Protein–RNA interactions for Protein: Q9D816

Cyp2c55, Cytochrome P450 2C55, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp2c55Q9D816 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Cyp2c55Q9D816 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Cyp2c55Q9D816 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cyp2c55Q9D816 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cyp2c55Q9D816 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Cyp2c55Q9D816 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cyp2c55Q9D816 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cyp2c55Q9D816 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cyp2c55Q9D816 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cyp2c55Q9D816 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cyp2c55Q9D816 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cyp2c55Q9D816 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cyp2c55Q9D816 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cyp2c55Q9D816 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cyp2c55Q9D816 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cyp2c55Q9D816 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Cyp2c55Q9D816 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cyp2c55Q9D816 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cyp2c55Q9D816 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cyp2c55Q9D816 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cyp2c55Q9D816 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cyp2c55Q9D816 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cyp2c55Q9D816 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cyp2c55Q9D816 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cyp2c55Q9D816 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cyp2c55Q9D816 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cyp2c55Q9D816 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cyp2c55Q9D816 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cyp2c55Q9D816 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cyp2c55Q9D816 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cyp2c55Q9D816 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Cyp2c55Q9D816 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Cyp2c55Q9D816 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Cyp2c55Q9D816 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cyp2c55Q9D816 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cyp2c55Q9D816 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cyp2c55Q9D816 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Cyp2c55Q9D816 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cyp2c55Q9D816 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cyp2c55Q9D816 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cyp2c55Q9D816 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cyp2c55Q9D816 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cyp2c55Q9D816 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cyp2c55Q9D816 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cyp2c55Q9D816 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cyp2c55Q9D816 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Cyp2c55Q9D816 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cyp2c55Q9D816 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cyp2c55Q9D816 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cyp2c55Q9D816 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cyp2c55Q9D816 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cyp2c55Q9D816 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cyp2c55Q9D816 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cyp2c55Q9D816 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cyp2c55Q9D816 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cyp2c55Q9D816 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Cyp2c55Q9D816 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cyp2c55Q9D816 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cyp2c55Q9D816 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cyp2c55Q9D816 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cyp2c55Q9D816 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cyp2c55Q9D816 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cyp2c55Q9D816 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cyp2c55Q9D816 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cyp2c55Q9D816 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cyp2c55Q9D816 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cyp2c55Q9D816 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cyp2c55Q9D816 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cyp2c55Q9D816 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cyp2c55Q9D816 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cyp2c55Q9D816 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cyp2c55Q9D816 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cyp2c55Q9D816 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cyp2c55Q9D816 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cyp2c55Q9D816 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cyp2c55Q9D816 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cyp2c55Q9D816 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cyp2c55Q9D816 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cyp2c55Q9D816 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cyp2c55Q9D816 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cyp2c55Q9D816 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cyp2c55Q9D816 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cyp2c55Q9D816 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cyp2c55Q9D816 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cyp2c55Q9D816 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cyp2c55Q9D816 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cyp2c55Q9D816 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cyp2c55Q9D816 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cyp2c55Q9D816 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cyp2c55Q9D816 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cyp2c55Q9D816 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cyp2c55Q9D816 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cyp2c55Q9D816 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cyp2c55Q9D816 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Cyp2c55Q9D816 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cyp2c55Q9D816 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cyp2c55Q9D816 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Cyp2c55Q9D816 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cyp2c55Q9D816 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cyp2c55Q9D816 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms