Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHP6

Lrrn2, Leucine rich repeat protein 2, neuronal, isoform CRA_b, mousemouse

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Length 730 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrn2Q6PHP6 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Lrrn2Q6PHP6 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Lrrn2Q6PHP6 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Lrrn2Q6PHP6 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Lrrn2Q6PHP6 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Lrrn2Q6PHP6 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Lrrn2Q6PHP6 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Lrrn2Q6PHP6 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Lrrn2Q6PHP6 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Lrrn2Q6PHP6 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Lrrn2Q6PHP6 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Lrrn2Q6PHP6 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Lrrn2Q6PHP6 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Lrrn2Q6PHP6 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Lrrn2Q6PHP6 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Lrrn2Q6PHP6 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Lrrn2Q6PHP6 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Lrrn2Q6PHP6 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Lrrn2Q6PHP6 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Lrrn2Q6PHP6 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Lrrn2Q6PHP6 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Lrrn2Q6PHP6 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Lrrn2Q6PHP6 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Lrrn2Q6PHP6 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Lrrn2Q6PHP6 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Lrrn2Q6PHP6 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Lrrn2Q6PHP6 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Lrrn2Q6PHP6 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Lrrn2Q6PHP6 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Lrrn2Q6PHP6 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Lrrn2Q6PHP6 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Lrrn2Q6PHP6 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Lrrn2Q6PHP6 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Lrrn2Q6PHP6 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Lrrn2Q6PHP6 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Lrrn2Q6PHP6 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Lrrn2Q6PHP6 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Lrrn2Q6PHP6 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Lrrn2Q6PHP6 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Lrrn2Q6PHP6 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Lrrn2Q6PHP6 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Lrrn2Q6PHP6 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Lrrn2Q6PHP6 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Lrrn2Q6PHP6 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Lrrn2Q6PHP6 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Lrrn2Q6PHP6 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Lrrn2Q6PHP6 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Lrrn2Q6PHP6 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Lrrn2Q6PHP6 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Lrrn2Q6PHP6 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Lrrn2Q6PHP6 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Lrrn2Q6PHP6 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Lrrn2Q6PHP6 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Lrrn2Q6PHP6 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Lrrn2Q6PHP6 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Lrrn2Q6PHP6 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Lrrn2Q6PHP6 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Lrrn2Q6PHP6 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Lrrn2Q6PHP6 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Lrrn2Q6PHP6 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Lrrn2Q6PHP6 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Lrrn2Q6PHP6 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Lrrn2Q6PHP6 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Lrrn2Q6PHP6 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Lrrn2Q6PHP6 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Lrrn2Q6PHP6 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Lrrn2Q6PHP6 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Lrrn2Q6PHP6 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Lrrn2Q6PHP6 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Lrrn2Q6PHP6 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Lrrn2Q6PHP6 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lrrn2Q6PHP6 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lrrn2Q6PHP6 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lrrn2Q6PHP6 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lrrn2Q6PHP6 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lrrn2Q6PHP6 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lrrn2Q6PHP6 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lrrn2Q6PHP6 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lrrn2Q6PHP6 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lrrn2Q6PHP6 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lrrn2Q6PHP6 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lrrn2Q6PHP6 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lrrn2Q6PHP6 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lrrn2Q6PHP6 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lrrn2Q6PHP6 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lrrn2Q6PHP6 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lrrn2Q6PHP6 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lrrn2Q6PHP6 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lrrn2Q6PHP6 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lrrn2Q6PHP6 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lrrn2Q6PHP6 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lrrn2Q6PHP6 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lrrn2Q6PHP6 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lrrn2Q6PHP6 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lrrn2Q6PHP6 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Lrrn2Q6PHP6 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lrrn2Q6PHP6 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lrrn2Q6PHP6 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lrrn2Q6PHP6 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lrrn2Q6PHP6 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms