Protein–RNA interactions for Protein: Q02785

PDR12, ATP-dependent permease PDR12, yeastyeast

Predictions only

Length 1,511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PDR12Q02785 tA(UGC)QtA(UGC)Q 76 nt-1.4□□□□□ -2.63
PDR12Q02785 YLR198CYLR198C 360 nt-1.4□□□□□ -2.63
PDR12Q02785 YMR158W-BYMR158W-B 321 nt-1.41□□□□□ -2.64
PDR12Q02785 YAP6YDR259C 1152 nt-1.42□□□□□ -2.64
PDR12Q02785 YMR153C-AYMR153C-A 336 nt-1.42□□□□□ -2.64
PDR12Q02785 ATP20YPR020W 348 nt-1.42□□□□□ -2.64
PDR12Q02785 YPR099CYPR099C 357 nt-1.42□□□□□ -2.64
PDR12Q02785 RSM23YGL129C 1353 nt-1.43□□□□□ -2.64
PDR12Q02785 ZIP2YGL249W 2115 nt-1.43□□□□□ -2.64
PDR12Q02785 tN(GUU)QtN(GUU)Q 71 nt-1.43□□□□□ -2.64
PDR12Q02785 YHL046W-AYHL046W-A 327 nt-1.44□□□□□ -2.64
PDR12Q02785 YLR146W-AYLR146W-A 189 nt-1.44□□□□□ -2.64
PDR12Q02785 YMR290W-AYMR290W-A 348 nt-1.44□□□□□ -2.64
PDR12Q02785 YER076W-AYER076W-A 348 nt-1.45□□□□□ -2.64
PDR12Q02785 CMS1YLR003C 876 nt-1.45□□□□□ -2.64
PDR12Q02785 YPR142CYPR142C 564 nt-1.45□□□□□ -2.64
PDR12Q02785 PAN3YKL025C 2040 nt-1.45□□□□□ -2.64
PDR12Q02785 15S_rRNA15S_rRNA 1649 nt-1.45□□□□□ -2.64
PDR12Q02785 EST1YLR233C 2100 nt-1.45□□□□□ -2.64
PDR12Q02785 YGR204C-AYGR204C-A 114 nt-1.45□□□□□ -2.64
PDR12Q02785 YJL135WYJL135W 318 nt-1.46□□□□□ -2.64
PDR12Q02785 YGL042CYGL042C 306 nt-1.47□□□□□ -2.64
PDR12Q02785 YHR138CYHR138C 345 nt-1.47□□□□□ -2.64
PDR12Q02785 PSF2YJL072C 642 nt-1.47□□□□□ -2.64
PDR12Q02785 YNL162W-AYNL162W-A 219 nt-1.47□□□□□ -2.64
PDR12Q02785 SDS22YKL193C 1017 nt-1.48□□□□□ -2.65
PDR12Q02785 YER138W-AYER138W-A 105 nt-1.5□□□□□ -2.65
PDR12Q02785 YCR024C-BYCR024C-B 267 nt-1.5□□□□□ -2.65
PDR12Q02785 YLR282CYLR282C 342 nt-1.5□□□□□ -2.65
PDR12Q02785 SPO21YOL091W 1830 nt-1.51□□□□□ -2.65
PDR12Q02785 YER158W-AYER158W-A 216 nt-1.51□□□□□ -2.65
PDR12Q02785 PFS1YHR185C 714 nt-1.51□□□□□ -2.65
PDR12Q02785 snR79snR79 84 nt-1.52□□□□□ -2.65
PDR12Q02785 YBL008W-AYBL008W-A 240 nt-1.54□□□□□ -2.66
PDR12Q02785 QCR7YDR529C 384 nt-1.55□□□□□ -2.66
PDR12Q02785 YJL086CYJL086C 369 nt-1.55□□□□□ -2.66
PDR12Q02785 ATG31YDR022C 591 nt-1.56□□□□□ -2.66
PDR12Q02785 YKL068W-AYKL068W-A 237 nt-1.56□□□□□ -2.66
PDR12Q02785 PBI2YNL015W 228 nt-1.56□□□□□ -2.66
PDR12Q02785 YOL160WYOL160W 342 nt-1.56□□□□□ -2.66
PDR12Q02785 YBR099CYBR099C 384 nt-1.56□□□□□ -2.66
PDR12Q02785 RSM18YER050C 417 nt-1.56□□□□□ -2.66
PDR12Q02785 YER079WYER079W 633 nt-1.58□□□□□ -2.66
PDR12Q02785 snR24snR24 89 nt-1.58□□□□□ -2.66
PDR12Q02785 YHR054CYHR054C 1065 nt-1.59□□□□□ -2.66
PDR12Q02785 YGL258W-AYGL258W-A 234 nt-1.6□□□□□ -2.67
PDR12Q02785 GPX1YKL026C 504 nt-1.6□□□□□ -2.67
PDR12Q02785 YLR171WYLR171W 390 nt-1.61□□□□□ -2.67
