Protein–RNA interactions for Protein: Q04235

TRM12, tRNA wybutosine-synthesizing protein 2, yeastyeast

Predictions only

Length 462 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TRM12Q04235 DIE2YGR227W 1578 nt0.57□□□□□ -2.32
TRM12Q04235 WIP1YDR374W-A 270 nt0.56□□□□□ -2.32
TRM12Q04235 YPL229WYPL229W 621 nt0.56□□□□□ -2.32
TRM12Q04235 snR51snR51 107 nt0.56□□□□□ -2.32
TRM12Q04235 PAN2YGL094C 3348 nt0.56□□□□□ -2.32
TRM12Q04235 snR72snR72 98 nt0.55□□□□□ -2.32
TRM12Q04235 YAL016C-BYAL016C-B 186 nt0.55□□□□□ -2.32
TRM12Q04235 YLR171WYLR171W 390 nt0.55□□□□□ -2.32
TRM12Q04235 YOL013W-BYOL013W-B 291 nt0.55□□□□□ -2.32
TRM12Q04235 YOR282WYOR282W 321 nt0.55□□□□□ -2.32
TRM12Q04235 YPL261CYPL261C 309 nt0.55□□□□□ -2.32
TRM12Q04235 CUL3YGR003W 2235 nt0.54□□□□□ -2.32
TRM12Q04235 YER006C-AYER006C-A 318 nt0.54□□□□□ -2.32
TRM12Q04235 YHR063W-AYHR063W-A 336 nt0.54□□□□□ -2.32
TRM12Q04235 FYV7YLR068W 456 nt0.54□□□□□ -2.32
TRM12Q04235 YNL058CYNL058C 951 nt0.54□□□□□ -2.32
TRM12Q04235 YOR218CYOR218C 420 nt0.54□□□□□ -2.32
TRM12Q04235 LOA1YPR139C 903 nt0.54□□□□□ -2.32
TRM12Q04235 SDH7YDR511W 402 nt0.53□□□□□ -2.32
TRM12Q04235 YKL145W-AYKL145W-A 93 nt0.53□□□□□ -2.32
TRM12Q04235 YOR192C-CYOR192C-C 237 nt0.53□□□□□ -2.32
TRM12Q04235 ULP2YIL031W 3105 nt0.53□□□□□ -2.33
TRM12Q04235 RAD34YDR314C 2079 nt0.52□□□□□ -2.33
TRM12Q04235 YHL041WYHL041W 450 nt0.52□□□□□ -2.33
TRM12Q04235 YIR044CYIR044C 186 nt0.52□□□□□ -2.33
TRM12Q04235 YKL083WYKL083W 615 nt0.52□□□□□ -2.33
TRM12Q04235 INP2YMR163C 2118 nt0.52□□□□□ -2.33
TRM12Q04235 YAR047CYAR047C 321 nt0.51□□□□□ -2.33
TRM12Q04235 snR41snR41 95 nt0.51□□□□□ -2.33
TRM12Q04235 YML002WYML002W 2214 nt0.5□□□□□ -2.33
TRM12Q04235 YGR174W-AYGR174W-A 87 nt0.5□□□□□ -2.33
TRM12Q04235 YHL042WYHL042W 453 nt0.5□□□□□ -2.33
TRM12Q04235 ECM12YHR021W-A 456 nt0.5□□□□□ -2.33
TRM12Q04235 snR189snR189 189 nt0.5□□□□□ -2.33
TRM12Q04235 FMP27YLR454W 7887 nt0.5□□□□□ -2.33
TRM12Q04235 BFR2YDR299W 1605 nt0.49□□□□□ -2.33
TRM12Q04235 CBS1YDL069C 690 nt0.49□□□□□ -2.33
TRM12Q04235 YOL014WYOL014W 375 nt0.49□□□□□ -2.33
TRM12Q04235 YLL007CYLL007C 1998 nt0.48□□□□□ -2.33
TRM12Q04235 YDR344CYDR344C 444 nt0.48□□□□□ -2.33
TRM12Q04235 YLR101CYLR101C 396 nt0.48□□□□□ -2.33
TRM12Q04235 YBL008W-AYBL008W-A 240 nt0.48□□□□□ -2.33
TRM12Q04235 TOM22YNL131W 459 nt0.48□□□□□ -2.33
TRM12Q04235 PCF11YDR228C 1881 nt0.48□□□□□ -2.33
TRM12Q04235 RPL38YLR325C 237 nt0.47□□□□□ -2.33
TRM12Q04235 YAP6YDR259C 1152 nt0.46□□□□□ -2.34
TRM12Q04235 PTP2YOR208W 2253 nt0.46□□□□□ -2.34
TRM12Q04235 MAM33YIL070C 801 nt0.45□□□□□ -2.34
TRM12Q04235 RPL26AYLR344W 384 nt0.45□□□□□ -2.34
