Protein–RNA interactions for Protein: P28741

Kif3a, Kinesin-like protein KIF3A, mousemouse

Predictions only

Length 701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif3aP28741 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Kif3aP28741 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Kif3aP28741 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Kif3aP28741 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Kif3aP28741 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Kif3aP28741 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Kif3aP28741 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Kif3aP28741 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Kif3aP28741 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Kif3aP28741 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Kif3aP28741 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Kif3aP28741 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Kif3aP28741 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Kif3aP28741 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Kif3aP28741 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Kif3aP28741 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Kif3aP28741 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Kif3aP28741 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Kif3aP28741 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Kif3aP28741 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Kif3aP28741 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Kif3aP28741 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Kif3aP28741 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Kif3aP28741 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Kif3aP28741 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Kif3aP28741 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Kif3aP28741 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Kif3aP28741 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Kif3aP28741 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Kif3aP28741 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Kif3aP28741 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Kif3aP28741 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Kif3aP28741 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Kif3aP28741 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Kif3aP28741 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Kif3aP28741 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Kif3aP28741 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Kif3aP28741 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Kif3aP28741 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Kif3aP28741 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Kif3aP28741 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Kif3aP28741 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Kif3aP28741 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Kif3aP28741 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Kif3aP28741 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Kif3aP28741 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Kif3aP28741 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Kif3aP28741 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Kif3aP28741 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Kif3aP28741 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Kif3aP28741 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Kif3aP28741 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Kif3aP28741 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Kif3aP28741 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Kif3aP28741 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Kif3aP28741 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Kif3aP28741 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Kif3aP28741 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Kif3aP28741 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Kif3aP28741 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Kif3aP28741 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Kif3aP28741 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Kif3aP28741 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Kif3aP28741 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Kif3aP28741 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Kif3aP28741 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Kif3aP28741 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Kif3aP28741 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Kif3aP28741 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Kif3aP28741 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Kif3aP28741 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Kif3aP28741 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Kif3aP28741 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Kif3aP28741 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Kif3aP28741 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Kif3aP28741 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Kif3aP28741 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Kif3aP28741 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Kif3aP28741 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Kif3aP28741 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Kif3aP28741 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Kif3aP28741 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Kif3aP28741 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Kif3aP28741 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Kif3aP28741 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Kif3aP28741 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Kif3aP28741 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Kif3aP28741 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Kif3aP28741 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Kif3aP28741 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Kif3aP28741 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Kif3aP28741 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Kif3aP28741 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Kif3aP28741 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Kif3aP28741 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Kif3aP28741 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Kif3aP28741 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Kif3aP28741 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Kif3aP28741 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Kif3aP28741 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms