Protein–RNA interactions for Protein: Q04116

YHP1, Homeobox protein YHP1, yeastyeast

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YHP1Q04116 TIM13YGR181W 318 nt0.23□□□□□ -2.37
YHP1Q04116 YKL202WYKL202W 582 nt0.23□□□□□ -2.37
YHP1Q04116 YPL044CYPL044C 549 nt0.23□□□□□ -2.37
YHP1Q04116 YBR076C-AYBR076C-A 267 nt0.23□□□□□ -2.37
YHP1Q04116 BIR1YJR089W 2865 nt0.22□□□□□ -2.37
YHP1Q04116 RAD34YDR314C 2079 nt0.22□□□□□ -2.37
YHP1Q04116 YEL030C-AYEL030C-A 315 nt0.22□□□□□ -2.37
YHP1Q04116 YLR269CYLR269C 351 nt0.22□□□□□ -2.37
YHP1Q04116 ESP1YGR098C 4893 nt0.21□□□□□ -2.38
YHP1Q04116 EMC4YGL231C 573 nt0.21□□□□□ -2.38
YHP1Q04116 RPL26AYLR344W 384 nt0.21□□□□□ -2.38
YHP1Q04116 YBR064WYBR064W 429 nt0.21□□□□□ -2.38
YHP1Q04116 YPL261CYPL261C 309 nt0.21□□□□□ -2.38
YHP1Q04116 MCM10YIL150C 1716 nt0.21□□□□□ -2.38
YHP1Q04116 YCR001WYCR001W 315 nt0.2□□□□□ -2.38
YHP1Q04116 YFL012WYFL012W 447 nt0.2□□□□□ -2.38
YHP1Q04116 YMR321CYMR321C 318 nt0.2□□□□□ -2.38
YHP1Q04116 GPI15YNL038W 690 nt0.2□□□□□ -2.38
YHP1Q04116 OLI1Q0130 231 nt0.19□□□□□ -2.38
YHP1Q04116 YGR290WYGR290W 444 nt0.19□□□□□ -2.38
YHP1Q04116 YJL127W-AYJL127W-A 117 nt0.19□□□□□ -2.38
YHP1Q04116 snR51snR51 107 nt0.19□□□□□ -2.38
YHP1Q04116 CUL3YGR003W 2235 nt0.19□□□□□ -2.38
YHP1Q04116 STE5YDR103W 2754 nt0.19□□□□□ -2.38
YHP1Q04116 PET111YMR257C 2403 nt0.18□□□□□ -2.38
YHP1Q04116 RPF1YHR088W 888 nt0.18□□□□□ -2.38
YHP1Q04116 NFU1YKL040C 771 nt0.18□□□□□ -2.38
YHP1Q04116 INP2YMR163C 2118 nt0.18□□□□□ -2.38
YHP1Q04116 BEM3YPL115C 3387 nt0.18□□□□□ -2.38
YHP1Q04116 FYV10YIL097W 1551 nt0.17□□□□□ -2.38
YHP1Q04116 YNL054W-BYNL054W-B 5250 nt0.16□□□□□ -2.38
YHP1Q04116 MLP2YIL149C 5040 nt0.16□□□□□ -2.38
YHP1Q04116 SDH7YDR511W 402 nt0.16□□□□□ -2.38
YHP1Q04116 YIR044CYIR044C 186 nt0.16□□□□□ -2.38
YHP1Q04116 YNL319WYNL319W 441 nt0.16□□□□□ -2.38
YHP1Q04116 YOR192C-BYOR192C-B 5313 nt0.15□□□□□ -2.39
YHP1Q04116 SEC8YPR055W 3198 nt0.14□□□□□ -2.39
YHP1Q04116 THO2YNL139C 4794 nt0.14□□□□□ -2.39
YHP1Q04116 YAP6YDR259C 1152 nt0.14□□□□□ -2.39
YHP1Q04116 YJL020W-AYJL020W-A 258 nt0.14□□□□□ -2.39
YHP1Q04116 PBI2YNL015W 228 nt0.14□□□□□ -2.39
YHP1Q04116 YBR206WYBR206W 324 nt0.14□□□□□ -2.39
YHP1Q04116 VIK1YPL253C 1944 nt0.13□□□□□ -2.39
YHP1Q04116 YDL011CYDL011C 324 nt0.13□□□□□ -2.39
YHP1Q04116 YER078W-AYER078W-A 165 nt0.13□□□□□ -2.39
YHP1Q04116 YFR012W-AYFR012W-A 87 nt0.13□□□□□ -2.39
YHP1Q04116 YKL123WYKL123W 381 nt0.13□□□□□ -2.39
YHP1Q04116 YBL071CYBL071C 309 nt0.13□□□□□ -2.39
YHP1Q04116 YHL041WYHL041W 450 nt0.12□□□□□ -2.39
