Protein–RNA interactions for Protein: Q3TLI0

Trappc10, Trafficking protein particle complex subunit 10, mousemouse

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc10Q3TLI0 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Trappc10Q3TLI0 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Trappc10Q3TLI0 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Trappc10Q3TLI0 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Trappc10Q3TLI0 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Trappc10Q3TLI0 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Trappc10Q3TLI0 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Trappc10Q3TLI0 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Trappc10Q3TLI0 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Trappc10Q3TLI0 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Trappc10Q3TLI0 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Trappc10Q3TLI0 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Trappc10Q3TLI0 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Trappc10Q3TLI0 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Trappc10Q3TLI0 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Trappc10Q3TLI0 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Trappc10Q3TLI0 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Trappc10Q3TLI0 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Trappc10Q3TLI0 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Trappc10Q3TLI0 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Trappc10Q3TLI0 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Trappc10Q3TLI0 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Trappc10Q3TLI0 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Trappc10Q3TLI0 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Trappc10Q3TLI0 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Trappc10Q3TLI0 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Trappc10Q3TLI0 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Trappc10Q3TLI0 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Trappc10Q3TLI0 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Trappc10Q3TLI0 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Trappc10Q3TLI0 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Trappc10Q3TLI0 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Trappc10Q3TLI0 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Trappc10Q3TLI0 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Trappc10Q3TLI0 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Trappc10Q3TLI0 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Trappc10Q3TLI0 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Trappc10Q3TLI0 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Trappc10Q3TLI0 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Trappc10Q3TLI0 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Trappc10Q3TLI0 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Trappc10Q3TLI0 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Trappc10Q3TLI0 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Trappc10Q3TLI0 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Trappc10Q3TLI0 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Trappc10Q3TLI0 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Trappc10Q3TLI0 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Trappc10Q3TLI0 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Trappc10Q3TLI0 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Trappc10Q3TLI0 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Trappc10Q3TLI0 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Trappc10Q3TLI0 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Trappc10Q3TLI0 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Trappc10Q3TLI0 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Trappc10Q3TLI0 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Trappc10Q3TLI0 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Trappc10Q3TLI0 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Trappc10Q3TLI0 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Trappc10Q3TLI0 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Trappc10Q3TLI0 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Trappc10Q3TLI0 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Trappc10Q3TLI0 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Trappc10Q3TLI0 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Trappc10Q3TLI0 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Trappc10Q3TLI0 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Trappc10Q3TLI0 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Trappc10Q3TLI0 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Trappc10Q3TLI0 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Trappc10Q3TLI0 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Trappc10Q3TLI0 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Trappc10Q3TLI0 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Trappc10Q3TLI0 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Trappc10Q3TLI0 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Trappc10Q3TLI0 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Trappc10Q3TLI0 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Trappc10Q3TLI0 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Trappc10Q3TLI0 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Trappc10Q3TLI0 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Trappc10Q3TLI0 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Trappc10Q3TLI0 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Trappc10Q3TLI0 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Trappc10Q3TLI0 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Trappc10Q3TLI0 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Trappc10Q3TLI0 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Trappc10Q3TLI0 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Trappc10Q3TLI0 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Trappc10Q3TLI0 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Trappc10Q3TLI0 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Trappc10Q3TLI0 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Trappc10Q3TLI0 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Trappc10Q3TLI0 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Trappc10Q3TLI0 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Trappc10Q3TLI0 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Trappc10Q3TLI0 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Trappc10Q3TLI0 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Trappc10Q3TLI0 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Trappc10Q3TLI0 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Trappc10Q3TLI0 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Trappc10Q3TLI0 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Trappc10Q3TLI0 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.8 ms