Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKI3

VPREB3, Pre-B lymphocyte protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB3Q9UKI3 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VPREB3Q9UKI3 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VPREB3Q9UKI3 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VPREB3Q9UKI3 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
VPREB3Q9UKI3 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
VPREB3Q9UKI3 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
VPREB3Q9UKI3 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VPREB3Q9UKI3 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VPREB3Q9UKI3 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VPREB3Q9UKI3 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VPREB3Q9UKI3 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VPREB3Q9UKI3 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VPREB3Q9UKI3 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VPREB3Q9UKI3 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
VPREB3Q9UKI3 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
VPREB3Q9UKI3 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VPREB3Q9UKI3 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
VPREB3Q9UKI3 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VPREB3Q9UKI3 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VPREB3Q9UKI3 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VPREB3Q9UKI3 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
VPREB3Q9UKI3 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VPREB3Q9UKI3 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
VPREB3Q9UKI3 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
VPREB3Q9UKI3 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
VPREB3Q9UKI3 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
VPREB3Q9UKI3 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
VPREB3Q9UKI3 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
VPREB3Q9UKI3 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
VPREB3Q9UKI3 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
VPREB3Q9UKI3 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
VPREB3Q9UKI3 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
VPREB3Q9UKI3 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VPREB3Q9UKI3 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VPREB3Q9UKI3 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VPREB3Q9UKI3 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VPREB3Q9UKI3 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VPREB3Q9UKI3 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VPREB3Q9UKI3 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
VPREB3Q9UKI3 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VPREB3Q9UKI3 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
VPREB3Q9UKI3 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
VPREB3Q9UKI3 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VPREB3Q9UKI3 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VPREB3Q9UKI3 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VPREB3Q9UKI3 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
VPREB3Q9UKI3 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VPREB3Q9UKI3 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
VPREB3Q9UKI3 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VPREB3Q9UKI3 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VPREB3Q9UKI3 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VPREB3Q9UKI3 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VPREB3Q9UKI3 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VPREB3Q9UKI3 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VPREB3Q9UKI3 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VPREB3Q9UKI3 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VPREB3Q9UKI3 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VPREB3Q9UKI3 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
VPREB3Q9UKI3 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC16■□□□□ 0.15
VPREB3Q9UKI3 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
VPREB3Q9UKI3 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VPREB3Q9UKI3 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
VPREB3Q9UKI3 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VPREB3Q9UKI3 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VPREB3Q9UKI3 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VPREB3Q9UKI3 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
VPREB3Q9UKI3 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
VPREB3Q9UKI3 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
VPREB3Q9UKI3 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VPREB3Q9UKI3 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VPREB3Q9UKI3 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
VPREB3Q9UKI3 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
VPREB3Q9UKI3 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
VPREB3Q9UKI3 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
VPREB3Q9UKI3 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC16■□□□□ 0.15
VPREB3Q9UKI3 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VPREB3Q9UKI3 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VPREB3Q9UKI3 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VPREB3Q9UKI3 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VPREB3Q9UKI3 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VPREB3Q9UKI3 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VPREB3Q9UKI3 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VPREB3Q9UKI3 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VPREB3Q9UKI3 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VPREB3Q9UKI3 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VPREB3Q9UKI3 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VPREB3Q9UKI3 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VPREB3Q9UKI3 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VPREB3Q9UKI3 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VPREB3Q9UKI3 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VPREB3Q9UKI3 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VPREB3Q9UKI3 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VPREB3Q9UKI3 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
VPREB3Q9UKI3 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VPREB3Q9UKI3 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VPREB3Q9UKI3 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
VPREB3Q9UKI3 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VPREB3Q9UKI3 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VPREB3Q9UKI3 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VPREB3Q9UKI3 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.3 ms