PDR12Q02785 PET20YPL159C 762 nt-1.61□□□□□ -2.67
PDR12Q02785 PCF11YDR228C 1881 nt-1.61□□□□□ -2.67
PDR12Q02785 CMC1YKL137W 336 nt-1.62□□□□□ -2.67
PDR12Q02785 YLR041WYLR041W 321 nt-1.62□□□□□ -2.67
PDR12Q02785 YML108WYML108W 318 nt-1.64□□□□□ -2.67
PDR12Q02785 YMR307C-AYMR307C-A 195 nt-1.64□□□□□ -2.67
PDR12Q02785 YFL063WYFL063W 456 nt-1.66□□□□□ -2.67
PDR12Q02785 YKL111CYKL111C 336 nt-1.66□□□□□ -2.67
PDR12Q02785 RPF1YHR088W 888 nt-1.66□□□□□ -2.68
PDR12Q02785 YOL029CYOL029C 606 nt-1.66□□□□□ -2.68
PDR12Q02785 YDR269CYDR269C 324 nt-1.68□□□□□ -2.68
PDR12Q02785 YIR044CYIR044C 186 nt-1.68□□□□□ -2.68
PDR12Q02785 DCP1YOL149W 696 nt-1.68□□□□□ -2.68
PDR12Q02785 YJR140W-AYJR140W-A 150 nt-1.69□□□□□ -2.68
PDR12Q02785 YMR254CYMR254C 309 nt-1.7□□□□□ -2.68
PDR12Q02785 YDL185C-AYDL185C-A 228 nt-1.71□□□□□ -2.68
PDR12Q02785 THG1YGR024C 714 nt-1.71□□□□□ -2.68
PDR12Q02785 tT(UGU)Q1tT(UGU)Q1 76 nt-1.71□□□□□ -2.68
PDR12Q02785 YPL261CYPL261C 309 nt-1.71□□□□□ -2.68
PDR12Q02785 SNU13YEL026W 381 nt-1.71□□□□□ -2.68
PDR12Q02785 LSM4YER112W 564 nt-1.74□□□□□ -2.69
PDR12Q02785 YHL041WYHL041W 450 nt-1.74□□□□□ -2.69
PDR12Q02785 YML100W-AYML100W-A 174 nt-1.74□□□□□ -2.69
PDR12Q02785 COX7YMR256C 183 nt-1.74□□□□□ -2.69
PDR12Q02785 SDH7YDR511W 402 nt-1.76□□□□□ -2.69
PDR12Q02785 YDR290WYDR290W 330 nt-1.76□□□□□ -2.69
PDR12Q02785 YGL123C-AYGL123C-A 231 nt-1.76□□□□□ -2.69
PDR12Q02785 YGR228WYGR228W 345 nt-1.76□□□□□ -2.69
PDR12Q02785 LRP1YHR081W 555 nt-1.77□□□□□ -2.69
PDR12Q02785 DFG10YIL049W 762 nt-1.77□□□□□ -2.69
PDR12Q02785 YJL182CYJL182C 318 nt-1.77□□□□□ -2.69
PDR12Q02785 TAR1YLR154W-C 375 nt-1.78□□□□□ -2.69
PDR12Q02785 PAU9YBL108C-A 129 nt-1.78□□□□□ -2.69
PDR12Q02785 VPS63YLR261C 327 nt-1.8□□□□□ -2.7
PDR12Q02785 RPS10BYMR230W 318 nt-1.81□□□□□ -2.7
PDR12Q02785 SKI7YOR076C 2244 nt-1.81□□□□□ -2.7
PDR12Q02785 YCR018C-AYCR018C-A 255 nt-1.82□□□□□ -2.7
PDR12Q02785 YGL182CYGL182C 324 nt-1.82□□□□□ -2.7
PDR12Q02785 tP(UGG)QtP(UGG)Q 72 nt-1.82□□□□□ -2.7
PDR12Q02785 YIL032CYIL032C 357 nt-1.82□□□□□ -2.7
PDR12Q02785 APQ13YJL075C 417 nt-1.82□□□□□ -2.7
PDR12Q02785 BLI1YKL061W 342 nt-1.82□□□□□ -2.7
PDR12Q02785 RPS20YHL015W 366 nt-1.83□□□□□ -2.7
PDR12Q02785 YIL066W-AYIL066W-A 444 nt-1.84□□□□□ -2.7
PDR12Q02785 AGA2YGL032C 264 nt-1.85□□□□□ -2.71
PDR12Q02785 YER084W-AYER084W-A 513 nt-1.86□□□□□ -2.71
PDR12Q02785 LOC1YFR001W 615 nt-1.86□□□□□ -2.71
PDR12Q02785 BER1YLR412W 825 nt-1.86□□□□□ -2.71
PDR12Q02785 snR5snR5 204 nt-1.87□□□□□ -2.71
PDR12Q02785 YOL106WYOL106W 354 nt-1.87□□□□□ -2.71
PDR12Q02785 IRC16YPR038W 360 nt-1.88□□□□□ -2.71
PDR12Q02785 POL32YJR043C 1053 nt-1.89□□□□□ -2.71
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 75.2 ms