Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1D1

Tspan11, Tetraspanin-11, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan11Q9D1D1 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tspan11Q9D1D1 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tspan11Q9D1D1 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Tspan11Q9D1D1 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tspan11Q9D1D1 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tspan11Q9D1D1 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tspan11Q9D1D1 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tspan11Q9D1D1 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tspan11Q9D1D1 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tspan11Q9D1D1 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tspan11Q9D1D1 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tspan11Q9D1D1 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tspan11Q9D1D1 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tspan11Q9D1D1 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tspan11Q9D1D1 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tspan11Q9D1D1 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Tspan11Q9D1D1 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tspan11Q9D1D1 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tspan11Q9D1D1 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tspan11Q9D1D1 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tspan11Q9D1D1 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tspan11Q9D1D1 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tspan11Q9D1D1 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tspan11Q9D1D1 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tspan11Q9D1D1 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tspan11Q9D1D1 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tspan11Q9D1D1 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tspan11Q9D1D1 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tspan11Q9D1D1 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tspan11Q9D1D1 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tspan11Q9D1D1 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tspan11Q9D1D1 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tspan11Q9D1D1 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tspan11Q9D1D1 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tspan11Q9D1D1 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Tspan11Q9D1D1 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tspan11Q9D1D1 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tspan11Q9D1D1 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tspan11Q9D1D1 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tspan11Q9D1D1 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Tspan11Q9D1D1 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tspan11Q9D1D1 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tspan11Q9D1D1 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tspan11Q9D1D1 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tspan11Q9D1D1 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tspan11Q9D1D1 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tspan11Q9D1D1 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tspan11Q9D1D1 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tspan11Q9D1D1 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Tspan11Q9D1D1 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tspan11Q9D1D1 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tspan11Q9D1D1 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tspan11Q9D1D1 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tspan11Q9D1D1 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tspan11Q9D1D1 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tspan11Q9D1D1 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tspan11Q9D1D1 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tspan11Q9D1D1 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tspan11Q9D1D1 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tspan11Q9D1D1 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tspan11Q9D1D1 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Tspan11Q9D1D1 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tspan11Q9D1D1 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Tspan11Q9D1D1 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Tspan11Q9D1D1 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tspan11Q9D1D1 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tspan11Q9D1D1 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tspan11Q9D1D1 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tspan11Q9D1D1 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Tspan11Q9D1D1 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Tspan11Q9D1D1 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Tspan11Q9D1D1 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tspan11Q9D1D1 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tspan11Q9D1D1 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tspan11Q9D1D1 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tspan11Q9D1D1 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tspan11Q9D1D1 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tspan11Q9D1D1 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tspan11Q9D1D1 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tspan11Q9D1D1 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tspan11Q9D1D1 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tspan11Q9D1D1 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Tspan11Q9D1D1 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Tspan11Q9D1D1 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tspan11Q9D1D1 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tspan11Q9D1D1 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tspan11Q9D1D1 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tspan11Q9D1D1 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tspan11Q9D1D1 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tspan11Q9D1D1 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tspan11Q9D1D1 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tspan11Q9D1D1 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tspan11Q9D1D1 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tspan11Q9D1D1 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Tspan11Q9D1D1 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tspan11Q9D1D1 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tspan11Q9D1D1 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tspan11Q9D1D1 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tspan11Q9D1D1 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tspan11Q9D1D1 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 134.6 ms