Protein–RNA interactions for Protein: P19783

Cox4i1, Cytochrome c oxidase subunit 4 isoform 1, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cox4i1P19783 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Cox4i1P19783 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cox4i1P19783 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cox4i1P19783 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cox4i1P19783 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cox4i1P19783 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cox4i1P19783 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Cox4i1P19783 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cox4i1P19783 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cox4i1P19783 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cox4i1P19783 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cox4i1P19783 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cox4i1P19783 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cox4i1P19783 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cox4i1P19783 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cox4i1P19783 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cox4i1P19783 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cox4i1P19783 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cox4i1P19783 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cox4i1P19783 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cox4i1P19783 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cox4i1P19783 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cox4i1P19783 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cox4i1P19783 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cox4i1P19783 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cox4i1P19783 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cox4i1P19783 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cox4i1P19783 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cox4i1P19783 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cox4i1P19783 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cox4i1P19783 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cox4i1P19783 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cox4i1P19783 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cox4i1P19783 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cox4i1P19783 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cox4i1P19783 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cox4i1P19783 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cox4i1P19783 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cox4i1P19783 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cox4i1P19783 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cox4i1P19783 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cox4i1P19783 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cox4i1P19783 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cox4i1P19783 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cox4i1P19783 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cox4i1P19783 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cox4i1P19783 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cox4i1P19783 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cox4i1P19783 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cox4i1P19783 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cox4i1P19783 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cox4i1P19783 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cox4i1P19783 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cox4i1P19783 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cox4i1P19783 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cox4i1P19783 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cox4i1P19783 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cox4i1P19783 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cox4i1P19783 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cox4i1P19783 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cox4i1P19783 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cox4i1P19783 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cox4i1P19783 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cox4i1P19783 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cox4i1P19783 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cox4i1P19783 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cox4i1P19783 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cox4i1P19783 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cox4i1P19783 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cox4i1P19783 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cox4i1P19783 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cox4i1P19783 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cox4i1P19783 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cox4i1P19783 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cox4i1P19783 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cox4i1P19783 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cox4i1P19783 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cox4i1P19783 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cox4i1P19783 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cox4i1P19783 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cox4i1P19783 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Cox4i1P19783 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cox4i1P19783 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cox4i1P19783 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cox4i1P19783 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cox4i1P19783 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cox4i1P19783 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cox4i1P19783 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Cox4i1P19783 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cox4i1P19783 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cox4i1P19783 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cox4i1P19783 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cox4i1P19783 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cox4i1P19783 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cox4i1P19783 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cox4i1P19783 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cox4i1P19783 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cox4i1P19783 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cox4i1P19783 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cox4i1P19783 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms