Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Q2

Knop1, Lysine-rich nucleolar protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Knop1Q9Z2Q2 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Knop1Q9Z2Q2 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Knop1Q9Z2Q2 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Knop1Q9Z2Q2 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Knop1Q9Z2Q2 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Knop1Q9Z2Q2 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Knop1Q9Z2Q2 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Knop1Q9Z2Q2 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Knop1Q9Z2Q2 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Knop1Q9Z2Q2 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Knop1Q9Z2Q2 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Knop1Q9Z2Q2 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Knop1Q9Z2Q2 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Knop1Q9Z2Q2 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Knop1Q9Z2Q2 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Knop1Q9Z2Q2 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Knop1Q9Z2Q2 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Knop1Q9Z2Q2 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Knop1Q9Z2Q2 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Knop1Q9Z2Q2 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Knop1Q9Z2Q2 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Knop1Q9Z2Q2 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Knop1Q9Z2Q2 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Knop1Q9Z2Q2 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Knop1Q9Z2Q2 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Knop1Q9Z2Q2 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Knop1Q9Z2Q2 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Knop1Q9Z2Q2 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Knop1Q9Z2Q2 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Knop1Q9Z2Q2 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Knop1Q9Z2Q2 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Knop1Q9Z2Q2 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Knop1Q9Z2Q2 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Knop1Q9Z2Q2 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Knop1Q9Z2Q2 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Knop1Q9Z2Q2 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Knop1Q9Z2Q2 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Knop1Q9Z2Q2 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Knop1Q9Z2Q2 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Knop1Q9Z2Q2 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Knop1Q9Z2Q2 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Knop1Q9Z2Q2 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Knop1Q9Z2Q2 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Knop1Q9Z2Q2 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Knop1Q9Z2Q2 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Knop1Q9Z2Q2 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Knop1Q9Z2Q2 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Knop1Q9Z2Q2 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Knop1Q9Z2Q2 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Knop1Q9Z2Q2 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Knop1Q9Z2Q2 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Knop1Q9Z2Q2 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Knop1Q9Z2Q2 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Knop1Q9Z2Q2 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Knop1Q9Z2Q2 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Knop1Q9Z2Q2 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Knop1Q9Z2Q2 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Knop1Q9Z2Q2 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Knop1Q9Z2Q2 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Knop1Q9Z2Q2 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Knop1Q9Z2Q2 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Knop1Q9Z2Q2 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Knop1Q9Z2Q2 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Knop1Q9Z2Q2 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Knop1Q9Z2Q2 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Knop1Q9Z2Q2 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Knop1Q9Z2Q2 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Knop1Q9Z2Q2 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Knop1Q9Z2Q2 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Knop1Q9Z2Q2 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Knop1Q9Z2Q2 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Knop1Q9Z2Q2 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Knop1Q9Z2Q2 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Knop1Q9Z2Q2 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Knop1Q9Z2Q2 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Knop1Q9Z2Q2 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Knop1Q9Z2Q2 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Knop1Q9Z2Q2 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Knop1Q9Z2Q2 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Knop1Q9Z2Q2 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Knop1Q9Z2Q2 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Knop1Q9Z2Q2 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Knop1Q9Z2Q2 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Knop1Q9Z2Q2 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Knop1Q9Z2Q2 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Knop1Q9Z2Q2 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Knop1Q9Z2Q2 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Knop1Q9Z2Q2 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Knop1Q9Z2Q2 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Knop1Q9Z2Q2 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Knop1Q9Z2Q2 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Knop1Q9Z2Q2 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Knop1Q9Z2Q2 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Knop1Q9Z2Q2 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Knop1Q9Z2Q2 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Knop1Q9Z2Q2 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Knop1Q9Z2Q2 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Knop1Q9Z2Q2 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Knop1Q9Z2Q2 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Knop1Q9Z2Q2 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms