Protein–RNA interactions for Protein: O35955

Psmb10, Proteasome subunit beta type-10, mousemouse

Predictions only

Length 273 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb10O35955 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Psmb10O35955 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Psmb10O35955 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Psmb10O35955 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Psmb10O35955 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Psmb10O35955 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Psmb10O35955 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Psmb10O35955 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Psmb10O35955 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Psmb10O35955 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Psmb10O35955 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Psmb10O35955 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Psmb10O35955 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Psmb10O35955 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Psmb10O35955 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Psmb10O35955 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Psmb10O35955 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Psmb10O35955 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Psmb10O35955 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Psmb10O35955 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Psmb10O35955 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Psmb10O35955 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Psmb10O35955 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Psmb10O35955 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Psmb10O35955 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Psmb10O35955 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Psmb10O35955 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Psmb10O35955 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Psmb10O35955 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Psmb10O35955 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Psmb10O35955 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Psmb10O35955 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Psmb10O35955 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Psmb10O35955 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Psmb10O35955 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Psmb10O35955 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Psmb10O35955 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Psmb10O35955 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Psmb10O35955 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Psmb10O35955 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Psmb10O35955 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Psmb10O35955 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Psmb10O35955 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Psmb10O35955 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Psmb10O35955 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Psmb10O35955 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Psmb10O35955 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Psmb10O35955 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Psmb10O35955 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Psmb10O35955 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Psmb10O35955 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Psmb10O35955 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Psmb10O35955 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Psmb10O35955 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Psmb10O35955 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Psmb10O35955 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Psmb10O35955 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Psmb10O35955 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Psmb10O35955 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Psmb10O35955 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Psmb10O35955 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Psmb10O35955 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Psmb10O35955 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Psmb10O35955 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Psmb10O35955 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Psmb10O35955 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Psmb10O35955 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Psmb10O35955 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Psmb10O35955 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Psmb10O35955 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Psmb10O35955 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Psmb10O35955 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Psmb10O35955 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Psmb10O35955 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Psmb10O35955 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Psmb10O35955 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Psmb10O35955 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Psmb10O35955 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Psmb10O35955 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Psmb10O35955 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Psmb10O35955 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Psmb10O35955 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Psmb10O35955 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Psmb10O35955 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Psmb10O35955 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Psmb10O35955 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Psmb10O35955 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Psmb10O35955 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Psmb10O35955 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Psmb10O35955 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Psmb10O35955 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Psmb10O35955 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Psmb10O35955 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Psmb10O35955 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Psmb10O35955 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Psmb10O35955 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Psmb10O35955 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Psmb10O35955 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Psmb10O35955 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Psmb10O35955 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 132.8 ms