Protein–RNA interactions for Protein: E9Q035

Gm20425, Predicted gene 20425, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 978 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20425E9Q035 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm20425E9Q035 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm20425E9Q035 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm20425E9Q035 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm20425E9Q035 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm20425E9Q035 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm20425E9Q035 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm20425E9Q035 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm20425E9Q035 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm20425E9Q035 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm20425E9Q035 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm20425E9Q035 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm20425E9Q035 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm20425E9Q035 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm20425E9Q035 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm20425E9Q035 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm20425E9Q035 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm20425E9Q035 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm20425E9Q035 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm20425E9Q035 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm20425E9Q035 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm20425E9Q035 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm20425E9Q035 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm20425E9Q035 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm20425E9Q035 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm20425E9Q035 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm20425E9Q035 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm20425E9Q035 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm20425E9Q035 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm20425E9Q035 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm20425E9Q035 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm20425E9Q035 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm20425E9Q035 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm20425E9Q035 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm20425E9Q035 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm20425E9Q035 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm20425E9Q035 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm20425E9Q035 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm20425E9Q035 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm20425E9Q035 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm20425E9Q035 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm20425E9Q035 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm20425E9Q035 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm20425E9Q035 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm20425E9Q035 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm20425E9Q035 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm20425E9Q035 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm20425E9Q035 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm20425E9Q035 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm20425E9Q035 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm20425E9Q035 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm20425E9Q035 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm20425E9Q035 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm20425E9Q035 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm20425E9Q035 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm20425E9Q035 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm20425E9Q035 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm20425E9Q035 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm20425E9Q035 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm20425E9Q035 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm20425E9Q035 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm20425E9Q035 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm20425E9Q035 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm20425E9Q035 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm20425E9Q035 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm20425E9Q035 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm20425E9Q035 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm20425E9Q035 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm20425E9Q035 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm20425E9Q035 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm20425E9Q035 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm20425E9Q035 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm20425E9Q035 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm20425E9Q035 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm20425E9Q035 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm20425E9Q035 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm20425E9Q035 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm20425E9Q035 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm20425E9Q035 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm20425E9Q035 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm20425E9Q035 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm20425E9Q035 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm20425E9Q035 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm20425E9Q035 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm20425E9Q035 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm20425E9Q035 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm20425E9Q035 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm20425E9Q035 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm20425E9Q035 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm20425E9Q035 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm20425E9Q035 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm20425E9Q035 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm20425E9Q035 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm20425E9Q035 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm20425E9Q035 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm20425E9Q035 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm20425E9Q035 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm20425E9Q035 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm20425E9Q035 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm20425E9Q035 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms