Protein–RNA interactions for Protein: Q02983

RRN5, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN5, yeastyeast

Predictions only

Length 363 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RRN5Q02983 WIP1YDR374W-A 270 nt0.39□□□□□ -2.35
RRN5Q02983 YHR125WYHR125W 306 nt0.39□□□□□ -2.35
RRN5Q02983 ABF2YMR072W 552 nt0.38□□□□□ -2.35
RRN5Q02983 snR51snR51 107 nt0.38□□□□□ -2.35
RRN5Q02983 BEM3YPL115C 3387 nt0.38□□□□□ -2.35
RRN5Q02983 YDL011CYDL011C 324 nt0.37□□□□□ -2.35
RRN5Q02983 YER084W-AYER084W-A 513 nt0.37□□□□□ -2.35
RRN5Q02983 YJL020W-AYJL020W-A 258 nt0.37□□□□□ -2.35
RRN5Q02983 YML108WYML108W 318 nt0.37□□□□□ -2.35
RRN5Q02983 YBL071CYBL071C 309 nt0.37□□□□□ -2.35
RRN5Q02983 BSC3YLR465C 309 nt0.36□□□□□ -2.35
RRN5Q02983 BIR1YJR089W 2865 nt0.35□□□□□ -2.35
RRN5Q02983 MLP1YKR095W 5628 nt0.35□□□□□ -2.35
RRN5Q02983 IQG1YPL242C 4488 nt0.35□□□□□ -2.35
RRN5Q02983 tF(GAA)BtF(GAA)B 73 nt0.35□□□□□ -2.35
RRN5Q02983 tF(GAA)FtF(GAA)F 73 nt0.35□□□□□ -2.35
RRN5Q02983 tF(GAA)GtF(GAA)G 73 nt0.35□□□□□ -2.35
RRN5Q02983 tF(GAA)H1tF(GAA)H1 73 nt0.35□□□□□ -2.35
RRN5Q02983 tF(GAA)H2tF(GAA)H2 73 nt0.35□□□□□ -2.35
RRN5Q02983 tF(GAA)MtF(GAA)M 73 nt0.35□□□□□ -2.35
RRN5Q02983 tF(GAA)P1tF(GAA)P1 73 nt0.35□□□□□ -2.35
RRN5Q02983 tF(GAA)P2tF(GAA)P2 73 nt0.35□□□□□ -2.35
RRN5Q02983 EMC4YGL231C 573 nt0.35□□□□□ -2.35
RRN5Q02983 RPL26BYGR034W 384 nt0.35□□□□□ -2.35
RRN5Q02983 RPS24BYIL069C 408 nt0.35□□□□□ -2.35
RRN5Q02983 SDH7YDR511W 402 nt0.34□□□□□ -2.36
RRN5Q02983 ESP1YGR098C 4893 nt0.34□□□□□ -2.36
RRN5Q02983 STE18YJR086W 333 nt0.34□□□□□ -2.36
RRN5Q02983 YBL008W-AYBL008W-A 240 nt0.34□□□□□ -2.36
RRN5Q02983 YBR064WYBR064W 429 nt0.34□□□□□ -2.36
RRN5Q02983 MLP2YIL149C 5040 nt0.33□□□□□ -2.36
RRN5Q02983 STE5YDR103W 2754 nt0.33□□□□□ -2.36
RRN5Q02983 YLR287CYLR287C 1068 nt0.33□□□□□ -2.36
RRN5Q02983 AI1Q0050 2505 nt0.33□□□□□ -2.36
RRN5Q02983 INP2YMR163C 2118 nt0.32□□□□□ -2.36
RRN5Q02983 SBH1YER087C-B 249 nt0.32□□□□□ -2.36
RRN5Q02983 AIM29YKR074W 468 nt0.32□□□□□ -2.36
RRN5Q02983 ZEO1YOL109W 342 nt0.32□□□□□ -2.36
RRN5Q02983 YPL229WYPL229W 621 nt0.32□□□□□ -2.36
RRN5Q02983 FYV10YIL097W 1551 nt0.32□□□□□ -2.36
RRN5Q02983 YAP6YDR259C 1152 nt0.31□□□□□ -2.36
RRN5Q02983 OLI1Q0130 231 nt0.31□□□□□ -2.36
RRN5Q02983 RPS20YHL015W 366 nt0.31□□□□□ -2.36
RRN5Q02983 YJL127W-AYJL127W-A 117 nt0.31□□□□□ -2.36
RRN5Q02983 YNR025CYNR025C 360 nt0.31□□□□□ -2.36
RRN5Q02983 PTP2YOR208W 2253 nt0.3□□□□□ -2.36
RRN5Q02983 YHR130CYHR130C 336 nt0.3□□□□□ -2.36
RRN5Q02983 YNL058CYNL058C 951 nt0.3□□□□□ -2.36
RRN5Q02983 DIE2YGR227W 1578 nt0.3□□□□□ -2.36
RRN5Q02983 MCM10YIL150C 1716 nt0.3□□□□□ -2.36
RRN5Q02983 MAM33YIL070C 801 nt0.29□□□□□ -2.36
RRN5Q02983 YKL145W-AYKL145W-A 93 nt0.29□□□□□ -2.36
RRN5Q02983 YOR192C-CYOR192C-C 237 nt0.29□□□□□ -2.36
RRN5Q02983 PET111YMR257C 2403 nt0.28□□□□□ -2.36
RRN5Q02983 PAA1YDR071C 576 nt0.28□□□□□ -2.36
RRN5Q02983 YHL041WYHL041W 450 nt0.28□□□□□ -2.36
RRN5Q02983 YKL083WYKL083W 615 nt0.27□□□□□ -2.37
RRN5Q02983 YBR206WYBR206W 324 nt0.27□□□□□ -2.37
RRN5Q02983 NIP100YPL174C 2607 nt0.27□□□□□ -2.37
RRN5Q02983 BI2Q0110 1272 nt0.26□□□□□ -2.37
RRN5Q02983 YJR011CYJR011C 786 nt0.26□□□□□ -2.37
RRN5Q02983 snR54snR54 86 nt0.26□□□□□ -2.37
RRN5Q02983 VIK1YPL253C 1944 nt0.25□□□□□ -2.37
RRN5Q02983 ATG31YDR022C 591 nt0.25□□□□□ -2.37
RRN5Q02983 SEC8YPR055W 3198 nt0.25□□□□□ -2.37
RRN5Q02983 SPO21YOL091W 1830 nt0.24□□□□□ -2.37
RRN5Q02983 PAU12YGR294W 363 nt0.24□□□□□ -2.37
RRN5Q02983 ASE1YOR058C 2658 nt0.24□□□□□ -2.37
RRN5Q02983 CBS1YDL069C 690 nt0.23□□□□□ -2.37
RRN5Q02983 ECL1YGR146C 636 nt0.23□□□□□ -2.37
RRN5Q02983 YNL122CYNL122C 348 nt0.23□□□□□ -2.37
RRN5Q02983 TRS65YGR166W 1683 nt0.22□□□□□ -2.37
RRN5Q02983 YAR047CYAR047C 321 nt0.22□□□□□ -2.37
RRN5Q02983 HAL9YOL089C 3093 nt0.22□□□□□ -2.37
RRN5Q02983 YFR012W-AYFR012W-A 87 nt0.21□□□□□ -2.38
RRN5Q02983 YLR171WYLR171W 390 nt0.21□□□□□ -2.38
RRN5Q02983 THO2YNL139C 4794 nt0.2□□□□□ -2.38
RRN5Q02983 YGR174W-AYGR174W-A 87 nt0.2□□□□□ -2.38
RRN5Q02983 YOL013W-AYOL013W-A 192 nt0.2□□□□□ -2.38
RRN5Q02983 YOL014WYOL014W 375 nt0.2□□□□□ -2.38
RRN5Q02983 YPR160W-AYPR160W-A 81 nt0.2□□□□□ -2.38
RRN5Q02983 YNL054W-BYNL054W-B 5250 nt0.2□□□□□ -2.38
RRN5Q02983 PCF11YDR228C 1881 nt0.2□□□□□ -2.38
RRN5Q02983 ISF1YMR081C 1017 nt0.19□□□□□ -2.38
RRN5Q02983 YPR002C-AYPR002C-A 198 nt0.19□□□□□ -2.38
RRN5Q02983 QCR9YGR183C 201 nt0.18□□□□□ -2.38
RRN5Q02983 YGR290WYGR290W 444 nt0.18□□□□□ -2.38
RRN5Q02983 YML007C-AYML007C-A 111 nt0.18□□□□□ -2.38
RRN5Q02983 YLR101CYLR101C 396 nt0.17□□□□□ -2.38
RRN5Q02983 YLR399W-AYLR399W-A 105 nt0.17□□□□□ -2.38
RRN5Q02983 PRP5YBR237W 2550 nt0.17□□□□□ -2.38
RRN5Q02983 YER006C-AYER006C-A 318 nt0.16□□□□□ -2.38
RRN5Q02983 COX5BYIL111W 456 nt0.16□□□□□ -2.38
RRN5Q02983 FYV7YLR068W 456 nt0.16□□□□□ -2.38
RRN5Q02983 YNL211CYNL211C 261 nt0.16□□□□□ -2.38
RRN5Q02983 OST4YDL232W 111 nt0.15□□□□□ -2.39
RRN5Q02983 YAL067W-AYAL067W-A 228 nt0.15□□□□□ -2.39
RRN5Q02983 MRPL50YNR022C 420 nt0.15□□□□□ -2.39
RRN5Q02983 YHL046W-AYHL046W-A 327 nt0.14□□□□□ -2.39
RRN5Q02983 YOR053WYOR053W 342 nt0.14□□□□□ -2.39
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 22.1 ms