Protein–RNA interactions for Protein: P97452

Bop1, Ribosome biogenesis protein BOP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bop1P97452 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Bop1P97452 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Bop1P97452 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Bop1P97452 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Bop1P97452 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Bop1P97452 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Bop1P97452 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Bop1P97452 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Bop1P97452 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Bop1P97452 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Bop1P97452 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Bop1P97452 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Bop1P97452 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Bop1P97452 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Bop1P97452 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Bop1P97452 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Bop1P97452 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Bop1P97452 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Bop1P97452 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Bop1P97452 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Bop1P97452 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Bop1P97452 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Bop1P97452 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Bop1P97452 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Bop1P97452 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Bop1P97452 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Bop1P97452 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Bop1P97452 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Bop1P97452 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Bop1P97452 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Bop1P97452 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Bop1P97452 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Bop1P97452 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Bop1P97452 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Bop1P97452 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Bop1P97452 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Bop1P97452 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Bop1P97452 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Bop1P97452 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Bop1P97452 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Bop1P97452 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Bop1P97452 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Bop1P97452 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Bop1P97452 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Bop1P97452 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Bop1P97452 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Bop1P97452 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Bop1P97452 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Bop1P97452 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Bop1P97452 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Bop1P97452 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Bop1P97452 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Bop1P97452 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Bop1P97452 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Bop1P97452 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Bop1P97452 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Bop1P97452 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Bop1P97452 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Bop1P97452 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Bop1P97452 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Bop1P97452 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Bop1P97452 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Bop1P97452 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Bop1P97452 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Bop1P97452 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Bop1P97452 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Bop1P97452 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Bop1P97452 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Bop1P97452 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Bop1P97452 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Bop1P97452 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Bop1P97452 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Bop1P97452 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Bop1P97452 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Bop1P97452 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Bop1P97452 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Bop1P97452 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Bop1P97452 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Bop1P97452 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Bop1P97452 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Bop1P97452 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Bop1P97452 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Bop1P97452 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Bop1P97452 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Bop1P97452 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Bop1P97452 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Bop1P97452 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Bop1P97452 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Bop1P97452 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Bop1P97452 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Bop1P97452 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Bop1P97452 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Bop1P97452 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Bop1P97452 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Bop1P97452 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Bop1P97452 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Bop1P97452 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Bop1P97452 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Bop1P97452 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Bop1P97452 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.2 ms