YHP1Q04116 MAM33YIL070C 801 nt0.12□□□□□ -2.39
YHP1Q04116 YJR011CYJR011C 786 nt0.11□□□□□ -2.39
YHP1Q04116 YML108WYML108W 318 nt0.11□□□□□ -2.39
YHP1Q04116 YOL013W-AYOL013W-A 192 nt0.11□□□□□ -2.39
YHP1Q04116 PTP2YOR208W 2253 nt0.1□□□□□ -2.39
YHP1Q04116 YPL185WYPL185W 396 nt0.1□□□□□ -2.39
YHP1Q04116 SPO21YOL091W 1830 nt0.1□□□□□ -2.39
YHP1Q04116 MLP1YKR095W 5628 nt0.09□□□□□ -2.39
YHP1Q04116 PAA1YDR071C 576 nt0.09□□□□□ -2.4
YHP1Q04116 tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 73 nt0.09□□□□□ -2.4
YHP1Q04116 EAF6YJR082C 342 nt0.09□□□□□ -2.4
YHP1Q04116 ASE1YOR058C 2658 nt0.08□□□□□ -2.4
YHP1Q04116 YLR287CYLR287C 1068 nt0.08□□□□□ -2.4
YHP1Q04116 YNL058CYNL058C 951 nt0.08□□□□□ -2.4
YHP1Q04116 YOR192C-CYOR192C-C 237 nt0.08□□□□□ -2.4
YHP1Q04116 YPL229WYPL229W 621 nt0.08□□□□□ -2.4
YHP1Q04116 PRP5YBR237W 2550 nt0.07□□□□□ -2.4
YHP1Q04116 YER084W-AYER084W-A 513 nt0.07□□□□□ -2.4
YHP1Q04116 YHR125WYHR125W 306 nt0.07□□□□□ -2.4
YHP1Q04116 COX5BYIL111W 456 nt0.07□□□□□ -2.4
YHP1Q04116 YKL083WYKL083W 615 nt0.07□□□□□ -2.4
YHP1Q04116 ZEO1YOL109W 342 nt0.07□□□□□ -2.4
YHP1Q04116 BUL2YML111W 2763 nt0.06□□□□□ -2.4
YHP1Q04116 snR78snR78 87 nt0.06□□□□□ -2.4
YHP1Q04116 RPS20YHL015W 366 nt0.06□□□□□ -2.4
YHP1Q04116 AIM29YKR074W 468 nt0.06□□□□□ -2.4
YHP1Q04116 YPR160W-AYPR160W-A 81 nt0.06□□□□□ -2.4
YHP1Q04116 YBL100W-BYBL100W-B 5313 nt0.06□□□□□ -2.4
YHP1Q04116 OST4YDL232W 111 nt0.05□□□□□ -2.4
YHP1Q04116 YNL211CYNL211C 261 nt0.05□□□□□ -2.4
YHP1Q04116 COX12YLR038C 252 nt0.04□□□□□ -2.4
YHP1Q04116 YLR171WYLR171W 390 nt0.04□□□□□ -2.4
YHP1Q04116 PRP42YDR235W 1635 nt0.04□□□□□ -2.4
YHP1Q04116 ATG31YDR022C 591 nt0.03□□□□□ -2.4
YHP1Q04116 ORC3YLL004W 1851 nt0.03□□□□□ -2.41
YHP1Q04116 DIE2YGR227W 1578 nt0.02□□□□□ -2.41
YHP1Q04116 NIP100YPL174C 2607 nt0.02□□□□□ -2.41
YHP1Q04116 PCF11YDR228C 1881 nt0□□□□□ -2.41
YHP1Q04116 YAL067W-AYAL067W-A 228 nt0□□□□□ -2.41
YHP1Q04116 YLR399W-AYLR399W-A 105 nt0□□□□□ -2.41
YHP1Q04116 YPR002C-AYPR002C-A 198 nt0□□□□□ -2.41
YHP1Q04116 YDR371C-AYDR371C-A 105 nt-0.01□□□□□ -2.41
YHP1Q04116 YHL046W-AYHL046W-A 327 nt-0.01□□□□□ -2.41
YHP1Q04116 STE18YJR086W 333 nt-0.01□□□□□ -2.41
YHP1Q04116 YAR047CYAR047C 321 nt-0.01□□□□□ -2.41
YHP1Q04116 YOR011W-AYOR011W-A 207 nt-0.01□□□□□ -2.41
YHP1Q04116 YOR345CYOR345C 351 nt-0.01□□□□□ -2.41
YHP1Q04116 LEE1YPL054W 906 nt-0.01□□□□□ -2.41
YHP1Q04116 CBS1YDL069C 690 nt-0.02□□□□□ -2.41
YHP1Q04116 YGR174W-AYGR174W-A 87 nt-0.02□□□□□ -2.41
YHP1Q04116 snR45snR45 172 nt-0.02□□□□□ -2.41
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 67.3 ms