Protein–RNA interactions for Protein: P0CX22

YRF1-8, Y' element ATP-dependent helicase protein 1 copy 8, yeastyeast

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Length 1,796 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YRF1-8P0CX22 YER188C-AYER188C-A 300 nt-0.54□□□□□ -2.5
YRF1-8P0CX22 SDS22YKL193C 1017 nt-0.54□□□□□ -2.5
YRF1-8P0CX22 YLR163W-AYLR163W-A 114 nt-0.54□□□□□ -2.5
YRF1-8P0CX22 YMR141W-AYMR141W-A 225 nt-0.54□□□□□ -2.5
YRF1-8P0CX22 YNL146WYNL146W 303 nt-0.54□□□□□ -2.5
YRF1-8P0CX22 QCR7YDR529C 384 nt-0.55□□□□□ -2.5
YRF1-8P0CX22 YGL204CYGL204C 306 nt-0.55□□□□□ -2.5
YRF1-8P0CX22 NFU1YKL040C 771 nt-0.55□□□□□ -2.5
YRF1-8P0CX22 LRP1YHR081W 555 nt-0.55□□□□□ -2.5
YRF1-8P0CX22 YMR304C-AYMR304C-A 351 nt-0.55□□□□□ -2.5
YRF1-8P0CX22 UBS1YBR165W 834 nt-0.55□□□□□ -2.5
YRF1-8P0CX22 TIM13YGR181W 318 nt-0.56□□□□□ -2.5
YRF1-8P0CX22 YKL111CYKL111C 336 nt-0.56□□□□□ -2.5
YRF1-8P0CX22 RPS30AYLR287C-A 192 nt-0.56□□□□□ -2.5
YRF1-8P0CX22 RRI2YOL117W 1938 nt-0.57□□□□□ -2.5
YRF1-8P0CX22 tT(UGU)G1tT(UGU)G1 72 nt-0.57□□□□□ -2.5
YRF1-8P0CX22 tT(UGU)G2tT(UGU)G2 72 nt-0.57□□□□□ -2.5
YRF1-8P0CX22 tT(UGU)PtT(UGU)P 72 nt-0.57□□□□□ -2.5
YRF1-8P0CX22 YOR366WYOR366W 354 nt-0.57□□□□□ -2.5
YRF1-8P0CX22 YCR038W-AYCR038W-A 126 nt-0.57□□□□□ -2.5
YRF1-8P0CX22 YHR054CYHR054C 1065 nt-0.57□□□□□ -2.5
YRF1-8P0CX22 IRC13YOR235W 315 nt-0.57□□□□□ -2.5
YRF1-8P0CX22 YER076W-AYER076W-A 348 nt-0.58□□□□□ -2.5
YRF1-8P0CX22 PBI2YNL015W 228 nt-0.58□□□□□ -2.5
YRF1-8P0CX22 YOR248WYOR248W 303 nt-0.58□□□□□ -2.5
YRF1-8P0CX22 PAA1YDR071C 576 nt-0.59□□□□□ -2.5
YRF1-8P0CX22 LOC1YFR001W 615 nt-0.59□□□□□ -2.5
YRF1-8P0CX22 YJR141WYJR141W 1044 nt-0.59□□□□□ -2.5
YRF1-8P0CX22 YBL008W-AYBL008W-A 240 nt-0.6□□□□□ -2.5
YRF1-8P0CX22 YAP6YDR259C 1152 nt-0.6□□□□□ -2.51
YRF1-8P0CX22 YFR012W-AYFR012W-A 87 nt-0.6□□□□□ -2.51
YRF1-8P0CX22 YHR050W-AYHR050W-A 171 nt-0.6□□□□□ -2.51
YRF1-8P0CX22 ACF4YJR083C 930 nt-0.6□□□□□ -2.51
YRF1-8P0CX22 MCM10YIL150C 1716 nt-0.61□□□□□ -2.51
YRF1-8P0CX22 COY1YKL179C 2040 nt-0.61□□□□□ -2.51
YRF1-8P0CX22 snR34snR34 203 nt-0.61□□□□□ -2.51
YRF1-8P0CX22 YKL023C-AYKL023C-A 228 nt-0.62□□□□□ -2.51
YRF1-8P0CX22 YDR269CYDR269C 324 nt-0.62□□□□□ -2.51
YRF1-8P0CX22 ATG16YMR159C 453 nt-0.63□□□□□ -2.51
YRF1-8P0CX22 DCP1YOL149W 696 nt-0.63□□□□□ -2.51
YRF1-8P0CX22 VAM3YOR106W 852 nt-0.63□□□□□ -2.51
YRF1-8P0CX22 CWC23YGL128C 852 nt-0.64□□□□□ -2.51
YRF1-8P0CX22 COG6YNL041C 2520 nt-0.65□□□□□ -2.51
YRF1-8P0CX22 SNU56YDR240C 1479 nt-0.65□□□□□ -2.51
YRF1-8P0CX22 YOR364WYOR364W 369 nt-0.65□□□□□ -2.51
YRF1-8P0CX22 YNL146C-AYNL146C-A 195 nt-0.66□□□□□ -2.52
YRF1-8P0CX22 YBR223W-AYBR223W-A 120 nt-0.66□□□□□ -2.52
YRF1-8P0CX22 SEM1YDR363W-A 270 nt-0.67□□□□□ -2.52
YRF1-8P0CX22 ILM1YJR118C 612 nt-0.67□□□□□ -2.52
