Protein–RNA interactions for Protein: O54818

Tpd52l1, Tumor protein D53, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpd52l1O54818 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tpd52l1O54818 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tpd52l1O54818 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Tpd52l1O54818 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tpd52l1O54818 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tpd52l1O54818 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tpd52l1O54818 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tpd52l1O54818 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tpd52l1O54818 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tpd52l1O54818 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tpd52l1O54818 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tpd52l1O54818 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tpd52l1O54818 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tpd52l1O54818 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tpd52l1O54818 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tpd52l1O54818 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tpd52l1O54818 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tpd52l1O54818 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tpd52l1O54818 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tpd52l1O54818 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tpd52l1O54818 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Tpd52l1O54818 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tpd52l1O54818 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tpd52l1O54818 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tpd52l1O54818 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tpd52l1O54818 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tpd52l1O54818 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tpd52l1O54818 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tpd52l1O54818 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tpd52l1O54818 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tpd52l1O54818 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tpd52l1O54818 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tpd52l1O54818 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tpd52l1O54818 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tpd52l1O54818 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tpd52l1O54818 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tpd52l1O54818 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tpd52l1O54818 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tpd52l1O54818 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tpd52l1O54818 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Tpd52l1O54818 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tpd52l1O54818 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tpd52l1O54818 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Tpd52l1O54818 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tpd52l1O54818 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tpd52l1O54818 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tpd52l1O54818 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tpd52l1O54818 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tpd52l1O54818 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tpd52l1O54818 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tpd52l1O54818 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tpd52l1O54818 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tpd52l1O54818 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tpd52l1O54818 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tpd52l1O54818 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Tpd52l1O54818 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tpd52l1O54818 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tpd52l1O54818 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tpd52l1O54818 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tpd52l1O54818 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tpd52l1O54818 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tpd52l1O54818 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tpd52l1O54818 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tpd52l1O54818 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tpd52l1O54818 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tpd52l1O54818 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tpd52l1O54818 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tpd52l1O54818 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tpd52l1O54818 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tpd52l1O54818 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tpd52l1O54818 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tpd52l1O54818 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tpd52l1O54818 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tpd52l1O54818 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tpd52l1O54818 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tpd52l1O54818 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tpd52l1O54818 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tpd52l1O54818 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tpd52l1O54818 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tpd52l1O54818 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tpd52l1O54818 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tpd52l1O54818 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tpd52l1O54818 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tpd52l1O54818 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tpd52l1O54818 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tpd52l1O54818 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tpd52l1O54818 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tpd52l1O54818 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tpd52l1O54818 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Tpd52l1O54818 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tpd52l1O54818 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tpd52l1O54818 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Tpd52l1O54818 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tpd52l1O54818 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tpd52l1O54818 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tpd52l1O54818 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tpd52l1O54818 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tpd52l1O54818 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tpd52l1O54818 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tpd52l1O54818 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 137 ms