Protein–RNA interactions for Protein: P32566

SMI1, Cell wall assembly regulator SMI1, yeastyeast

Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SMI1P32566 RPL26AYLR344W 384 nt0.81□□□□□ -2.28
SMI1P32566 PCF11YDR228C 1881 nt0.81□□□□□ -2.28
SMI1P32566 LTE1YAL024C 4308 nt0.8□□□□□ -2.28
SMI1P32566 YPL185WYPL185W 396 nt0.8□□□□□ -2.28
SMI1P32566 PTP2YOR208W 2253 nt0.79□□□□□ -2.28
SMI1P32566 IES4YOR189W 351 nt0.79□□□□□ -2.28
SMI1P32566 YLL007CYLL007C 1998 nt0.78□□□□□ -2.28
SMI1P32566 NHP2YDL208W 471 nt0.78□□□□□ -2.28
SMI1P32566 MAM33YIL070C 801 nt0.78□□□□□ -2.28
SMI1P32566 YLR456WYLR456W 615 nt0.78□□□□□ -2.28
SMI1P32566 YDR521WYDR521W 336 nt0.77□□□□□ -2.29
SMI1P32566 PAM16YJL104W 450 nt0.77□□□□□ -2.29
SMI1P32566 YML007C-AYML007C-A 111 nt0.77□□□□□ -2.29
SMI1P32566 PMP1YCR024C-A 123 nt0.76□□□□□ -2.29
SMI1P32566 YPR002C-AYPR002C-A 198 nt0.76□□□□□ -2.29
SMI1P32566 STF2YGR008C 255 nt0.75□□□□□ -2.29
SMI1P32566 YLR406C-AYLR406C-A 150 nt0.75□□□□□ -2.29
SMI1P32566 CMC4YMR194C-B 222 nt0.75□□□□□ -2.29
SMI1P32566 NOP9YJL010C 2001 nt0.75□□□□□ -2.29
SMI1P32566 YJR011CYJR011C 786 nt0.74□□□□□ -2.29
SMI1P32566 YBL008W-AYBL008W-A 240 nt0.74□□□□□ -2.29
SMI1P32566 SEC1YDR164C 2175 nt0.73□□□□□ -2.29
SMI1P32566 YHR063W-AYHR063W-A 336 nt0.73□□□□□ -2.29
SMI1P32566 tT(AGU)BtT(AGU)B 73 nt0.73□□□□□ -2.29
SMI1P32566 tT(AGU)CtT(AGU)C 73 nt0.73□□□□□ -2.29
SMI1P32566 tT(AGU)DtT(AGU)D 73 nt0.73□□□□□ -2.29
SMI1P32566 tT(AGU)HtT(AGU)H 73 nt0.73□□□□□ -2.29
SMI1P32566 tT(AGU)I1tT(AGU)I1 73 nt0.73□□□□□ -2.29
SMI1P32566 tT(AGU)I2tT(AGU)I2 73 nt0.73□□□□□ -2.29
SMI1P32566 tT(AGU)JtT(AGU)J 73 nt0.73□□□□□ -2.29
SMI1P32566 tT(AGU)N1tT(AGU)N1 73 nt0.73□□□□□ -2.29
SMI1P32566 tT(AGU)N2tT(AGU)N2 73 nt0.73□□□□□ -2.29
SMI1P32566 tT(AGU)O1tT(AGU)O1 73 nt0.73□□□□□ -2.29
SMI1P32566 tT(AGU)O2tT(AGU)O2 73 nt0.73□□□□□ -2.29
SMI1P32566 YMR272W-AYMR272W-A 114 nt0.73□□□□□ -2.29
SMI1P32566 YPR159C-AYPR159C-A 102 nt0.73□□□□□ -2.29
SMI1P32566 Q0017Q0017 162 nt0.73□□□□□ -2.29
SMI1P32566 BFR2YDR299W 1605 nt0.72□□□□□ -2.29
SMI1P32566 RKR1YMR247C 4689 nt0.72□□□□□ -2.29
SMI1P32566 YCK3YER123W 1575 nt0.71□□□□□ -2.3
SMI1P32566 YPL044CYPL044C 549 nt0.71□□□□□ -2.3
SMI1P32566 YBR064WYBR064W 429 nt0.71□□□□□ -2.3
SMI1P32566 YPL205CYPL205C 345 nt0.7□□□□□ -2.3
SMI1P32566 YLR434CYLR434C 384 nt0.69□□□□□ -2.3
SMI1P32566 HUG1YML058W-A 207 nt0.69□□□□□ -2.3
SMI1P32566 YBR206WYBR206W 324 nt0.69□□□□□ -2.3
SMI1P32566 ECM12YHR021W-A 456 nt0.68□□□□□ -2.3
SMI1P32566 PCC1YKR095W-A 267 nt0.68□□□□□ -2.3
SMI1P32566 YMR031W-AYMR031W-A 327 nt0.68□□□□□ -2.3