YRF1-8P0CX22 YPL205CYPL205C 345 nt-0.67□□□□□ -2.52
YRF1-8P0CX22 SPO21YOL091W 1830 nt-0.68□□□□□ -2.52
YRF1-8P0CX22 SRB7YDR308C 423 nt-0.68□□□□□ -2.52
YRF1-8P0CX22 YER138W-AYER138W-A 105 nt-0.69□□□□□ -2.52
YRF1-8P0CX22 YJL120WYJL120W 324 nt-0.69□□□□□ -2.52
YRF1-8P0CX22 POL32YJR043C 1053 nt-0.69□□□□□ -2.52
YRF1-8P0CX22 YLR198CYLR198C 360 nt-0.69□□□□□ -2.52
YRF1-8P0CX22 IRC16YPR038W 360 nt-0.69□□□□□ -2.52
YRF1-8P0CX22 snR33snR33 183 nt-0.69□□□□□ -2.52
YRF1-8P0CX22 YHL046W-AYHL046W-A 327 nt-0.7□□□□□ -2.52
YRF1-8P0CX22 ECL1YGR146C 636 nt-0.71□□□□□ -2.52
YRF1-8P0CX22 YLL006W-AYLL006W-A 177 nt-0.71□□□□□ -2.52
YRF1-8P0CX22 YCR022CYCR022C 345 nt-0.73□□□□□ -2.53
YRF1-8P0CX22 YKL068W-AYKL068W-A 237 nt-0.73□□□□□ -2.53
YRF1-8P0CX22 YLR171WYLR171W 390 nt-0.73□□□□□ -2.53
YRF1-8P0CX22 YPL261CYPL261C 309 nt-0.73□□□□□ -2.53
YRF1-8P0CX22 YIR044CYIR044C 186 nt-0.73□□□□□ -2.53
YRF1-8P0CX22 YKL202WYKL202W 582 nt-0.73□□□□□ -2.53
YRF1-8P0CX22 DIE2YGR227W 1578 nt-0.74□□□□□ -2.53
YRF1-8P0CX22 YPR096CYPR096C 303 nt-0.74□□□□□ -2.53
YRF1-8P0CX22 YDR220CYDR220C 294 nt-0.75□□□□□ -2.53
YRF1-8P0CX22 YOR345CYOR345C 351 nt-0.75□□□□□ -2.53
YRF1-8P0CX22 YMR013C-AYMR013C-A 150 nt-0.75□□□□□ -2.53
YRF1-8P0CX22 YGR115CYGR115C 780 nt-0.76□□□□□ -2.53
YRF1-8P0CX22 YGR270C-AYGR270C-A 219 nt-0.77□□□□□ -2.53
YRF1-8P0CX22 YHR131W-AYHR131W-A 246 nt-0.77□□□□□ -2.53
YRF1-8P0CX22 YMR307C-AYMR307C-A 195 nt-0.77□□□□□ -2.53
YRF1-8P0CX22 YNL067W-BYNL067W-B 141 nt-0.77□□□□□ -2.53
YRF1-8P0CX22 YMR075C-AYMR075C-A 366 nt-0.78□□□□□ -2.53
YRF1-8P0CX22 BUD26YDR241W 288 nt-0.78□□□□□ -2.53
YRF1-8P0CX22 YML108WYML108W 318 nt-0.78□□□□□ -2.53
YRF1-8P0CX22 YGL239CYGL239C 315 nt-0.79□□□□□ -2.54
YRF1-8P0CX22 MRPS8YMR158W 468 nt-0.79□□□□□ -2.54
YRF1-8P0CX22 YOR011W-AYOR011W-A 207 nt-0.79□□□□□ -2.54
YRF1-8P0CX22 snR51snR51 107 nt-0.79□□□□□ -2.54
YRF1-8P0CX22 IPP1YBR011C 864 nt-0.81□□□□□ -2.54
YRF1-8P0CX22 RPL22BYFL034C-A 369 nt-0.82□□□□□ -2.54
YRF1-8P0CX22 YHR138CYHR138C 345 nt-0.82□□□□□ -2.54
YRF1-8P0CX22 YDL185C-AYDL185C-A 228 nt-0.83□□□□□ -2.54
YRF1-8P0CX22 YNL319WYNL319W 441 nt-0.83□□□□□ -2.54
YRF1-8P0CX22 GRX5YPL059W 453 nt-0.83□□□□□ -2.54
YRF1-8P0CX22 YCR018C-AYCR018C-A 255 nt-0.84□□□□□ -2.54
YRF1-8P0CX22 RPS20YHL015W 366 nt-0.84□□□□□ -2.54
YRF1-8P0CX22 ATG31YDR022C 591 nt-0.85□□□□□ -2.55
YRF1-8P0CX22 YGL015CYGL015C 393 nt-0.85□□□□□ -2.55
YRF1-8P0CX22 tN(GUU)QtN(GUU)Q 71 nt-0.85□□□□□ -2.55
YRF1-8P0CX22 YBR099CYBR099C 384 nt-0.86□□□□□ -2.55
YRF1-8P0CX22 snR72snR72 98 nt-0.87□□□□□ -2.55
YRF1-8P0CX22 YIL066W-AYIL066W-A 444 nt-0.87□□□□□ -2.55
YRF1-8P0CX22 YIL071W-AYIL071W-A 477 nt-0.87□□□□□ -2.55
YRF1-8P0CX22 YLR287CYLR287C 1068 nt-0.87□□□□□ -2.55
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