Protein–RNA interactions for Protein: P0CE88

PAU1, Seripauperin-1, yeastyeast

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PAU1P0CE88 RSM23YGL129C 1353 nt-0.62□□□□□ -2.51
PAU1P0CE88 RAD34YDR314C 2079 nt-0.63□□□□□ -2.51
PAU1P0CE88 YDR269CYDR269C 324 nt-0.63□□□□□ -2.51
PAU1P0CE88 YHR050W-AYHR050W-A 171 nt-0.63□□□□□ -2.51
PAU1P0CE88 YBL008W-AYBL008W-A 240 nt-0.63□□□□□ -2.51
PAU1P0CE88 YPR170W-AYPR170W-A 186 nt-0.63□□□□□ -2.51
PAU1P0CE88 YJL007CYJL007C 315 nt-0.64□□□□□ -2.51
PAU1P0CE88 YLR399W-AYLR399W-A 105 nt-0.64□□□□□ -2.51
PAU1P0CE88 PAA1YDR071C 576 nt-0.65□□□□□ -2.51
PAU1P0CE88 YAP6YDR259C 1152 nt-0.65□□□□□ -2.51
PAU1P0CE88 POL32YJR043C 1053 nt-0.65□□□□□ -2.51
PAU1P0CE88 SNU56YDR240C 1479 nt-0.66□□□□□ -2.51
PAU1P0CE88 YDR220CYDR220C 294 nt-0.66□□□□□ -2.52
PAU1P0CE88 YPL225WYPL225W 441 nt-0.66□□□□□ -2.52
PAU1P0CE88 YBR063CYBR063C 1215 nt-0.66□□□□□ -2.52
PAU1P0CE88 HTB1YDR224C 396 nt-0.67□□□□□ -2.52
PAU1P0CE88 CWC23YGL128C 852 nt-0.67□□□□□ -2.52
PAU1P0CE88 NIP100YPL174C 2607 nt-0.68□□□□□ -2.52
PAU1P0CE88 YKL068W-AYKL068W-A 237 nt-0.68□□□□□ -2.52
PAU1P0CE88 HTB2YBL002W 396 nt-0.68□□□□□ -2.52
PAU1P0CE88 YOR248WYOR248W 303 nt-0.68□□□□□ -2.52
PAU1P0CE88 YBR076C-AYBR076C-A 267 nt-0.68□□□□□ -2.52
PAU1P0CE88 YER188C-AYER188C-A 300 nt-0.69□□□□□ -2.52
PAU1P0CE88 LOC1YFR001W 615 nt-0.69□□□□□ -2.52
PAU1P0CE88 SPO21YOL091W 1830 nt-0.69□□□□□ -2.52
PAU1P0CE88 RPL22BYFL034C-A 369 nt-0.7□□□□□ -2.52
PAU1P0CE88 YNL146C-AYNL146C-A 195 nt-0.7□□□□□ -2.52
PAU1P0CE88 tN(GUU)QtN(GUU)Q 71 nt-0.71□□□□□ -2.52
PAU1P0CE88 YMR013C-AYMR013C-A 150 nt-0.72□□□□□ -2.52
PAU1P0CE88 IRC16YPR038W 360 nt-0.72□□□□□ -2.52
PAU1P0CE88 ISF1YMR081C 1017 nt-0.73□□□□□ -2.53
PAU1P0CE88 YOL160WYOL160W 342 nt-0.73□□□□□ -2.53
PAU1P0CE88 VAM3YOR106W 852 nt-0.73□□□□□ -2.53
PAU1P0CE88 YBR206WYBR206W 324 nt-0.73□□□□□ -2.53
PAU1P0CE88 YHR131W-AYHR131W-A 246 nt-0.74□□□□□ -2.53
PAU1P0CE88 YJR141WYJR141W 1044 nt-0.74□□□□□ -2.53
PAU1P0CE88 PBI2YNL015W 228 nt-0.74□□□□□ -2.53
PAU1P0CE88 YPL205CYPL205C 345 nt-0.74□□□□□ -2.53
PAU1P0CE88 EMC4YGL231C 573 nt-0.75□□□□□ -2.53
PAU1P0CE88 YHL046W-AYHL046W-A 327 nt-0.75□□□□□ -2.53
PAU1P0CE88 YML108WYML108W 318 nt-0.75□□□□□ -2.53
PAU1P0CE88 snR72snR72 98 nt-0.76□□□□□ -2.53
PAU1P0CE88 YLR171WYLR171W 390 nt-0.76□□□□□ -2.53
PAU1P0CE88 YMR075C-AYMR075C-A 366 nt-0.76□□□□□ -2.53
PAU1P0CE88 UBS1YBR165W 834 nt-0.76□□□□□ -2.53
PAU1P0CE88 SRB7YDR308C 423 nt-0.77□□□□□ -2.53
PAU1P0CE88 DCP1YOL149W 696 nt-0.77□□□□□ -2.53
PAU1P0CE88 YIR044CYIR044C 186 nt-0.79□□□□□ -2.54
PAU1P0CE88 YLL006W-AYLL006W-A 177 nt-0.79□□□□□ -2.54
