□ -2.38
GGA1Q06336 YGR290WYGR290W 444 nt0.17□□□□□ -2.38
GGA1Q06336 AIM29YKR074W 468 nt0.17□□□□□ -2.38
GGA1Q06336 YOR192C-CYOR192C-C 237 nt0.17□□□□□ -2.38
GGA1Q06336 SEC8YPR055W 3198 nt0.17□□□□□ -2.38
GGA1Q06336 PRP5YBR237W 2550 nt0.17□□□□□ -2.38
GGA1Q06336 DIE2YGR227W 1578 nt0.16□□□□□ -2.38
GGA1Q06336 tF(GAA)BtF(GAA)B 73 nt0.16□□□□□ -2.38
GGA1Q06336 tF(GAA)FtF(GAA)F 73 nt0.16□□□□□ -2.38
GGA1Q06336 tF(GAA)GtF(GAA)G 73 nt0.16□□□□□ -2.38
GGA1Q06336 tF(GAA)H1tF(GAA)H1 73 nt0.16□□□□□ -2.38
GGA1Q06336 tF(GAA)H2tF(GAA)H2 73 nt0.16□□□□□ -2.38
GGA1Q06336 tF(GAA)MtF(GAA)M 73 nt0.16□□□□□ -2.38
GGA1Q06336 tF(GAA)P1tF(GAA)P1 73 nt0.16□□□□□ -2.38
GGA1Q06336 tF(GAA)P2tF(GAA)P2 73 nt0.16□□□□□ -2.38
GGA1Q06336 YHR130CYHR130C 336 nt0.16□□□□□ -2.38
GGA1Q06336 COX5BYIL111W 456 nt0.16□□□□□ -2.38
GGA1Q06336 YOL013W-AYOL013W-A 192 nt0.15□□□□□ -2.39
GGA1Q06336 MYO1YHR023W 5787 nt0.15□□□□□ -2.39
GGA1Q06336 YGR174W-AYGR174W-A 87 nt0.14□□□□□ -2.39
GGA1Q06336 TRS65YGR166W 1683 nt0.14□□□□□ -2.39
GGA1Q06336 HAL9YOL089C 3093 nt0.14□□□□□ -2.39
GGA1Q06336 ATG31YDR022C 591 nt0.13□□□□□ -2.39
GGA1Q06336 STE18YJR086W 333 nt0.13□□□□□ -2.39
GGA1Q06336 YAR047CYAR047C 321 nt0.13□□□□□ -2.39
GGA1Q06336 YMR321CYMR321C 318 nt0.13□□□□□ -2.39
GGA1Q06336 YPR160W-AYPR160W-A 81 nt0.13□□□□□ -2.39
GGA1Q06336 THO2YNL139C 4794 nt0.13□□□□□ -2.39
GGA1Q06336 OST4YDL232W 111 nt0.12□□□□□ -2.39
GGA1Q06336 snR54snR54 86 nt0.12□□□□□ -2.39
GGA1Q06336 PCF11YDR228C 1881 nt0.12□□□□□ -2.39
GGA1Q06336 YNL211CYNL211C 261 nt0.1□□□□□ -2.39
GGA1Q06336 PRP42YDR235W 1635 nt0.09□□□□□ -2.39
GGA1Q06336 COX12YLR038C 252 nt0.09□□□□□ -2.4
GGA1Q06336 YPR002C-AYPR002C-A 198 nt0.09□□□□□ -2.4
GGA1Q06336 CBS1YDL069C 690 nt0.08□□□□□ -2.4
GGA1Q06336 BI2Q0110 1272 nt0.08□□□□□ -2.4
GGA1Q06336 ECL1YGR146C 636 nt0.08□□□□□ -2.4
GGA1Q06336 YLR171WYLR171W 390 nt0.08□□□□□ -2.4
GGA1Q06336 YLR399W-AYLR399W-A 105 nt0.08□□□□□ -2.4
GGA1Q06336 YML007C-AYML007C-A 111 nt0.08□□□□□ -2.4
GGA1Q06336 RCO1YMR075W 2055 nt0.08□□□□□ -2.4
GGA1Q06336 YOL014WYOL014W 375 nt0.07□□□□□ -2.4
GGA1Q06336 YOR011W-AYOR011W-A 207 nt0.07□□□□□ -2.4
GGA1Q06336 YOR345CYOR345C 351 nt0.07□□□□□ -2.4
GGA1Q06336 ORC3YLL004W 1851 nt0.06□□□□□ -2.4
GGA1Q06336 HMRA2YCR096C 360 nt0.06□□□□□ -2.4
GGA1Q06336 YDR426CYDR426C 378 nt0.06□□□□□ -2.4
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 310.8 ms