Protein–RNA interactions for Protein: P35997

RPS27A, 40S ribosomal protein S27-A, yeast

Known RBP Predictions only

Length 82 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RPS27A	P35997	RSM23	YGL129C	1353 nt		-0.97	□□□□□ -2.57
RPS27A	P35997	YER158W-A	YER158W-A	216 nt		-0.98	□□□□□ -2.57
RPS27A	P35997	YMR075C-A	YMR075C-A	366 nt		-0.98	□□□□□ -2.57
RPS27A	P35997	UBS1	YBR165W	834 nt		-0.98	□□□□□ -2.57
RPS27A	P35997	YJL135W	YJL135W	318 nt		-0.99	□□□□□ -2.57
RPS27A	P35997	IPP1	YBR011C	864 nt		-0.99	□□□□□ -2.57
RPS27A	P35997	snR36	snR36	182 nt		-0.99	□□□□□ -2.57
RPS27A	P35997	SUS1	YBR111W-A	291 nt		-1	□□□□□ -2.57
RPS27A	P35997	ECL1	YGR146C	636 nt		-1.01	□□□□□ -2.57
RPS27A	P35997	YHL046W-A	YHL046W-A	327 nt		-1.01	□□□□□ -2.57
RPS27A	P35997	SEM1	YDR363W-A	270 nt		-1.02	□□□□□ -2.57
RPS27A	P35997	EMC4	YGL231C	573 nt		-1.02	□□□□□ -2.57
RPS27A	P35997	YLL006W-A	YLL006W-A	177 nt		-1.02	□□□□□ -2.57
RPS27A	P35997	YCR024C-B	YCR024C-B	267 nt		-1.03	□□□□□ -2.57
RPS27A	P35997	TIM13	YGR181W	318 nt		-1.03	□□□□□ -2.57
RPS27A	P35997	VPS63	YLR261C	327 nt		-1.03	□□□□□ -2.57
RPS27A	P35997	COX7	YMR256C	183 nt		-1.03	□□□□□ -2.57
RPS27A	P35997	LSM4	YER112W	564 nt		-1.04	□□□□□ -2.58
RPS27A	P35997	tN(GUU)Q	tN(GUU)Q	71 nt		-1.04	□□□□□ -2.58
RPS27A	P35997	tT(UGU)Q1	tT(UGU)Q1	76 nt		-1.04	□□□□□ -2.58
RPS27A	P35997	YIL071W-A	YIL071W-A	477 nt		-1.05	□□□□□ -2.58
RPS27A	P35997	PSF2	YJL072C	642 nt		-1.05	□□□□□ -2.58
RPS27A	P35997	YKL068W-A	YKL068W-A	237 nt		-1.05	□□□□□ -2.58
RPS27A	P35997	PBI2	YNL015W	228 nt		-1.05	□□□□□ -2.58
RPS27A	P35997	YNL067W-B	YNL067W-B	141 nt		-1.05	□□□□□ -2.58
RPS27A	P35997	YNL319W	YNL319W	441 nt		-1.05	□□□□□ -2.58
RPS27A	P35997	GRX5	YPL059W	453 nt		-1.05	□□□□□ -2.58
RPS27A	P35997	YCR038W-A	YCR038W-A	126 nt		-1.06	□□□□□ -2.58
RPS27A	P35997	IRC2	YDR112W	309 nt		-1.06	□□□□□ -2.58
RPS27A	P35997	YLR287C	YLR287C	1068 nt		-1.06	□□□□□ -2.58
RPS27A	P35997	RUF20	RUF20	443 nt		-1.07	□□□□□ -2.58
RPS27A	P35997	YDR269C	YDR269C	324 nt		-1.08	□□□□□ -2.58
RPS27A	P35997	YIR044C	YIR044C	186 nt		-1.08	□□□□□ -2.58
RPS27A	P35997	YJR140W-A	YJR140W-A	150 nt		-1.08	□□□□□ -2.58
RPS27A	P35997	YDL007C-A	YDL007C-A	258 nt		-1.09	□□□□□ -2.58
RPS27A	P35997	AI5_BETA	Q0075	1065 nt		-1.09	□□□□□ -2.58
RPS27A	P35997	MYO1	YHR023W	5787 nt		-1.1	□□□□□ -2.59
RPS27A	P35997	DFG10	YIL049W	762 nt		-1.1	□□□□□ -2.59
RPS27A	P35997	RPS25B	YLR333C	327 nt		-1.1	□□□□□ -2.59
RPS27A	P35997	YML007C-A	YML007C-A	111 nt		-1.1	□□□□□ -2.59
RPS27A	P35997	RPS10B	YMR230W	318 nt		-1.1	□□□□□ -2.59
RPS27A	P35997	GPX1	YKL026C	504 nt		-1.11	□□□□□ -2.59
RPS27A	P35997	YOL160W	YOL160W	342 nt		-1.11	□□□□□ -2.59
RPS27A	P35997	YBL008W-A	YBL008W-A	240 nt		-1.12	□□□□□ -2.59
RPS27A	P35997	YPL060C-A	YPL060C-A	3315 nt		-1.12	□□□□□ -2.59
RPS27A	P35997	COG6	YNL041C	2520 nt		-1.13	□□□□□ -2.59
RPS27A	P35997	YML108W	YML108W	318 nt		-1.13	□□□□□ -2.59
RPS27A	P35997	YLR171W	YLR171W	390 nt		-1.14	□□□□□ -2.59