PAU1P0CE88 YPL261CYPL261C 309 nt-0.79□□□□□ -2.54
PAU1P0CE88 DIE2YGR227W 1578 nt-0.79□□□□□ -2.54
PAU1P0CE88 SEM1YDR363W-A 270 nt-0.8□□□□□ -2.54
PAU1P0CE88 ECL1YGR146C 636 nt-0.81□□□□□ -2.54
PAU1P0CE88 snR34snR34 203 nt-0.82□□□□□ -2.54
PAU1P0CE88 YGL015CYGL015C 393 nt-0.83□□□□□ -2.54
PAU1P0CE88 ILM1YJR118C 612 nt-0.83□□□□□ -2.54
PAU1P0CE88 YDL185C-AYDL185C-A 228 nt-0.84□□□□□ -2.54
PAU1P0CE88 YNL319WYNL319W 441 nt-0.84□□□□□ -2.54
PAU1P0CE88 YPR096CYPR096C 303 nt-0.84□□□□□ -2.54
PAU1P0CE88 RPM2YML091C 3609 nt-0.85□□□□□ -2.55
PAU1P0CE88 YCR022CYCR022C 345 nt-0.85□□□□□ -2.55
PAU1P0CE88 YGL239CYGL239C 315 nt-0.85□□□□□ -2.55
PAU1P0CE88 IPP1YBR011C 864 nt-0.87□□□□□ -2.55
PAU1P0CE88 PTP2YOR208W 2253 nt-0.87□□□□□ -2.55
PAU1P0CE88 YGR270C-AYGR270C-A 219 nt-0.88□□□□□ -2.55
PAU1P0CE88 UTP8YGR128C 2142 nt-0.88□□□□□ -2.55
PAU1P0CE88 YCR018C-AYCR018C-A 255 nt-0.9□□□□□ -2.55
PAU1P0CE88 YKL202WYKL202W 582 nt-0.9□□□□□ -2.55
PAU1P0CE88 YJL113WYJL113W 4647 nt-0.9□□□□□ -2.55
PAU1P0CE88 BUD26YDR241W 288 nt-0.91□□□□□ -2.56
PAU1P0CE88 snR51snR51 107 nt-0.91□□□□□ -2.56
PAU1P0CE88 YMR307C-AYMR307C-A 195 nt-0.92□□□□□ -2.56
PAU1P0CE88 YOL029CYOL029C 606 nt-0.92□□□□□ -2.56
PAU1P0CE88 YPR039WYPR039W 336 nt-0.92□□□□□ -2.56
PAU1P0CE88 YGR115CYGR115C 780 nt-0.93□□□□□ -2.56
PAU1P0CE88 tT(UGU)G1tT(UGU)G1 72 nt-0.93□□□□□ -2.56
PAU1P0CE88 tT(UGU)G2tT(UGU)G2 72 nt-0.93□□□□□ -2.56
PAU1P0CE88 tT(UGU)PtT(UGU)P 72 nt-0.93□□□□□ -2.56
PAU1P0CE88 GLG1YKR058W 1851 nt-0.94□□□□□ -2.56
PAU1P0CE88 YNL067W-BYNL067W-B 141 nt-0.94□□□□□ -2.56
PAU1P0CE88 SGF11YPL047W 300 nt-0.94□□□□□ -2.56
PAU1P0CE88 YPR092WYPR092W 306 nt-0.94□□□□□ -2.56
PAU1P0CE88 PCF11YDR228C 1881 nt-0.95□□□□□ -2.56
PAU1P0CE88 YGR228WYGR228W 345 nt-0.95□□□□□ -2.56
PAU1P0CE88 APQ13YJL075C 417 nt-0.95□□□□□ -2.56
PAU1P0CE88 snR5snR5 204 nt-0.96□□□□□ -2.56
PAU1P0CE88 SDH7YDR511W 402 nt-0.96□□□□□ -2.56
PAU1P0CE88 YER135CYER135C 393 nt-0.96□□□□□ -2.56
PAU1P0CE88 RPS20YHL015W 366 nt-0.96□□□□□ -2.56
PAU1P0CE88 YIL066W-AYIL066W-A 444 nt-0.96□□□□□ -2.56
PAU1P0CE88 BER1YLR412W 825 nt-0.96□□□□□ -2.56
PAU1P0CE88 SVS1YPL163C 783 nt-0.96□□□□□ -2.56
PAU1P0CE88 snR33snR33 183 nt-0.96□□□□□ -2.56
PAU1P0CE88 YOR011W-AYOR011W-A 207 nt-0.97□□□□□ -2.56
PAU1P0CE88 MRPL32YCR003W 552 nt-0.98□□□□□ -2.57
PAU1P0CE88 ATG31YDR022C 591 nt-0.98□□□□□ -2.57
PAU1P0CE88 YLR217WYLR217W 324 nt-0.98□□□□□ -2.57
PAU1P0CE88 YLR287CYLR287C 1068 nt-0.98□□□□□ -2.57
PAU1P0CE88 YCR001WYCR001W 315 nt-0.99□□□□□ -2.57
PAU1P0CE88 YIL071W-AYIL071W-A 477 nt-0.99□□□□□ -2.57
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 47.9 ms