Protein–RNA interactions for Protein: P53830

CUS2, Cold sensitive U2 snRNA suppressor 2, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 285 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CUS2P53830 YAL016C-BYAL016C-B 186 nt0.48□□□□□ -2.33
CUS2P53830 LOA1YPR139C 903 nt0.48□□□□□ -2.33
CUS2P53830 YAP6YDR259C 1152 nt0.47□□□□□ -2.33
CUS2P53830 YHL042WYHL042W 453 nt0.47□□□□□ -2.33
CUS2P53830 YKL202WYKL202W 582 nt0.47□□□□□ -2.33
CUS2P53830 YOL160WYOL160W 342 nt0.47□□□□□ -2.33
CUS2P53830 YOR282WYOR282W 321 nt0.47□□□□□ -2.33
CUS2P53830 YBR064WYBR064W 429 nt0.47□□□□□ -2.33
CUS2P53830 PCF11YDR228C 1881 nt0.46□□□□□ -2.34
CUS2P53830 DIE2YGR227W 1578 nt0.46□□□□□ -2.34
CUS2P53830 RAD34YDR314C 2079 nt0.46□□□□□ -2.34
CUS2P53830 ECL1YGR146C 636 nt0.46□□□□□ -2.34
CUS2P53830 YLR101CYLR101C 396 nt0.46□□□□□ -2.34
CUS2P53830 YLR171WYLR171W 390 nt0.46□□□□□ -2.34
CUS2P53830 YOR072W-AYOR072W-A 249 nt0.46□□□□□ -2.34
CUS2P53830 snR54snR54 86 nt0.46□□□□□ -2.34
CUS2P53830 YNL303WYNL303W 348 nt0.45□□□□□ -2.34
CUS2P53830 YOR108C-AYOR108C-A 210 nt0.45□□□□□ -2.34
CUS2P53830 YMR160WYMR160W 2451 nt0.45□□□□□ -2.34
CUS2P53830 MCM10YIL150C 1716 nt0.44□□□□□ -2.34
CUS2P53830 YAR047CYAR047C 321 nt0.44□□□□□ -2.34
CUS2P53830 ISF1YMR081C 1017 nt0.44□□□□□ -2.34
CUS2P53830 YMR290W-AYMR290W-A 348 nt0.43□□□□□ -2.34
CUS2P53830 YPL229WYPL229W 621 nt0.43□□□□□ -2.34
CUS2P53830 YBR206WYBR206W 324 nt0.43□□□□□ -2.34
CUS2P53830 PMP1YCR024C-A 123 nt0.42□□□□□ -2.34
CUS2P53830 MAM33YIL070C 801 nt0.42□□□□□ -2.34
CUS2P53830 INP2YMR163C 2118 nt0.42□□□□□ -2.34
CUS2P53830 YOR218CYOR218C 420 nt0.42□□□□□ -2.34
CUS2P53830 NOP9YJL010C 2001 nt0.42□□□□□ -2.34
CUS2P53830 CHS6YJL099W 2241 nt0.41□□□□□ -2.34
CUS2P53830 YER006C-AYER006C-A 318 nt0.41□□□□□ -2.34
CUS2P53830 YJR011CYJR011C 786 nt0.41□□□□□ -2.34
CUS2P53830 ATP19YOL077W-A 207 nt0.41□□□□□ -2.34
CUS2P53830 NPR2YEL062W 1848 nt0.41□□□□□ -2.34
CUS2P53830 FMP27YLR454W 7887 nt0.4□□□□□ -2.35
CUS2P53830 YFR012W-AYFR012W-A 87 nt0.4□□□□□ -2.35
CUS2P53830 RPS20YHL015W 366 nt0.4□□□□□ -2.35
CUS2P53830 YOL013W-BYOL013W-B 291 nt0.4□□□□□ -2.35
CUS2P53830 YOR029WYOR029W 336 nt0.4□□□□□ -2.35
CUS2P53830 YPL261CYPL261C 309 nt0.4□□□□□ -2.35
CUS2P53830 snR189snR189 189 nt0.4□□□□□ -2.35
CUS2P53830 OLI1Q0130 231 nt0.39□□□□□ -2.35
CUS2P53830 YNL058CYNL058C 951 nt0.39□□□□□ -2.35
CUS2P53830 YCK3YER123W 1575 nt0.38□□□□□ -2.35
CUS2P53830 RPL26BYGR034W 384 nt0.38□□□□□ -2.35
CUS2P53830 RPS24BYIL069C 408 nt0.38□□□□□ -2.35
CUS2P53830 BSC3YLR465C 309 nt0.38□□□□□ -2.35
CUS2P53830 ABF2YMR072W 552 nt0.38□□□□□ -2.35