SMI1P32566 GEA2YEL022W 4380 nt0.67□□□□□ -2.3
SMI1P32566 IQG1YPL242C 4488 nt0.66□□□□□ -2.3
SMI1P32566 YDR426CYDR426C 378 nt0.66□□□□□ -2.3
SMI1P32566 OLI1Q0130 231 nt0.66□□□□□ -2.3
SMI1P32566 YOR072W-AYOR072W-A 249 nt0.66□□□□□ -2.3
SMI1P32566 RPS30BYOR182C 192 nt0.66□□□□□ -2.3
SMI1P32566 BEM3YPL115C 3387 nt0.65□□□□□ -2.3
SMI1P32566 YOR029WYOR029W 336 nt0.65□□□□□ -2.31
SMI1P32566 CHS6YJL099W 2241 nt0.64□□□□□ -2.31
SMI1P32566 PAA1YDR071C 576 nt0.64□□□□□ -2.31
SMI1P32566 INA22YIR024C 651 nt0.64□□□□□ -2.31
SMI1P32566 YNL324WYNL324W 396 nt0.64□□□□□ -2.31
SMI1P32566 YSP1YHR155W 3687 nt0.64□□□□□ -2.31
SMI1P32566 HMRA2YCR096C 360 nt0.63□□□□□ -2.31
SMI1P32566 YLR202CYLR202C 327 nt0.63□□□□□ -2.31
SMI1P32566 VPS20YMR077C 666 nt0.63□□□□□ -2.31
SMI1P32566 YOR218CYOR218C 420 nt0.63□□□□□ -2.31
SMI1P32566 NPR2YEL062W 1848 nt0.63□□□□□ -2.31
SMI1P32566 YMR160WYMR160W 2451 nt0.63□□□□□ -2.31
SMI1P32566 OST1YJL002C 1431 nt0.63□□□□□ -2.31
SMI1P32566 SPO21YOL091W 1830 nt0.62□□□□□ -2.31
SMI1P32566 YDR344CYDR344C 444 nt0.62□□□□□ -2.31
SMI1P32566 YOR053WYOR053W 342 nt0.62□□□□□ -2.31
SMI1P32566 MCM10YIL150C 1716 nt0.61□□□□□ -2.31
SMI1P32566 BSC3YLR465C 309 nt0.6□□□□□ -2.31
SMI1P32566 ASE1YOR058C 2658 nt0.6□□□□□ -2.31
SMI1P32566 UTP20YBL004W 7482 nt0.59□□□□□ -2.31
SMI1P32566 RPL26BYGR034W 384 nt0.59□□□□□ -2.31
SMI1P32566 YPL068CYPL068C 882 nt0.58□□□□□ -2.32
SMI1P32566 PRM3YPL192C 402 nt0.58□□□□□ -2.32
SMI1P32566 YML002WYML002W 2214 nt0.58□□□□□ -2.32
SMI1P32566 HAL9YOL089C 3093 nt0.58□□□□□ -2.32
SMI1P32566 AGA2YGL032C 264 nt0.56□□□□□ -2.32
SMI1P32566 YLR334CYLR334C 381 nt0.56□□□□□ -2.32
SMI1P32566 FYV10YIL097W 1551 nt0.55□□□□□ -2.32
SMI1P32566 SEC8YPR055W 3198 nt0.55□□□□□ -2.32
SMI1P32566 YER079WYER079W 633 nt0.54□□□□□ -2.32
SMI1P32566 YOR032W-AYOR032W-A 201 nt0.54□□□□□ -2.32
SMI1P32566 MLP1YKR095W 5628 nt0.53□□□□□ -2.32
SMI1P32566 YLR264C-AYLR264C-A 117 nt0.53□□□□□ -2.32
SMI1P32566 YBR285WYBR285W 435 nt0.53□□□□□ -2.32
SMI1P32566 UTP10YJL109C 5310 nt0.53□□□□□ -2.32
SMI1P32566 MLP2YIL149C 5040 nt0.53□□□□□ -2.32
SMI1P32566 YHL046W-AYHL046W-A 327 nt0.52□□□□□ -2.33
SMI1P32566 YJL120WYJL120W 324 nt0.52□□□□□ -2.33
SMI1P32566 YOR011W-AYOR011W-A 207 nt0.52□□□□□ -2.33
SMI1P32566 FMP27YLR454W 7887 nt0.51□□□□□ -2.33
SMI1P32566 ULP2YIL031W 3105 nt0.51□□□□□ -2.33
SMI1P32566 YLR399W-AYLR399W-A 105 nt0.51□□□□□ -2.33
SMI1P32566 YOR121CYOR121C 306 nt0.51□□□□□ -2.33
SMI1P32566 YPR160W-AYPR160W-A 81 nt0.51□□□□□ -2.33
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 28.6 ms