Protein–RNA interactions for Protein: Q05A13

Sdr16c6, Short-chain dehydrogenase/reductase family 16C member 6, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdr16c6Q05A13 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sdr16c6Q05A13 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sdr16c6Q05A13 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sdr16c6Q05A13 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sdr16c6Q05A13 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sdr16c6Q05A13 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sdr16c6Q05A13 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sdr16c6Q05A13 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sdr16c6Q05A13 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sdr16c6Q05A13 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sdr16c6Q05A13 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sdr16c6Q05A13 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sdr16c6Q05A13 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sdr16c6Q05A13 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sdr16c6Q05A13 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sdr16c6Q05A13 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sdr16c6Q05A13 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sdr16c6Q05A13 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sdr16c6Q05A13 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sdr16c6Q05A13 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sdr16c6Q05A13 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sdr16c6Q05A13 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Sdr16c6Q05A13 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Sdr16c6Q05A13 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sdr16c6Q05A13 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sdr16c6Q05A13 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sdr16c6Q05A13 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sdr16c6Q05A13 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sdr16c6Q05A13 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sdr16c6Q05A13 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sdr16c6Q05A13 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sdr16c6Q05A13 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sdr16c6Q05A13 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sdr16c6Q05A13 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sdr16c6Q05A13 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Sdr16c6Q05A13 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sdr16c6Q05A13 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sdr16c6Q05A13 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sdr16c6Q05A13 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sdr16c6Q05A13 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sdr16c6Q05A13 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sdr16c6Q05A13 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sdr16c6Q05A13 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sdr16c6Q05A13 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sdr16c6Q05A13 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sdr16c6Q05A13 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sdr16c6Q05A13 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sdr16c6Q05A13 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sdr16c6Q05A13 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sdr16c6Q05A13 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sdr16c6Q05A13 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sdr16c6Q05A13 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sdr16c6Q05A13 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sdr16c6Q05A13 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sdr16c6Q05A13 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sdr16c6Q05A13 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Sdr16c6Q05A13 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Sdr16c6Q05A13 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Sdr16c6Q05A13 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Sdr16c6Q05A13 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sdr16c6Q05A13 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sdr16c6Q05A13 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sdr16c6Q05A13 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sdr16c6Q05A13 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sdr16c6Q05A13 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sdr16c6Q05A13 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sdr16c6Q05A13 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sdr16c6Q05A13 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sdr16c6Q05A13 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sdr16c6Q05A13 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sdr16c6Q05A13 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sdr16c6Q05A13 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sdr16c6Q05A13 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sdr16c6Q05A13 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sdr16c6Q05A13 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sdr16c6Q05A13 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sdr16c6Q05A13 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sdr16c6Q05A13 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sdr16c6Q05A13 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sdr16c6Q05A13 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sdr16c6Q05A13 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sdr16c6Q05A13 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sdr16c6Q05A13 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sdr16c6Q05A13 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Sdr16c6Q05A13 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Sdr16c6Q05A13 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sdr16c6Q05A13 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sdr16c6Q05A13 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sdr16c6Q05A13 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sdr16c6Q05A13 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Sdr16c6Q05A13 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sdr16c6Q05A13 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sdr16c6Q05A13 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Sdr16c6Q05A13 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sdr16c6Q05A13 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sdr16c6Q05A13 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sdr16c6Q05A13 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sdr16c6Q05A13 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sdr16c6Q05A13 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sdr16c6Q05A13 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 146.4 ms