CUS2P53830 RPS30BYOR182C 192 nt0.38□□□□□ -2.35
CUS2P53830 CUL3YGR003W 2235 nt0.38□□□□□ -2.35
CUS2P53830 YGR174W-AYGR174W-A 87 nt0.37□□□□□ -2.35
CUS2P53830 MRPL50YNR022C 420 nt0.37□□□□□ -2.35
CUS2P53830 ATG31YDR022C 591 nt0.36□□□□□ -2.35
CUS2P53830 YDR426CYDR426C 378 nt0.35□□□□□ -2.35
CUS2P53830 YIL134C-AYIL134C-A 204 nt0.35□□□□□ -2.35
CUS2P53830 YPL044CYPL044C 549 nt0.35□□□□□ -2.35
CUS2P53830 YPR002C-AYPR002C-A 198 nt0.35□□□□□ -2.35
CUS2P53830 YOR192C-BYOR192C-B 5313 nt0.35□□□□□ -2.35
CUS2P53830 YML007C-AYML007C-A 111 nt0.33□□□□□ -2.36
CUS2P53830 NIP100YPL174C 2607 nt0.32□□□□□ -2.36
CUS2P53830 YIR044CYIR044C 186 nt0.32□□□□□ -2.36
CUS2P53830 YLR434CYLR434C 384 nt0.32□□□□□ -2.36
CUS2P53830 YNL211CYNL211C 261 nt0.32□□□□□ -2.36
CUS2P53830 ASE1YOR058C 2658 nt0.32□□□□□ -2.36
CUS2P53830 STF2YGR008C 255 nt0.31□□□□□ -2.36
CUS2P53830 SGF11YPL047W 300 nt0.31□□□□□ -2.36
CUS2P53830 ULP2YIL031W 3105 nt0.3□□□□□ -2.36
CUS2P53830 SBH1YER087C-B 249 nt0.3□□□□□ -2.36
CUS2P53830 CSN9YDR179C 489 nt0.29□□□□□ -2.36
CUS2P53830 YLR456WYLR456W 615 nt0.29□□□□□ -2.36
CUS2P53830 YMR321CYMR321C 318 nt0.29□□□□□ -2.36
CUS2P53830 YOR011W-AYOR011W-A 207 nt0.29□□□□□ -2.36
CUS2P53830 PTP2YOR208W 2253 nt0.29□□□□□ -2.36
CUS2P53830 FYV10YIL097W 1551 nt0.28□□□□□ -2.36
CUS2P53830 YJL127W-AYJL127W-A 117 nt0.28□□□□□ -2.36
CUS2P53830 YPL068CYPL068C 882 nt0.28□□□□□ -2.36
CUS2P53830 PAU12YGR294W 363 nt0.27□□□□□ -2.37
CUS2P53830 ESP1YGR098C 4893 nt0.26□□□□□ -2.37
CUS2P53830 BEM3YPL115C 3387 nt0.26□□□□□ -2.37
CUS2P53830 YLR334CYLR334C 381 nt0.26□□□□□ -2.37
CUS2P53830 YLR406C-AYLR406C-A 150 nt0.26□□□□□ -2.37
CUS2P53830 SPO21YOL091W 1830 nt0.25□□□□□ -2.37
CUS2P53830 YDL185C-AYDL185C-A 228 nt0.25□□□□□ -2.37
CUS2P53830 TAR1YLR154W-C 375 nt0.25□□□□□ -2.37
CUS2P53830 HUG1YML058W-A 207 nt0.25□□□□□ -2.37
CUS2P53830 MLP1YKR095W 5628 nt0.25□□□□□ -2.37
CUS2P53830 PET111YMR257C 2403 nt0.25□□□□□ -2.37
CUS2P53830 PRP5YBR237W 2550 nt0.24□□□□□ -2.37
CUS2P53830 PCC1YKR095W-A 267 nt0.24□□□□□ -2.37
CUS2P53830 YOR053WYOR053W 342 nt0.24□□□□□ -2.37
CUS2P53830 YPL185WYPL185W 396 nt0.24□□□□□ -2.37
CUS2P53830 IQG1YPL242C 4488 nt0.23□□□□□ -2.37
CUS2P53830 YAR029WYAR029W 225 nt0.23□□□□□ -2.37
CUS2P53830 YPL225WYPL225W 441 nt0.23□□□□□ -2.37
CUS2P53830 PAA1YDR071C 576 nt0.22□□□□□ -2.37
CUS2P53830 YER137W-AYER137W-A 306 nt0.22□□□□□ -2.37
CUS2P53830 COX5BYIL111W 456 nt0.22□□□□□ -2.37
CUS2P53830 YJR157WYJR157W 363 nt0.22□□□□□ -2.37
CUS2P53830 YKL145W-AYKL145W-A 93 nt0.22□□□□□ -2.37
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 64.4 ms