Protein–RNA interactions for Protein: J3QMK2

Bbip1, BBSome-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 67 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bbip1J3QMK2 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Bbip1J3QMK2 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Bbip1J3QMK2 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Bbip1J3QMK2 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Bbip1J3QMK2 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Bbip1J3QMK2 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Bbip1J3QMK2 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Bbip1J3QMK2 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Bbip1J3QMK2 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Bbip1J3QMK2 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Bbip1J3QMK2 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Bbip1J3QMK2 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Bbip1J3QMK2 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Bbip1J3QMK2 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Bbip1J3QMK2 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Bbip1J3QMK2 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Bbip1J3QMK2 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Bbip1J3QMK2 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Bbip1J3QMK2 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Bbip1J3QMK2 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Bbip1J3QMK2 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Bbip1J3QMK2 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Bbip1J3QMK2 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Bbip1J3QMK2 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Bbip1J3QMK2 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Bbip1J3QMK2 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Bbip1J3QMK2 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Bbip1J3QMK2 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Bbip1J3QMK2 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Bbip1J3QMK2 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Bbip1J3QMK2 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Bbip1J3QMK2 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Bbip1J3QMK2 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Bbip1J3QMK2 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Bbip1J3QMK2 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Bbip1J3QMK2 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Bbip1J3QMK2 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Bbip1J3QMK2 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Bbip1J3QMK2 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Bbip1J3QMK2 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Bbip1J3QMK2 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Bbip1J3QMK2 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Bbip1J3QMK2 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Bbip1J3QMK2 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Bbip1J3QMK2 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Bbip1J3QMK2 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Bbip1J3QMK2 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Bbip1J3QMK2 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Bbip1J3QMK2 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Bbip1J3QMK2 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Bbip1J3QMK2 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Bbip1J3QMK2 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Bbip1J3QMK2 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Bbip1J3QMK2 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Bbip1J3QMK2 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Bbip1J3QMK2 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Bbip1J3QMK2 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Bbip1J3QMK2 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Bbip1J3QMK2 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Bbip1J3QMK2 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Bbip1J3QMK2 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Bbip1J3QMK2 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Bbip1J3QMK2 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Bbip1J3QMK2 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Bbip1J3QMK2 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Bbip1J3QMK2 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Bbip1J3QMK2 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Bbip1J3QMK2 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Bbip1J3QMK2 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Bbip1J3QMK2 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Bbip1J3QMK2 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Bbip1J3QMK2 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Bbip1J3QMK2 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Bbip1J3QMK2 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Bbip1J3QMK2 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Bbip1J3QMK2 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Bbip1J3QMK2 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Bbip1J3QMK2 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Bbip1J3QMK2 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Bbip1J3QMK2 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Bbip1J3QMK2 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Bbip1J3QMK2 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Bbip1J3QMK2 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Bbip1J3QMK2 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Bbip1J3QMK2 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Bbip1J3QMK2 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Bbip1J3QMK2 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Bbip1J3QMK2 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Bbip1J3QMK2 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Bbip1J3QMK2 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Bbip1J3QMK2 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Bbip1J3QMK2 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Bbip1J3QMK2 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Bbip1J3QMK2 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Bbip1J3QMK2 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Bbip1J3QMK2 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Bbip1J3QMK2 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Bbip1J3QMK2 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Bbip1J3QMK2 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Bbip1J3QMK2 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.8 ms