Protein–RNA interactions for Protein: B2RRD7

Brpf1, Peregrin, mousemouse

Predictions only

Length 1,212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf1B2RRD7 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Brpf1B2RRD7 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Brpf1B2RRD7 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Brpf1B2RRD7 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Brpf1B2RRD7 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Brpf1B2RRD7 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Brpf1B2RRD7 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Brpf1B2RRD7 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Brpf1B2RRD7 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Brpf1B2RRD7 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Brpf1B2RRD7 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Brpf1B2RRD7 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Brpf1B2RRD7 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Brpf1B2RRD7 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Brpf1B2RRD7 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Brpf1B2RRD7 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Brpf1B2RRD7 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Brpf1B2RRD7 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Brpf1B2RRD7 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Brpf1B2RRD7 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Brpf1B2RRD7 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Brpf1B2RRD7 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Brpf1B2RRD7 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Brpf1B2RRD7 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Brpf1B2RRD7 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Brpf1B2RRD7 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Brpf1B2RRD7 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Brpf1B2RRD7 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Brpf1B2RRD7 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Brpf1B2RRD7 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Brpf1B2RRD7 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Brpf1B2RRD7 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Brpf1B2RRD7 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Brpf1B2RRD7 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Brpf1B2RRD7 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Brpf1B2RRD7 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Brpf1B2RRD7 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Brpf1B2RRD7 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Brpf1B2RRD7 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Brpf1B2RRD7 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Brpf1B2RRD7 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Brpf1B2RRD7 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Brpf1B2RRD7 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Brpf1B2RRD7 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Brpf1B2RRD7 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Brpf1B2RRD7 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Brpf1B2RRD7 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Brpf1B2RRD7 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Brpf1B2RRD7 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Brpf1B2RRD7 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Brpf1B2RRD7 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Brpf1B2RRD7 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Brpf1B2RRD7 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Brpf1B2RRD7 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Brpf1B2RRD7 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Brpf1B2RRD7 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Brpf1B2RRD7 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Brpf1B2RRD7 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Brpf1B2RRD7 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Brpf1B2RRD7 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Brpf1B2RRD7 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Brpf1B2RRD7 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Brpf1B2RRD7 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Brpf1B2RRD7 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Brpf1B2RRD7 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Brpf1B2RRD7 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Brpf1B2RRD7 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Brpf1B2RRD7 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Brpf1B2RRD7 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Brpf1B2RRD7 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Brpf1B2RRD7 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Brpf1B2RRD7 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Brpf1B2RRD7 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Brpf1B2RRD7 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Brpf1B2RRD7 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Brpf1B2RRD7 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Brpf1B2RRD7 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Brpf1B2RRD7 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Brpf1B2RRD7 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Brpf1B2RRD7 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Brpf1B2RRD7 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Brpf1B2RRD7 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Brpf1B2RRD7 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Brpf1B2RRD7 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Brpf1B2RRD7 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Brpf1B2RRD7 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Brpf1B2RRD7 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Brpf1B2RRD7 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Brpf1B2RRD7 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Brpf1B2RRD7 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Brpf1B2RRD7 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Brpf1B2RRD7 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Brpf1B2RRD7 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Brpf1B2RRD7 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Brpf1B2RRD7 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Brpf1B2RRD7 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Brpf1B2RRD7 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Brpf1B2RRD7 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Brpf1B2RRD7 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Brpf1B2RRD7 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 113.1 ms