Protein–RNA interactions for Protein: E9Q035

Gm20425, Predicted gene 20425, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 978 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20425E9Q035 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm20425E9Q035 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm20425E9Q035 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm20425E9Q035 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm20425E9Q035 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm20425E9Q035 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm20425E9Q035 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm20425E9Q035 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm20425E9Q035 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm20425E9Q035 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm20425E9Q035 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm20425E9Q035 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm20425E9Q035 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm20425E9Q035 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm20425E9Q035 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm20425E9Q035 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm20425E9Q035 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm20425E9Q035 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm20425E9Q035 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm20425E9Q035 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm20425E9Q035 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm20425E9Q035 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm20425E9Q035 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm20425E9Q035 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm20425E9Q035 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm20425E9Q035 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm20425E9Q035 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm20425E9Q035 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm20425E9Q035 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm20425E9Q035 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm20425E9Q035 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm20425E9Q035 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm20425E9Q035 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm20425E9Q035 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm20425E9Q035 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm20425E9Q035 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm20425E9Q035 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm20425E9Q035 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm20425E9Q035 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm20425E9Q035 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm20425E9Q035 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm20425E9Q035 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm20425E9Q035 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm20425E9Q035 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm20425E9Q035 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm20425E9Q035 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm20425E9Q035 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm20425E9Q035 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm20425E9Q035 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm20425E9Q035 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm20425E9Q035 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm20425E9Q035 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm20425E9Q035 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm20425E9Q035 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm20425E9Q035 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm20425E9Q035 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm20425E9Q035 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm20425E9Q035 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm20425E9Q035 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm20425E9Q035 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm20425E9Q035 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm20425E9Q035 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm20425E9Q035 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm20425E9Q035 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm20425E9Q035 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm20425E9Q035 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm20425E9Q035 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm20425E9Q035 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm20425E9Q035 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm20425E9Q035 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm20425E9Q035 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm20425E9Q035 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm20425E9Q035 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm20425E9Q035 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm20425E9Q035 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm20425E9Q035 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm20425E9Q035 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm20425E9Q035 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm20425E9Q035 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm20425E9Q035 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm20425E9Q035 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm20425E9Q035 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm20425E9Q035 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm20425E9Q035 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm20425E9Q035 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm20425E9Q035 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm20425E9Q035 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm20425E9Q035 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm20425E9Q035 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm20425E9Q035 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm20425E9Q035 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm20425E9Q035 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
Gm20425E9Q035 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm20425E9Q035 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm20425E9Q035 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm20425E9Q035 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm20425E9Q035 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm20425E9Q035 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm20425E9Q035 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm20425E9Q035 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms