Protein–RNA interactions for Protein: Q3UAW9

Brf2, Transcription factor IIIB 50 kDa subunit, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brf2Q3UAW9 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Brf2Q3UAW9 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Brf2Q3UAW9 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Brf2Q3UAW9 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Brf2Q3UAW9 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Brf2Q3UAW9 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Brf2Q3UAW9 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Brf2Q3UAW9 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Brf2Q3UAW9 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Brf2Q3UAW9 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Brf2Q3UAW9 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Brf2Q3UAW9 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Brf2Q3UAW9 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Brf2Q3UAW9 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Brf2Q3UAW9 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Brf2Q3UAW9 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Brf2Q3UAW9 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Brf2Q3UAW9 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Brf2Q3UAW9 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Brf2Q3UAW9 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Brf2Q3UAW9 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Brf2Q3UAW9 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Brf2Q3UAW9 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Brf2Q3UAW9 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Brf2Q3UAW9 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Brf2Q3UAW9 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Brf2Q3UAW9 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Brf2Q3UAW9 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Brf2Q3UAW9 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Brf2Q3UAW9 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Brf2Q3UAW9 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Brf2Q3UAW9 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Brf2Q3UAW9 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Brf2Q3UAW9 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Brf2Q3UAW9 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Brf2Q3UAW9 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Brf2Q3UAW9 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Brf2Q3UAW9 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Brf2Q3UAW9 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Brf2Q3UAW9 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Brf2Q3UAW9 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Brf2Q3UAW9 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Brf2Q3UAW9 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Brf2Q3UAW9 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Brf2Q3UAW9 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Brf2Q3UAW9 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Brf2Q3UAW9 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Brf2Q3UAW9 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Brf2Q3UAW9 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Brf2Q3UAW9 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Brf2Q3UAW9 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Brf2Q3UAW9 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Brf2Q3UAW9 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Brf2Q3UAW9 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Brf2Q3UAW9 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Brf2Q3UAW9 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Brf2Q3UAW9 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Brf2Q3UAW9 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Brf2Q3UAW9 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Brf2Q3UAW9 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Brf2Q3UAW9 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Brf2Q3UAW9 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Brf2Q3UAW9 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Brf2Q3UAW9 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Brf2Q3UAW9 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Brf2Q3UAW9 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Brf2Q3UAW9 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Brf2Q3UAW9 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Brf2Q3UAW9 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Brf2Q3UAW9 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Brf2Q3UAW9 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Brf2Q3UAW9 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Brf2Q3UAW9 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Brf2Q3UAW9 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Brf2Q3UAW9 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Brf2Q3UAW9 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Brf2Q3UAW9 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Brf2Q3UAW9 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Brf2Q3UAW9 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Brf2Q3UAW9 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Brf2Q3UAW9 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Brf2Q3UAW9 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Brf2Q3UAW9 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Brf2Q3UAW9 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Brf2Q3UAW9 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Brf2Q3UAW9 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Brf2Q3UAW9 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Brf2Q3UAW9 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Brf2Q3UAW9 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Brf2Q3UAW9 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Brf2Q3UAW9 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Brf2Q3UAW9 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Brf2Q3UAW9 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Brf2Q3UAW9 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Brf2Q3UAW9 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Brf2Q3UAW9 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Brf2Q3UAW9 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Brf2Q3UAW9 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Brf2Q3UAW9 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Brf2Q3UAW9 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms