Protein–RNA interactions for Protein: Q15572

TAF1C, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 869 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1CQ15572 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TAF1CQ15572 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TAF1CQ15572 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TAF1CQ15572 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TAF1CQ15572 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
TAF1CQ15572 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TAF1CQ15572 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TAF1CQ15572 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TAF1CQ15572 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TAF1CQ15572 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TAF1CQ15572 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TAF1CQ15572 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TAF1CQ15572 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TAF1CQ15572 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TAF1CQ15572 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TAF1CQ15572 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TAF1CQ15572 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
TAF1CQ15572 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TAF1CQ15572 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TAF1CQ15572 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TAF1CQ15572 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TAF1CQ15572 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TAF1CQ15572 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TAF1CQ15572 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TAF1CQ15572 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
TAF1CQ15572 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TAF1CQ15572 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TAF1CQ15572 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TAF1CQ15572 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TAF1CQ15572 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
TAF1CQ15572 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TAF1CQ15572 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TAF1CQ15572 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TAF1CQ15572 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TAF1CQ15572 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TAF1CQ15572 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TAF1CQ15572 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TAF1CQ15572 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TAF1CQ15572 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TAF1CQ15572 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TAF1CQ15572 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
TAF1CQ15572 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TAF1CQ15572 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TAF1CQ15572 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TAF1CQ15572 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TAF1CQ15572 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TAF1CQ15572 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TAF1CQ15572 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TAF1CQ15572 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TAF1CQ15572 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TAF1CQ15572 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TAF1CQ15572 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TAF1CQ15572 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TAF1CQ15572 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TAF1CQ15572 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TAF1CQ15572 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TAF1CQ15572 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TAF1CQ15572 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TAF1CQ15572 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TAF1CQ15572 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TAF1CQ15572 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TAF1CQ15572 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TAF1CQ15572 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TAF1CQ15572 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TAF1CQ15572 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TAF1CQ15572 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TAF1CQ15572 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TAF1CQ15572 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TAF1CQ15572 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TAF1CQ15572 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TAF1CQ15572 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TAF1CQ15572 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TAF1CQ15572 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TAF1CQ15572 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TAF1CQ15572 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TAF1CQ15572 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TAF1CQ15572 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TAF1CQ15572 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TAF1CQ15572 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TAF1CQ15572 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TAF1CQ15572 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TAF1CQ15572 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TAF1CQ15572 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TAF1CQ15572 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TAF1CQ15572 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TAF1CQ15572 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TAF1CQ15572 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TAF1CQ15572 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TAF1CQ15572 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TAF1CQ15572 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TAF1CQ15572 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TAF1CQ15572 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TAF1CQ15572 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TAF1CQ15572 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TAF1CQ15572 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TAF1CQ15572 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TAF1CQ15572 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TAF1CQ15572 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TAF1CQ15572 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TAF1CQ15572 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
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