RPS27A	P35997	YPL261C	YPL261C	309 nt		-1.14	□□□□□ -2.59
RPS27A	P35997	tA(UGC)Q	tA(UGC)Q	76 nt		-1.15	□□□□□ -2.59
RPS27A	P35997	YNL171C	YNL171C	369 nt		-1.15	□□□□□ -2.59
RPS27A	P35997	YHR054C	YHR054C	1065 nt		-1.16	□□□□□ -2.6
RPS27A	P35997	YBR099C	YBR099C	384 nt		-1.16	□□□□□ -2.6
RPS27A	P35997	YKL111C	YKL111C	336 nt		-1.17	□□□□□ -2.6
RPS27A	P35997	YHR138C	YHR138C	345 nt		-1.18	□□□□□ -2.6
RPS27A	P35997	YLR041W	YLR041W	321 nt		-1.18	□□□□□ -2.6
RPS27A	P35997	YOL106W	YOL106W	354 nt		-1.18	□□□□□ -2.6
RPS27A	P35997	POP6	YGR030C	477 nt		-1.19	□□□□□ -2.6
RPS27A	P35997	YMR307C-A	YMR307C-A	195 nt		-1.19	□□□□□ -2.6
RPS27A	P35997	EST1	YLR233C	2100 nt		-1.19	□□□□□ -2.6
RPS27A	P35997	snR59	snR59	78 nt		-1.2	□□□□□ -2.6
RPS27A	P35997	ATG31	YDR022C	591 nt		-1.2	□□□□□ -2.6
RPS27A	P35997	LIN1	YHR156C	1023 nt		-1.2	□□□□□ -2.6
RPS27A	P35997	YNR077C	YNR077C	255 nt		-1.2	□□□□□ -2.6
RPS27A	P35997	DCP1	YOL149W	696 nt		-1.2	□□□□□ -2.6
RPS27A	P35997	YOR364W	YOR364W	369 nt		-1.2	□□□□□ -2.6
RPS27A	P35997	YBR223W-A	YBR223W-A	120 nt		-1.21	□□□□□ -2.6
RPS27A	P35997	YOL029C	YOL029C	606 nt		-1.22	□□□□□ -2.6
RPS27A	P35997	YDL185C-A	YDL185C-A	228 nt		-1.23	□□□□□ -2.61
RPS27A	P35997	CWC23	YGL128C	852 nt		-1.23	□□□□□ -2.61
RPS27A	P35997	LRP1	YHR081W	555 nt		-1.24	□□□□□ -2.61
RPS27A	P35997	PCF11	YDR228C	1881 nt		-1.24	□□□□□ -2.61
RPS27A	P35997	YER079W	YER079W	633 nt		-1.26	□□□□□ -2.61
RPS27A	P35997	YGL258W-A	YGL258W-A	234 nt		-1.26	□□□□□ -2.61
RPS27A	P35997	YMR158W-B	YMR158W-B	321 nt		-1.26	□□□□□ -2.61
RPS27A	P35997	snR161	snR161	161 nt		-1.26	□□□□□ -2.61
RPS27A	P35997	YCR018C-A	YCR018C-A	255 nt		-1.27	□□□□□ -2.61
RPS27A	P35997	POL32	YJR043C	1053 nt		-1.28	□□□□□ -2.61
RPS27A	P35997	YOR366W	YOR366W	354 nt		-1.28	□□□□□ -2.61
RPS27A	P35997	IRC16	YPR038W	360 nt		-1.28	□□□□□ -2.61
RPS27A	P35997	snR72	snR72	98 nt		-1.29	□□□□□ -2.62
RPS27A	P35997	YER188C-A	YER188C-A	300 nt		-1.29	□□□□□ -2.62
RPS27A	P35997	snR57	snR57	88 nt		-1.3	□□□□□ -2.62
RPS27A	P35997	SDH7	YDR511W	402 nt		-1.3	□□□□□ -2.62
RPS27A	P35997	BLI1	YKL061W	342 nt		-1.31	□□□□□ -2.62
RPS27A	P35997	TAR1	YLR154W-C	375 nt		-1.31	□□□□□ -2.62
RPS27A	P35997	BER1	YLR412W	825 nt		-1.31	□□□□□ -2.62
RPS27A	P35997	RPS20	YHL015W	366 nt		-1.32	□□□□□ -2.62
RPS27A	P35997	RPF1	YHR088W	888 nt		-1.32	□□□□□ -2.62
RPS27A	P35997	YKL202W	YKL202W	582 nt		-1.32	□□□□□ -2.62
RPS27A	P35997	YMR304C-A	YMR304C-A	351 nt		-1.32	□□□□□ -2.62
RPS27A	P35997	ACF4	YJR083C	930 nt		-1.33	□□□□□ -2.62
RPS27A	P35997	YNL067W-A	YNL067W-A	147 nt		-1.33	□□□□□ -2.62
RPS27A	P35997	IRC13	YOR235W	315 nt		-1.33	□□□□□ -2.62
RPS27A	P35997	YPR092W	YPR092W	306 nt		-1.33	□□□□□ -2.62
RPS27A	P35997	RRI2	YOL117W	1938 nt		-1.34	□□□□□ -2.62
RPS27A	P35997	snR5	snR5	204 nt		-1.34	□□□□□ -2.62
RPS27A	P35997	YGR228W	YGR228W	345 nt		-1.34	□□□□□ -2.62
RPS27A	P35997	PAU9	YBL108C-A	129 nt		-1.35	□□□□□ -2.63
RPS27A	P35997	YJL182C	YJL182C	318 nt		-1.36	□□□□□ -2.63

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