TRM12Q04235 YNL303WYNL303W 348 nt0.45□□□□□ -2.34
TRM12Q04235 NPR2YEL062W 1848 nt0.45□□□□□ -2.34
TRM12Q04235 PMP1YCR024C-A 123 nt0.44□□□□□ -2.34
TRM12Q04235 YEL030C-AYEL030C-A 315 nt0.44□□□□□ -2.34
TRM12Q04235 YPL044CYPL044C 549 nt0.44□□□□□ -2.34
TRM12Q04235 NOP9YJL010C 2001 nt0.43□□□□□ -2.34
TRM12Q04235 YSP1YHR155W 3687 nt0.43□□□□□ -2.34
TRM12Q04235 ATG31YDR022C 591 nt0.42□□□□□ -2.34
TRM12Q04235 OLI1Q0130 231 nt0.42□□□□□ -2.34
TRM12Q04235 YML007C-AYML007C-A 111 nt0.42□□□□□ -2.34
TRM12Q04235 ISF1YMR081C 1017 nt0.42□□□□□ -2.34
TRM12Q04235 YBR064WYBR064W 429 nt0.42□□□□□ -2.34
TRM12Q04235 TRS65YGR166W 1683 nt0.42□□□□□ -2.34
TRM12Q04235 LTE1YAL024C 4308 nt0.42□□□□□ -2.34
TRM12Q04235 AI1Q0050 2505 nt0.41□□□□□ -2.34
TRM12Q04235 CHS6YJL099W 2241 nt0.41□□□□□ -2.34
TRM12Q04235 RPS20YHL015W 366 nt0.41□□□□□ -2.34
TRM12Q04235 YJR011CYJR011C 786 nt0.41□□□□□ -2.34
TRM12Q04235 MRPL50YNR022C 420 nt0.41□□□□□ -2.34
TRM12Q04235 YPL185WYPL185W 396 nt0.41□□□□□ -2.34
TRM12Q04235 YPR002C-AYPR002C-A 198 nt0.41□□□□□ -2.34
TRM12Q04235 UBC7YMR022W 498 nt0.4□□□□□ -2.35
TRM12Q04235 MCM10YIL150C 1716 nt0.38□□□□□ -2.35
TRM12Q04235 SPO21YOL091W 1830 nt0.38□□□□□ -2.35
TRM12Q04235 PAA1YDR071C 576 nt0.38□□□□□ -2.35
TRM12Q04235 YDR426CYDR426C 378 nt0.38□□□□□ -2.35
TRM12Q04235 BSC3YLR465C 309 nt0.38□□□□□ -2.35
TRM12Q04235 YBR206WYBR206W 324 nt0.38□□□□□ -2.35
TRM12Q04235 NIP100YPL174C 2607 nt0.37□□□□□ -2.35
TRM12Q04235 RPS24BYIL069C 408 nt0.37□□□□□ -2.35
TRM12Q04235 RPL26BYGR034W 384 nt0.36□□□□□ -2.35
TRM12Q04235 YIL134C-AYIL134C-A 204 nt0.36□□□□□ -2.35
TRM12Q04235 YLR456WYLR456W 615 nt0.36□□□□□ -2.35
TRM12Q04235 ATP19YOL077W-A 207 nt0.36□□□□□ -2.35
TRM12Q04235 IQG1YPL242C 4488 nt0.36□□□□□ -2.35
TRM12Q04235 PCC1YKR095W-A 267 nt0.35□□□□□ -2.35
TRM12Q04235 YOR192C-BYOR192C-B 5313 nt0.34□□□□□ -2.35
TRM12Q04235 HMRA2YCR096C 360 nt0.34□□□□□ -2.36
TRM12Q04235 YJL127W-AYJL127W-A 117 nt0.32□□□□□ -2.36
TRM12Q04235 YOR011W-AYOR011W-A 207 nt0.31□□□□□ -2.36
TRM12Q04235 YOR053WYOR053W 342 nt0.31□□□□□ -2.36
TRM12Q04235 BEM3YPL115C 3387 nt0.31□□□□□ -2.36
TRM12Q04235 PET111YMR257C 2403 nt0.3□□□□□ -2.36
TRM12Q04235 COX5BYIL111W 456 nt0.3□□□□□ -2.36
TRM12Q04235 YKL063CYKL063C 504 nt0.3□□□□□ -2.36
TRM12Q04235 ABF2YMR072W 552 nt0.3□□□□□ -2.36
TRM12Q04235 YPL068CYPL068C 882 nt0.3□□□□□ -2.36
TRM12Q04235 FYV10YIL097W 1551 nt0.3□□□□□ -2.36
TRM12Q04235 BIR1YJR089W 2865 nt0.3□□□□□ -2.36
TRM12Q04235 YNL211CYNL211C 261 nt0.29□□□□□ -2.36
TRM12Q04235 SEC8YPR055W 3198 nt0.28□□□□□ -2.36
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