Protein–RNA interactions for Protein: P46020

PHKA1, Phosphorylase b kinase regulatory subunit alpha, skeletal muscle isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHKA1P46020 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PHKA1P46020 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PHKA1P46020 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PHKA1P46020 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PHKA1P46020 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PHKA1P46020 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PHKA1P46020 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PHKA1P46020 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PHKA1P46020 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PHKA1P46020 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PHKA1P46020 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PHKA1P46020 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PHKA1P46020 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PHKA1P46020 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PHKA1P46020 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PHKA1P46020 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PHKA1P46020 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PHKA1P46020 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PHKA1P46020 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
PHKA1P46020 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PHKA1P46020 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PHKA1P46020 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
PHKA1P46020 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
PHKA1P46020 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PHKA1P46020 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PHKA1P46020 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PHKA1P46020 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PHKA1P46020 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PHKA1P46020 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PHKA1P46020 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PHKA1P46020 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PHKA1P46020 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PHKA1P46020 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PHKA1P46020 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PHKA1P46020 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PHKA1P46020 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PHKA1P46020 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PHKA1P46020 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PHKA1P46020 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PHKA1P46020 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PHKA1P46020 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PHKA1P46020 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PHKA1P46020 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PHKA1P46020 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PHKA1P46020 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PHKA1P46020 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PHKA1P46020 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PHKA1P46020 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PHKA1P46020 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PHKA1P46020 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PHKA1P46020 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PHKA1P46020 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PHKA1P46020 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PHKA1P46020 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PHKA1P46020 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PHKA1P46020 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PHKA1P46020 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PHKA1P46020 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PHKA1P46020 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PHKA1P46020 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PHKA1P46020 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PHKA1P46020 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PHKA1P46020 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PHKA1P46020 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PHKA1P46020 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PHKA1P46020 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
PHKA1P46020 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PHKA1P46020 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PHKA1P46020 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PHKA1P46020 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PHKA1P46020 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PHKA1P46020 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PHKA1P46020 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PHKA1P46020 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PHKA1P46020 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PHKA1P46020 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PHKA1P46020 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PHKA1P46020 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PHKA1P46020 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PHKA1P46020 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
PHKA1P46020 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PHKA1P46020 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PHKA1P46020 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PHKA1P46020 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PHKA1P46020 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PHKA1P46020 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PHKA1P46020 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PHKA1P46020 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PHKA1P46020 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PHKA1P46020 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PHKA1P46020 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PHKA1P46020 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PHKA1P46020 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PHKA1P46020 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
PHKA1P46020 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PHKA1P46020 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
PHKA1P46020 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PHKA1P46020 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PHKA1P46020 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PHKA1P46020 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118.4 ms