Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA80

Rsph3b, Radial spoke head protein 3 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph3bQ9DA80 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rsph3bQ9DA80 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rsph3bQ9DA80 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rsph3bQ9DA80 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rsph3bQ9DA80 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Rsph3bQ9DA80 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rsph3bQ9DA80 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rsph3bQ9DA80 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rsph3bQ9DA80 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rsph3bQ9DA80 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rsph3bQ9DA80 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rsph3bQ9DA80 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Rsph3bQ9DA80 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rsph3bQ9DA80 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rsph3bQ9DA80 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rsph3bQ9DA80 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rsph3bQ9DA80 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rsph3bQ9DA80 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rsph3bQ9DA80 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rsph3bQ9DA80 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rsph3bQ9DA80 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Rsph3bQ9DA80 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rsph3bQ9DA80 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rsph3bQ9DA80 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rsph3bQ9DA80 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rsph3bQ9DA80 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rsph3bQ9DA80 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rsph3bQ9DA80 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rsph3bQ9DA80 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rsph3bQ9DA80 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rsph3bQ9DA80 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rsph3bQ9DA80 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rsph3bQ9DA80 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rsph3bQ9DA80 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rsph3bQ9DA80 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rsph3bQ9DA80 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rsph3bQ9DA80 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rsph3bQ9DA80 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rsph3bQ9DA80 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rsph3bQ9DA80 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rsph3bQ9DA80 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rsph3bQ9DA80 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rsph3bQ9DA80 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rsph3bQ9DA80 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Rsph3bQ9DA80 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rsph3bQ9DA80 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rsph3bQ9DA80 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rsph3bQ9DA80 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rsph3bQ9DA80 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rsph3bQ9DA80 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rsph3bQ9DA80 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rsph3bQ9DA80 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rsph3bQ9DA80 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rsph3bQ9DA80 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rsph3bQ9DA80 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rsph3bQ9DA80 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rsph3bQ9DA80 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rsph3bQ9DA80 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rsph3bQ9DA80 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rsph3bQ9DA80 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rsph3bQ9DA80 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rsph3bQ9DA80 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rsph3bQ9DA80 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rsph3bQ9DA80 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rsph3bQ9DA80 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rsph3bQ9DA80 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rsph3bQ9DA80 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rsph3bQ9DA80 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rsph3bQ9DA80 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rsph3bQ9DA80 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rsph3bQ9DA80 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rsph3bQ9DA80 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rsph3bQ9DA80 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rsph3bQ9DA80 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rsph3bQ9DA80 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rsph3bQ9DA80 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rsph3bQ9DA80 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rsph3bQ9DA80 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rsph3bQ9DA80 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rsph3bQ9DA80 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rsph3bQ9DA80 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rsph3bQ9DA80 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rsph3bQ9DA80 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rsph3bQ9DA80 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rsph3bQ9DA80 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rsph3bQ9DA80 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rsph3bQ9DA80 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rsph3bQ9DA80 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rsph3bQ9DA80 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rsph3bQ9DA80 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rsph3bQ9DA80 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rsph3bQ9DA80 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rsph3bQ9DA80 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rsph3bQ9DA80 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rsph3bQ9DA80 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rsph3bQ9DA80 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rsph3bQ9DA80 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rsph3bQ9DA80 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rsph3bQ9DA80 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rsph3bQ9DA80 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.5 ms